Results: dupa update

Query: 1gkpA

MOLECULE: HYDANTOINASE;

Select neighbours (check boxes) for viewing as multiple structural alignment or 3D superimposition. The list of neighbours is sorted by Z-score. Similarities with a Z-score lower than 2 are spurious. Each neighbour has links to pairwise structural alignment with the query structure, and to the PDB format coordinate file where the neighbour is superimposed onto the query structure.

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Summary

    No:  Chain   Z    rmsd lali nres  %id PDB  Description
1:  1gkp-A 75.3  0.0  458   458  100 PDB  MOLECULE: HYDANTOINASE;                                              
2:  4b3z-D 56.1  1.4  452   477   36 PDB  MOLECULE: DIHYDROPYRIMIDINASE-RELATED PROTEIN 1;                     
3:  3e74-A 50.8  2.0  420   429   30 PDB  MOLECULE: ALLANTOINASE;                                              
4:  3gri-A 43.9  2.4  401   422   29 PDB  MOLECULE: DIHYDROOROTASE;                                            
5:  3giq-A 32.7  2.7  358   475   20 PDB  MOLECULE: N-ACYL-D-GLUTAMATE DEACYLASE;                              
6:  3pnu-A 30.5  3.1  314   338   12 PDB  MOLECULE: DIHYDROOROTASE;                                            
7:  1onx-A 29.5  2.7  332   390   18 PDB  MOLECULE: ISOASPARTYL DIPEPTIDASE;                                   
8:  3nqb-A 28.6  3.0  313   587   21 PDB  MOLECULE: ADENINE DEAMINASE 2;                                       
9:  1yrr-B 27.9  3.3  307   334   18 PDB  MOLECULE: N-ACETYLGLUCOSAMINE-6-PHOSPHATE DEACETYLASE;               
10:  2vun-A 27.8  2.7  324   385   21 PDB  MOLECULE: ENAMIDASE;                                                 
11:  4cqb-A 26.9  3.7  331   402   19 PDB  MOLECULE: N-ISOPROPYLAMMELIDE ISOPROPYL AMIDOHYDROLASE;              
12:  2paj-A 25.2  3.5  319   421   18 PDB  MOLECULE: PUTATIVE CYTOSINE/GUANINE DEAMINASE;                       
13:  2ogj-A 24.9  3.4  318   379   17 PDB  MOLECULE: DIHYDROOROTASE;                                            
14:  3mtw-A 24.8  3.6  329   404   19 PDB  MOLECULE: L-ARGININE CARBOXYPEPTIDASE CC2672;                        
15:  2oof-A 24.0  3.6  319   403   17 PDB  MOLECULE: 4-IMIDAZOLONE-5-PROPANOATE AMIDOHYDROLASE;                 
16:  1a5k-C 23.8  2.5  340   566   22 PDB  MOLECULE: UREASE (GAMMA SUBUNIT);                                    
17:  3mkv-A 23.6  3.4  324   414   20 PDB  MOLECULE: PUTATIVE AMIDOHYDROLASE;                                   
18:  3ls9-A 23.3  3.5  333   453   17 PDB  MOLECULE: TRIAZINE HYDROLASE;                                        
19:  1j6p-A 22.9  3.5  320   407   16 PDB  MOLECULE: METAL-DEPENDENT HYDROLASE OF                               
20:  3ooq-A 22.9  3.2  290   384   21 PDB  MOLECULE: AMIDOHYDROLASE;                                            
21:  1k6w-A 22.9  3.9  323   423   15 PDB  MOLECULE: CYTOSINE DEAMINASE;                                        
22:  3icj-A 22.7  3.2  296   468   17 PDB  MOLECULE: UNCHARACTERIZED METAL-DEPENDENT HYDROLASE;                 
23:  4c5y-A 21.4  3.7  323   436   19 PDB  MOLECULE: OCHRATOXINASE;                                             
24:  2uz9-A 20.1  4.2  317   444   13 PDB  MOLECULE: GUANINE DEAMINASE;                                         
25:  2ob3-A 18.9  3.1  248   329   15 PDB  MOLECULE: PARATHION HYDROLASE;                                       
26:  4rdv-B 18.9  3.5  311   451   20 PDB  MOLECULE: N-FORMIMINO-L-GLUTAMATE IMINOHYDROLASE;                    
