Select neighbours (check boxes) for viewing as multiple structural alignment or 3D superimposition.
The list of neighbours is sorted by Z-score. Similarities with a Z-score lower than 2 are spurious.
Each neighbour has links to pairwise structural alignment with the query structure,
and to the PDB format coordinate file where the neighbour
is superimposed onto the query structure.
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Summary
No: Chain Z rmsd lali nres %id PDB Description
1
: 1v77-A 42.2 0.0 202 202 100 PDB MOLECULE: HYPOTHETICAL PROTEIN PH1877;
2
DSSP LLLEEEEELLHHHHHHHHHHLLEEEEEEEELLLLLHHHHHHHHHHHLLEEEEEELLLHHH Query VKFIEMDIRDKEAYELAKEWFDEVVVSIKFNEEVDKEKLREARKEYGKVAILLSNPKPSL 60 ident |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct VKFIEMDIRDKEAYELAKEWFDEVVVSIKFNEEVDKEKLREARKEYGKVAILLSNPKPSL 60 DSSP LLLEEEEELLHHHHHHHHHHLLEEEEEEEELLLLLHHHHHHHHHHHLLEEEEEELLLHHH DSSP HHHHHHHLLLLEEEEELLLHHHHHHHHHLLLLEEELLLLLLLLLLLLHHHHHHHHHHLLE Query VRDTVQKFKSYLIYVESNDLRVIRYSIEKGVDAIISPWVNRKDPGIDHVLAKLMVKKNVA 120 ident |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct VRDTVQKFKSYLIYVESNDLRVIRYSIEKGVDAIISPWVNRKDPGIDHVLAKLMVKKNVA 120 DSSP HHHHHHHLLLLEEEEELLLHHHHHHHHHLLLLEEELLLLLLLLLLLLHHHHHHHHHHLLE DSSP EEEELHHHHHLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLEEEELLLLLHHHLLLHHHHHHHHH Query LGFSLRPLLYSNPYERANLLRFMMKAWKLVEKYKVRRFLTSSAQEKWDVRYPRDLISLGV 180 ident |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct LGFSLRPLLYSNPYERANLLRFMMKAWKLVEKYKVRRFLTSSAQEKWDVRYPRDLISLGV 180 DSSP EEEELHHHHHLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLEEEELLLLLHHHLLLHHHHHHHHH DSSP HLLLLHHHHHHLLLHHHHHHHL Query VIGMEIPQAKASISMYPEIILK 202 ident |||||||||||||||||||||| Sbjct VIGMEIPQAKASISMYPEIILK 202 DSSP HLLLLHHHHHHLLLHHHHHHHL
DSSP ---------------------------------------------------------LLL Query ---------------------------------------------------------VKF 3 ident Sbjct aeikavsaarlldvasgkyvdnplvivtdgritsigkkgdavpagatavdlpgvtllPGL 60 DSSP lleeeeeeeeeeelllleeeeleeeeeelleeeeeeellllllllleeeeeeeeeeeELE DSSP EEEEELLHH-----------------------HHHHHHHH-LLEEEEEE----------- Query IEMDIRDKE-----------------------AYELAKEW-FDEVVVSI----------- 28 ident | | | | | Sbjct IDMHVHLDSlaevggynsleysdrfwsvvqtaNAKKTLEAgFTTVRNVGaadyddvglre 120 DSSP EEEEELLLLlllllhhhhhhllhhhhhhhhhhHHHHHHHLlEEEEEELLllllhhhhhhh DSSP -----------------EELL-----------------------------lLLHHHHHHH Query -----------------KFNE-----------------------------eVDKEKLREA 42 ident | Sbjct aidagyvpgprivtaaiSFGAtgghcdstffppsmdqknpfnsdspdearkAVRTLKKYG 180 DSSP hhhllllllleeeelllLEELlllllllllllhhhllllllllllhhhhhhHHHHHHHLL DSSP HhhhllEEEEEEL---------------LLHHHHHHHHHHLL--LLEEEEELLLHHHHHH Query RkeygkVAILLSN---------------PKPSLVRDTVQKFK--SYLIYVESNDLRVIRY 85 ident | | || Sbjct A-----QVIXICAtggvfsrgnepgqqqLTYEEMKAVVDEAHmaGIKVAAHAHGASGIRE 235 DSSP L-----LEEEEELlllllllllllllllLLHHHHHHHHHHHHhlLLEEEEEELLHHHHHH DSSP HHHLLLLEEELLLllllllLLLHHHHHHHHHHLLEEEEE-LHHHHHL-----------LH Query SIEKGVDAIISPWvnrkdpGIDHVLAKLMVKKNVALGFS-LRPLLYS-----------NP 133 ident ||| | | || | | | Sbjct AVRAGVDTIEHAS------LVDDEGIKLAVQKGAYFSMDiYNTDYTQaegkkngvledNL 289 DSSP HHHLLLLEEEELL------LLLHHHHHHHHHHLLEEELLlLLHHHHHhhhhhhlllhhHH DSSP HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLEEEELLLLLhHHLLLHhHHHHHHHHLLLLHHHHHHLL Query YERANLLRFMMKAWKLVEKYKVRRFLTSSAQEkWDVRYPrDLISLGVVIGMEIPQAKASI 193 ident | | | | | || | Sbjct RKDRDIGELQRENFRKALKAGVKMVYGTDAGIyPHGDNA-KQFAVMVRYGATPLQAIQSA 348 DSSP HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLEEELLLLLLLlLLLLHH-HHHHHHHHLLLLHHHHHHHL DSSP LHHHHHHHL----------------------------------------------- Query SMYPEIILK----------------------------------------------- 202 ident | Sbjct TLTAAEALGrskdvgqvavgrygdmiavagdpladvttlekpvfvmkggavvkapx 404 DSSP LHHHHHHHLllllllllllllllleeeelllllllhhhhhllleeeelleeeelll
DSSP --------------------------------------------------------LLLE Query --------------------------------------------------------VKFI 4 ident | Sbjct lttflfrngalldpdhpdllqgfeiliedgfirevsdkpikssnahvidvkgktimPGLI 60 DSSP lleeeeeeeeelllllllleeeeeeeeelleeeeeellllllllleeeelllleeeELEE DSSP EEEELLH----------------------hHHHHHHHH-LLEEEEEE------------- Query EMDIRDK----------------------eAYELAKEW-FDEVVVSI------------- 28 ident | | Sbjct DLHVHVVaiefnlprvatlpnvlvtlravpIMRAMLRRgFTTVRDAGgagypfkqavesg 120 DSSP EEEELLLlllllhhhhllllhhhhhhhhhhHHHHHHHLlEEEEEELLlllhhhhhhhhll DSSP ------------EELL----------------------------------------lLLH Query ------------KFNE----------------------------------------eVDK 36 ident Sbjct lvegprlfvsgrALSQtgghadprarsdymppdspcgccvrvgalgrvadgvdevrrAVR 180 DSSP llllleeeelllEEELllllllllllllllllllllllllllllleeelllhhhhhhHHH DSSP HHHHHHHhhhllEEEEEEL--------------LLHH-HHHHHHHHLL--LLEEEEELLL Query EKLREARkeygkVAILLSN--------------PKPS-LVRDTVQKFK--SYLIYVESND 79 ident | | | | | Sbjct EELQMGA-----DQIXIMAsggvasptdpvgvfGYSEdEIRAIVAEAQgrGTYVLAHAYT 235 DSSP HHHHHLL-----LLEEEELllllllllllllllLLLHhHHHHHHHHHHllLLLEEEEELL DSSP HHHHHHHHHLLLLEEELLLllllllLLLHHHHHHHHHHLLEEEEE-LHHHHHL------- Query LRVIRYSIEKGVDAIISPWvnrkdpGIDHVLAKLMVKKNVALGFS-LRPLLYS------- 131 ident | || | || | | Sbjct PAAIARAVRCGVRTIEHGN------LIDDETARLVAEHGAYVVPTlVTYDALAsegekyg 289 DSSP HHHHHHHHHLLLLEEEELL------LLLHHHHHHHHHHLLEEELLhHHHHHHHhhlllll DSSP ----LHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLEEEELLLLL--HHHLLlhhHHHHHHHHlLLL Query ----NPYERANLLRFMMKAWKLVEKYKVRRFLTSSAQE--KWDVRyprDLISLGVViGME 185 ident | | | Sbjct lppeSIAKIADVHGAGLHSIEIMKRAGVKMGFGTDLLGeaQRLQS---DEFRILAE-VLS 345 DSSP llhhHHLLHHHHHLLHHHHHHHHHHHLLLLLLLLLLLHhhHHHLL---HHHHHHHL-LLL DSSP HHHHHHLLLHHHHHHHL------------------------------------------- Query IPQAKASISMYPEIILK------------------------------------------- 202 ident || | Sbjct PAEVIASATIVSAEVLGmqdklgrivpgahadvlvvdgnplksvdcllgqgehiplvmkd 405 DSSP HHHHHHHLLHHHHHHLLllllllllllllllleeeellllllllllllllllllleeeel DSSP --------- Query --------- 202 ident Sbjct grlfvnele 414 DSSP leeeeelll
DSSP ------------------------------------------------------------ Query ------------------------------------------------------------ 0 ident Sbjct deakvtiiyagllipgdgeplrnaalvisdkiiafvgseadipkkylrstqsthrvpvlm 60 DSSP lllleeeeeeeeellllllleeeeeeeeelleeeeeeehhhllhhhhhhllleeeeeeee DSSP LLLEEEEELLHH-------------------------HHHHHHHH-LLEEEEEE------ Query VKFIEMDIRDKE-------------------------AYELAKEW-FDEVVVSI------ 28 ident | Sbjct PGLWDCHMHFGGdddyyndytsglathpassgarlarGCWEALQNgYTSYRDLAgygcev 120 DSSP ELEEEEEELLLLllllllllhhhhhllhhhhhhhhhhHHHHHHHLlEEEEEELLllhhhh DSSP -------------------EELL------------------------------------- Query -------------------KFNE------------------------------------- 32 ident Sbjct akaindgtivgpnvyssgaALSQtaghgdifalpagevlgsygvmnprpgywgagplcia 180 DSSP hhhhhllllllleeeelllEEELlllllllllllhhhhhhhhlllllllllllllleeel DSSP -------lLLHHHHHHHHhhhllEEEEEEL---------------LLHHHHHHHHHHLL- Query -------eVDKEKLREARkeygkVAILLSN---------------PKPSLVRDTVQKFK- 69 ident | | | | Sbjct dgveevrrAVRLQIRRGA-----KVIXVMAsggvmsrddnpnfaqFSPEELKVIVEEAAr 235 DSSP llhhhhhhHHHHHHHHLL-----LLEEEELlllllllllllllllLLHHHHHHHHHHHHh DSSP -LLEEEEELLLHHHHHHHHHLLLLEEELLLllllllLLLHHHHHHHHHHLLEEEEE-LHH Query -SYLIYVESNDLRVIRYSIEKGVDAIISPWvnrkdpGIDHVLAKLMVKKNVALGFS-LRP 127 ident | | | | || | Sbjct qNRIVSAHVHGKAGIMAAIKAGCKSLEHVS------YADEEVWELMKEKGILYVATrSVI 289 DSSP lLLLEEEEELLHHHHHHHHHHLLLEEEELL------LLLHHHHHHHHHHLLEEELLhHHH DSSP HHHLL---------HHHHHH-HHHHHHHHHHHHHHHLLLEEEELLLLLHhhLLLHhHHHH Query LLYSN---------PYERAN-LLRFMMKAWKLVEKYKVRRFLTSSAQEKwdVRYPrDLIS 177 ident | || | | | Sbjct EIFLAsngeglvkeSWAKLQaLADSHLKAYQGAIKAGVTIALGTDTAPG--GPTA-LELQ 346 DSSP HHHHHhllllllllHHHLLLhHHHHHHHHHHHHHHLLLLEELLLLLLLL--LLLH-HHHH DSSP HHHHL-LLLHHHHHHLLLHHHHHHHL---------------------------------- Query LGVVI-GMEIPQAKASISMYPEIILK---------------------------------- 202 ident | || | Sbjct FAVERgGMTPLEAIKAATANAPLSVGpqapltgqlregyeadvialeenpledikvfqep 406 DSSP HHHHLlLLLHHHHHHHHLLLHHHHHHhhlllllllllllllleeeelllllllhhhhhlh DSSP ------------------------------ Query ------------------------------ 202 ident Sbjct kavthvwkggklfkgpgigpwgedarnpfl 436 DSSP hheeeeeelleeeellllllllllllllll
DSSP ------------------------------------------------------------ Query ------------------------------------------------------------ 0 ident Sbjct lncervwlnvtpatlrsdladygllephalgvhegrihalvpxqdlkypahwqdxkgklv 60 DSSP lllleeeeeeeellllllllllllllleeeeeelleeeeeeehhhllllllleellllee DSSP -LLLEEEEELLHH---------------------------------------------hh Query -VKFIEMDIRDKE---------------------------------------------ay 14 ident | Sbjct tPGLIDCHTHLIFagsraeefelrqkgvpyaeiarkgggiistvratraasedqlfelal 120 DSSP eELEEEEEELLLLllllhhhhhhhhhlllhhhhhhllllhhhhhhhhhhllhhhhhhhhh DSSP HHHHHH----LLEEEEEEEellllLHHHHHHHHHHH----------LLEE---------- Query ELAKEW----FDEVVVSIKfneevDKEKLREARKEY----------GKVA---------- 50 ident | | | | Sbjct PRVKSLiregVTTVEIKSG--yglTLEDELKXLRVArrlgealpirVKTTllaahavppe 178 DSSP HHHHHHhhhlEEEEEEELL--lllLHHHHHHHHHHHhhhhhhllleEEEEeeeellllhh DSSP ----------------------------EEEEL----LLHHHHHHHHHHLL--LLEEEEE Query ----------------------------ILLSN----PKPSLVRDTVQKFK--SYLIYVE 76 ident Sbjct yrddpdswveticqeiipaaaeagladaVDVFCehigFSLAQTEQVYLAADqyGLAVKGH 238 DSSP hlllhhhhhhhhhhlhhhhhhhllllleEEEEEllllLLHHHHHHHHHHHHhlLLEEEEE DSSP L---LLHHHHHHHHHLLLLEEELLLllllllLLLHHHHHHHHHHLLEEEEE-LHHHHHLl Query S---NDLRVIRYSIEKGVDAIISPWvnrkdpGIDHVLAKLMVKKNVALGFS-LRPLLYSn 132 ident | | | | Sbjct XdqlSNLGGSTLAANFGALSVDHLE------YLDPEGIQALAHRGVVATLLpTAFYFLK- 291 DSSP ElllLLLLHHHHHHHLLLLEEEELL------LLLHHHHHHHHHHLLEEEELhHHHHHLL- DSSP hhhhhhHHHHHhhHHHHHHHHLLLEEEELLLLL--hHHLLlHHHHHHHHHH-LLLLHHHH Query pyeranLLRFMmkAWKLVEKYKVRRFLTSSAQE--kWDVRyPRDLISLGVV-IGMEIPQA 189 ident | | | | | | | Sbjct ------ETKLP--PVVALRKAGVPXAVSSDINPgtaPIVS-LRXAXNXACTlFGLTPVEA 342 DSSP ------LLLLL--LHHHHHHLLLLEEELLLLLLlllLLLL-HHHHHHHHHHhHLLLHHHH DSSP HHLLLHHHHHHHL----------------------------------------------- Query KASISMYPEIILK----------------------------------------------- 202 ident | | Sbjct XAGVTRHAARALGeqeqlgqlrvgxladflvwncghpaelsyligvdqlvsrvvngeetl 402 DSSP HHHLLHHHHHHLLllllllllllllllleeeellllllhhhhlllllleeeeeelleell DSSP - Query - 202 ident Sbjct h 403 DSSP l
DSSP ---------------------------------------------------LLLEEEEEL Query ---------------------------------------------------VKFIEMDIR 9 ident | | | Sbjct alqtiinarlpgeeglwqihlqdgkisaidaqsgvmpitensldaeqglviPPFVEPHIH 60 DSSP llleeeeellllllleeeeeeelleeeeeeeellllllllleeelllleeeLLEEEEEEL DSSP LHHH----------------------------------------HHHHHHH-LLEEEEEE Query DKEA----------------------------------------YELAKEW-FDEVVVSI 28 ident | Sbjct LDTTqtagqpnwnqsgtlfegierwaerkallthddvkqrawqtLKWQIANgIQHVRTHV 120 DSSP LLLLlllllllllllllhhhhhhhhhllhhhllhhhhhhhhhhhHHHHHHLlEEEEEEEE DSSP ------------------------------EELLLL---------LHHHHHHHHhhhllE Query ------------------------------KFNEEV---------DKEKLREARkeygkV 49 ident | | || Sbjct dvsdatltalkamlevkqevapwidlqivaFPQEGIlsypngealLEEALRLGA-----D 175 DSSP ellllllhhhhhhhhhhhhhlllleeeeeeELLLLLlllllhhhhHHHHHHLLL-----L DSSP EEEEELL-------LHHHHHHHHHHLL--LLEEEEELL-----lHHHHHHHHHLL----- Query AILLSNP-------KPSLVRDTVQKFK--SYLIYVESN-----dLRVIRYSIEKG----- 90 ident | || | | Sbjct VVGAIPHfeftreyGVESLHKTFALAQkyDRLIDVHCDeiddeqSRFVETVAALAhhegm 235 DSSP EEEELHHhlllhhhHHHHHHHHHHHHHhhLLEEEEEELllllllLLHHHHHHHHHhhhll DSSP --lLEEELLLLLLLL-lllLHHHHHHHHHHLLEEEEE-LHHHHH-LLHH-hhHHHHhhhh Query --vDAIISPWVNRKD-pgiDHVLAKLMVKKNVALGFS-LRPLLY-SNPY-erANLLrfmm 144 ident | | | Sbjct garVTASHTTAMHSYngayTSRLFRLLKMSGINFVANpLVNIHLqGRFDtypKRRG---i 292 DSSP hhhEEEEELHHHHHLlhhhHHHHHHHHHHHLLEEEELhHHHHHHlLLLLlllLLLL---l DSSP hHHHHHHHHLLLEEEELLLLLH----HHLLLHHHHHHHHH-HLLL----LHHHHHHLLLH Query kAWKLVEKYKVRRFLTSSAQEK----WDVRYPRDLISLGV-VIGM----EIPQAKASISM 195 ident | | | | | Sbjct tRVKEMLESGINVCFGHDDVFDpwypLGTANMLQVLHMGLhVCQLmgygQINDGLNLITH 352 DSSP lLHHHHHHLLLLEEELLLLLLLllllLLLLLHHHHHHHHHhHLLLllhhHHHHHHHHHLH DSSP HHHHHHL----------------------------------------------------- Query YPEIILK----------------------------------------------------- 202 ident | Sbjct HSARTLNlqdygiaagnsanliilpaengfdalrrqvpvrysvrggkviastqpaqttvy 412 DSSP HHHHHLLllllllllllllleeeellllhhhhhhhllllleeeelleeeeellllleeee DSSP ----------- Query ----------- 202 ident Sbjct leqpeaidykr 423 DSSP llleeeellll
DSSP llLEEEEELL----------HHHHHHHH-HHLLEEEEEEEELLL---lLHHHHHHHHHH- Query vkFIEMDIRD----------KEAYELAK-EWFDEVVVSIKFNEE---vDKEKLREARKE- 45 ident || | Sbjct -yPVDLHMHTvasthaystlSDYIAQAKqKGIKLFAITDHGPDMedapHHWHFINMRIWp 59 DSSP -lLEELLLLLlllllllllhHHHHHHHHhHLLLEEEEEEELLLLllllLLHHHHHHHHLl DSSP ------hLLEEEEEELLL-HHHHhhHHHH--LLLL-EEEEEL-----------lLHHHHH Query ------yGKVAILLSNPK-PSLVrdTVQK--FKSY-LIYVES-----------nDLRVIR 84 ident | | | || Sbjct rvvdgvgILRGIEANIKNvDGEI--DCSGkmFDSLdLIIAGFhepvfaphdkatNTQAMI 117 DSSP leelleeEEEEEEEELLLlLLLL--LLLHhhHHHLlEEEEELlllllllllhhhHHHHHH DSSP HHHHLL-LLEEELLLLLLLLlLLLHHHHHHHHHHLLEEEEELHHhhhllhhhhhhhhhHH Query YSIEKG-VDAIISPWVNRKDpGIDHVLAKLMVKKNVALGFSLRPllysnpyeranllrFM 143 ident | | | | | | | ||| Sbjct ATIASGnVHIISHPGNPKYE-IDVKAVAEAAAKHQVALEINNSS--------------NC 162 DSSP HHHHLLlLLEELLLLLLLLL-LLHHHHHHHHHHHLLEEEEELLL--------------LH DSSP HHHHHHHHHHLLLEEEELLLLLHHHLLlhhhHHHHHHHLL----LLHHHhhHLLLH--HH Query MKAWKLVEKYKVRRFLTSSAQEKWDVRyprdLISLGVVIG----MEIPQakASISM--YP 197 ident | | | | Sbjct REVAAAVRDAGGWVALGSDSHTAFTMG----EFEECLKILdavdFPPER--ILNVSprRL 216 DSSP HHHHHHHHHHLLLEEEELLLLLHHHLL----LLHHHHHHHhhllLLHHH--LHHHLhhHH DSSP HHHHL------------- Query EIILK------------- 202 ident | Sbjct LNFLEsrgmapiaefadl 234 DSSP HHHHHhllllllhhhlll
DSSP -----------------------------------------------------------L Query -----------------------------------------------------------V 1 ident Sbjct sktiiknigkivsgdikspvlqadtivvedgliaaiggeelmkdagdatiidaagstvtP 60 DSSP leeeeellleeellllllleellleeeeelleeeeeelhhhhlllllleeeelllleeeE DSSP LLEEEEELLH-----------HHHHHHHHH-LLEEEEEEE-------ellllLHHHHHHH Query KFIEMDIRDK-----------EAYELAKEW-FDEVVVSIK-------fneevDKEKLREA 42 ident | | Sbjct GLLDTHVHVSggdyaprqktmDFISSALHGgVTTMISAGSphfpgrpkdaagTKALAITL 120 DSSP LEEEEEELLLllleehhhleeLHHHHHHLLlEEEEEELLLlllllllllhhhHHHHHHHH DSSP HHHH----------LLEE-----------------------EEEE---lLLHHHHHHHHH Query RKEY----------GKVA-----------------------ILLS---nPKPSLVRDTVQ 66 ident | | | | | Sbjct SKSYynarpagvkvHGGAvilekglteedfiemkkegvwivGEVGlgtiKNPEDAAPMVE 180 DSSP HHHHhhllhhhleeELLEelllllllhhhhhhhhhlllleeEEELllllLLHHHHHHHHH DSSP HLL--LLEEEEELL----------LHHHHHHHhhlLLLEEELLLL---LLLLLLLLhHHH Query KFK--SYLIYVESN----------DLRVIRYSiekGVDAIISPWV---NRKDPGIDhVLA 111 ident | | Sbjct WAHkhGFKVQMHTGgtsipgsstvTADDVIKT---KPDVVSHINGgptAISVQEVD-RIM 236 DSSP HHHhlLLEEEEELLllllllllllLHHHHHHH---LLLEEELLLLlllLLLHHHHH-HHH DSSP HHHhhhLLEEEEELHHhhhllhhhhhhHHHHHHHHHHHHHHHLL--LEEEELLLLL--HH Query KLMvkkNVALGFSLRPllysnpyeranLLRFMMKAWKLVEKYKV--RRFLTSSAQE--KW 167 ident | | | Sbjct DET---DFAMEIVQCG-----------NPKIADYVARRAAEKGQlgRVIFGNDAPSgtGL 282 DSSP HHL---LLEEEEELLL-----------LHHHHHHHHHHHHHHLLhhHEEEELLLLLllLL DSSP HLLLHHHHHHHHH-HLLLLHHHHHHLLLHHHHHHHL------------------------ Query DVRYPRDLISLGV-VIGMEIPQAKASISMYPEIILK------------------------ 202 ident | Sbjct IPLGILRNMCQIAsMSDIDPEVAVCMATGNSTAVYGlntgviapgkeadliimdtplgsv 342 DSSP LLLHHHHHHHHHHhHLLLLHHHHHHHHLHHHHHHHLllllllllllllleeeeellllll DSSP ------------------------------------------- Query ------------------------------------------- 202 ident Sbjct aedamgaiaagdipgisvvlidgeavvtksrntppakraakil 385 DSSP lllhhhhhhhlllleeeeeeelleeeellllllllllllleel
DSSP ------------------------------------------------------------ Query ------------------------------------------------------------ 0 ident Sbjct mrnqelarifeeiglmseflgdnpfrvrayhqaartlydldtpieeiaekgkealmelpg 60 DSSP llhhhhhhhhhhhhhhhhhllllhhhhhhhhhhhhhhhhllllhhhhhlllhhhhlllll DSSP ------------------------------------------------------------ Query ------------------------------------------------------------ 0 ident Sbjct vgpdlaekileflrtgkvrkheelsrkvprgvlevmevpgvgpktarllyeglgidslek 120 DSSP llhhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhhhhllhhhhhhhllllllhhhhhhhhhhhllllhhh DSSP ------------------------------------------------------------ Query ------------------------------------------------------------ 0 ident Sbjct lkaaldrgdltrlkgfgpkraerireglalaqaagkrrplgavlslarslleairalpgv 180 DSSP hhhhhhhlhhhhlllllhhhhhhhhhhhhhhhhlllleehhhhhhhhhhhhhhhhlllll DSSP ------------------------------------------------------------ Query ------------------------------------------------------------ 0 ident Sbjct eraelcgsarrykdtvgdldflvasregeravegfvrlpqvkevyakgkeratvflkngl 240 DSSP leeeelhhhhlllleelleeeeeelllhhhhhhhhhlllleeeeeeellleeeeeellll DSSP ------------------------------------------------------------ Query ------------------------------------------------------------ 0 ident Sbjct qvdlrvvppesygaglqyltgskahsirlralaqekglklseygvfrgekriageteeev 300 DSSP eeeeeeelhhhhhhhhhhhhllhhhhhhhhhhhhhllleeelleeeelleeeelllhhhh DSSP -----------------------------------LLLEEEEELL---------HHHHHH Query -----------------------------------VKFIEMDIRD---------KEAYEL 16 ident | | Sbjct yaalglpwippplredqgeveaalegrlpkllelpQVKGDLQVHStysdgqntlEELWEA 360 DSSP hhhlllllllhhhlllllhhhhhhlllllllllhhHLLEEEEELLllllllllhHHHHHH DSSP HHHH-LLEEEEEEEEL-------LLLL--HHHHHHHHHHH-------LLEEEEEELLL-H Query AKEW-FDEVVVSIKFN-------EEVD--KEKLREARKEY-------GKVAILLSNPK-P 58 ident || | | | Sbjct AKTMgYRYLAVTDHSPavrvaggPSPEeaLKRVGEIRRFNethgppyLLAGAEVDIHPdG 420 DSSP HHHHlLLEEEEEEELHhhhllllLLHHhhHHHHHHHHHHHhhhllleEEEEEEEELLLlL DSSP HHHhhHHHH-LLLL-EEEEELL---------LHHHHHHHHHLL-LLEEELLLL------- Query SLVrdTVQK-FKSY-LIYVESN---------DLRVIRYSIEKG-VDAIISPWV------- 99 ident | | | | | | Sbjct TLD--YPDWvLRELdLVLVSVHsrfnlpkadQTKRLLKALENPfVHVLAHPTArllgrra 478 DSSP LLL--LLHHhHLLLlEEEEELLllllllhhhHHHHHHHHHLLLlLLEELLLLLlllllll DSSP LLLLlllLHHHHHHHHHHLLEEEEELHHHhhllhhhhhhhhhhHHHHHHHHHHHLLLEEE Query NRKDpgiDHVLAKLMVKKNVALGFSLRPLlysnpyeranllrfMMKAWKLVEKYKVRRFL 159 ident | || | Sbjct PIEA--dWEAVFQKAKEKGVAVEIDGYYD----------rmdlPDDLARMAYGMGLWISL 526 DSSP LLLL--lHHHHHHHHHHHLLEEEEELLLL----------llllLHHHHHHHHHLLLLEEE DSSP ELLLLLHHHLLlhhHHHHHHHHLL--LLHHHhhHLLLH----hhHHHHL---- Query TSSAQEKWDVRyprDLISLGVVIG--MEIPQakASISM----ypEIILK---- 202 ident | | | Sbjct STDAHQTDHLR---FMELAVGTAQraWIGPE-rVLNTLdyedllSWLKArrgv 575 DSSP ELLLLLHHHHH---HHHHHHHHHHhlLLLLL-lLHHHLlhhhhhHHHHLllll
DSSP ----------------------------------------------------LLLEEEEE Query ----------------------------------------------------VKFIEMDI 8 ident | Sbjct skdfdliirnaylsekdsvydigivgdriikieakiegtvkdeidakgnlvsPGFVDAHT 60 DSSP llleeeeeeeeeelllleeeeeeeelleeeeeelllllleeeeeellllleeELEEEEEE DSSP LLH--------------------------------------------HHHHHHHHH-LLE Query RDK--------------------------------------------EAYELAKEW-FDE 23 ident | Sbjct HMDksftstgerlpkfwsrpytrdaaiedglkyyknatheeikrhviEHAHMQVLHgTLY 120 DSSP LHHhllllllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhllhhhhhhhhhHHHHHHHHLlEEE DSSP EEEEE-------------------------------EELLLL---------LHHHHHHHH Query VVVSI-------------------------------KFNEEV---------DKEKLREAR 43 ident | Sbjct TRTHVdvdsvaktkaveavleakeelkdlidiqvvaFAQSGFfvdleseslIRKSLDMGC 180 DSSP EEEEEelllllllhhhhhhhhhhhhllllleeeeeeELLLLLlllllhhhhHHHHHHHLL DSSP hhhllEEEEEELL------LHHHHHHHHHHLL--LLEEEEELL-----LHHHHHHHHHLL Query keygkVAILLSNP------KPSLVRDTVQKFK--SYLIYVESN-----DLRVIRYSIEKG 90 ident | | | | | Sbjct -----DLVGGVDPatrennVEGSLDLCFKLAKeyDVDIDYHIHdigtvGVYSINRLAQKT 235 DSSP -----LEEELLLLllllllHHHHHHHHHHHHHhlLLEEEEEELllhhhHHHHHHHHHHHH DSSP -------lLEEELLLLLLLL-lllLHHHHHHHHHHLLEEEEELHHhhhllhhhhhhHHHH Query -------vDAIISPWVNRKD-pgiDHVLAKLMVKKNVALGFSLRPllysnpyeranLLRF 142 ident | | Sbjct iengykgrVTTSHAWCFADApsewLDEAIPLYKDSGMKFVTCFSS----------tPPTM 285 DSSP hhllllllEEEEELLHHHHLlhhhHHHHHHHHHHHLLEEEEELLL----------lLLLL DSSP hhhHHHHHHHHLLLEEEELLLLL----hHHLLLHHHHHHHHHHLL-----lLHHHHHHLL Query mmkAWKLVEKYKVRRFLTSSAQE----kWDVRYPRDLISLGVVIG-----mEIPQAKASI 193 ident | | Sbjct ---PVIKLLEAGINLGCASDNIRdfwvpFGNGDMVQGALIETQRLelktnrDLGLIWKMI 342 DSSP ---LHHHHHHLLLEEEEELLLLLlllllLLLLLHHHHHHHHHHHHllllhhHHHHHHHHH DSSP LHHHHHHHL--------------------------------------------------- Query SMYPEIILK--------------------------------------------------- 202 ident | Sbjct TSEGARVLGieknygievgkkadlvvlnslspqwaiidqakrlcvikngriivkdeviva 402 DSSP LHHHHHHHLlhhhlllllllllleeeellllhhhhhhhllleeeeeelleeeeelleell
DSSP llLEEEEELL--------------HHHHHHHHH-HLLEEEEEEEELL---LLLHHHHHHH Query vkFIEMDIRD--------------KEAYELAKE-WFDEVVVSIKFNE---EVDKEKLREA 42 ident | | | | ||| Sbjct --MIDIHCHIlpamddgagdsadsIEMARAAVRqGIRTIIATPHHNNgvyKNEPAAVREA 58 DSSP --LEELLLLLllllllllllhhhhHHHHHHHHHlLLLEEELLLEELLlllLLLHHHHHHH DSSP HHHH------------LLEEEEEElLLHHhHHHHHHHLLLLE------EEEELL---LHH Query RKEY------------GKVAILLSnPKPSlVRDTVQKFKSYL------IYVESN---DLR 81 ident | | | | | Sbjct ADQLnkrlikediplhVLPGQEIR-IYGE-VEQDLAKRQLLSlndtkyILIEFPfdhVPR 116 DSSP HHHHhhhhhhllllleEELLLEEE-LLLL-HHHHHHLLLLLLhhhlleEEEELLlllLLL DSSP HHHHHHHL-----LLLEEELLLLLLLLL---lLLHHHHHHHhhhlLEEEEELHH--HHHL Query VIRYSIEK-----GVDAIISPWVNRKDP---gIDHVLAKLMvkknVALGFSLRP--LLYS 131 ident | | || | | Sbjct YAEQLFYDlqlkgYIPVIAHPERNREIRenpsLLYHLVEKG----AASQITSGSlaGIFG 172 DSSP LHHHHHHHhhhllLEEEEELHHHLHHHHhllhHHHHHHHLL----LEEEEEHHHhlLLLL DSSP lhhhhHHHHHHHHHHHHHHhhhlLLEEEELLLLLHH--HLLLhHHHHHHHHHlLLLHHHH Query npyerANLLRFMMKAWKLVekykVRRFLTSSAQEKW--DVRYpRDLISLGVViGMEIPQA 189 ident | | | | | Sbjct -----KQLKAFSLRLVEAN----LIHFVASDAHNVKtrNFHT-QEALYVLEK-EFGSELP 221 DSSP -----HHHHHHHHHHHHLL----LLLEEELLLLLLLllLLLH-HHHHHHHHH-HHLLHHH DSSP HHLLlHHHHHHHL-------------- Query KASIsMYPEIILK-------------- 202 ident | | Sbjct YMLT-ENAELLLRnqtifrqppqpvkr 247 DSSP HHHH-HHHHHHHLllllllllllllll
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