27:  3irs-A 18.8  2.8  235   281   11 PDB  MOLECULE: UNCHARACTERIZED PROTEIN BB4693;                            
28:  3cjp-A 18.8  2.7  225   262   12 PDB  MOLECULE: PREDICTED AMIDOHYDROLASE, DIHYDROOROTASE FAMILY;           
29:  1bf6-A 18.1  2.7  231   291    9 PDB  MOLECULE: PHOSPHOTRIESTERASE HOMOLOGY PROTEIN;                       
30:  2dvt-A 17.4  3.2  253   325   15 PDB  MOLECULE: THERMOPHILIC REVERSIBLE GAMMA-RESORCYLATE DECARBO          
31:  4dlf-A 17.4  3.2  243   287   12 PDB  MOLECULE: AMIDOHYDROLASE 2;                                          
32:  3k2g-B 17.3  2.8  233   358   12 PDB  MOLECULE: RESINIFERATOXIN-BINDING, PHOSPHOTRIESTERASE-               
33:  2vc5-A 17.3  2.9  230   314   12 PDB  MOLECULE: ARYLDIALKYLPHOSPHATASE;                                    
34:  4ofc-A 17.2  3.1  244   335   12 PDB  MOLECULE: 2-AMINO-3-CARBOXYMUCONATE-6-SEMIALDEHYDE DECARBOX          
35:  2imr-A 17.1  5.4  294   380   14 PDB  MOLECULE: HYPOTHETICAL PROTEIN DR_0824;                              
36:  4hk5-D 16.9  3.3  261   380   12 PDB  MOLECULE: URACIL-5-CARBOXYLATE DECARBOXYLASE;                        
37:  2ffi-A 16.8  3.0  234   273   14 PDB  MOLECULE: 2-PYRONE-4,6-DICARBOXYLIC ACID HYDROLASE, PUTATIV          
38:  4qrn-A 16.7  3.2  248   352   10 PDB  MOLECULE: 5-CARBOXYVANILLATE DECARBOXYLASE;                          
39:  2y1h-B 16.7  2.9  226   265   14 PDB  MOLECULE: PUTATIVE DEOXYRIBONUCLEASE TATDN3;                         
40:  4dzi-C 16.4  3.4  248   388   11 PDB  MOLECULE: PUTATIVE TIM-BARREL METAL-DEPENDENT HYDROLASE;             
41:  4mup-B 16.0  3.1  232   286   13 PDB  MOLECULE: AMIDOHYDROLASE;                                            
42:  2qpx-A 15.8  3.1  225   376   10 PDB  MOLECULE: PREDICTED METAL-DEPENDENT HYDROLASE OF THE TIM-BA          
43:  1a4m-A 15.5  3.4  242   349   10 PDB  MOLECULE: ADENOSINE DEAMINASE;                                       
44:  1itq-A 15.1  3.3  238   369   13 PDB  MOLECULE: RENAL DIPEPTIDASE;                                         
45:  3gg7-A 15.1  3.2  216   243   13 PDB  MOLECULE: UNCHARACTERIZED METALLOPROTEIN;                            
46:  2gwg-A 14.6  3.6  232   329   10 PDB  MOLECULE: 4-OXALOMESACONATE HYDRATASE;                               
47:  3qy6-A 13.8  3.1  202   247   12 PDB  MOLECULE: TYROSINE-PROTEIN PHOSPHATASE YWQE;                         
48:  1j5s-A 13.7  3.8  241   451   10 PDB  MOLECULE: URONATE ISOMERASE;                                         
49:  3iac-A 12.6  3.9  243   469    7 PDB  MOLECULE: GLUCURONATE ISOMERASE;                                     
50:  1v77-A 11.6  3.8  182   202    9 PDB  MOLECULE: HYPOTHETICAL PROTEIN PH1877;                               
51:  2a3l-A 10.5  3.9  242   616   10 PDB  MOLECULE: AMP DEAMINASE;                                             
52:  3au2-A  9.1  6.8  184   575   12 PDB  MOLECULE: DNA POLYMERASE BETA FAMILY (X FAMILY);                     
53:  3f2b-A  9.0  5.2  199   994    8 PDB  MOLECULE: DNA-DIRECTED DNA POLYMERASE III ALPHA CHAIN;               
54:  3dcp-A  9.0  4.1  191   277   10 PDB  MOLECULE: HISTIDINOL-PHOSPHATASE;                                    
55:  1m65-A  8.8  3.5  182   234   10 PDB  MOLECULE: HYPOTHETICAL PROTEIN YCDX;                                 
56:  1bks-A  7.9  4.7  185   255    9 PDB  MOLECULE: TRYPTOPHAN SYNTHASE;                                       
57:  2yb1-A  5.7  3.9  161   284   11 PDB  MOLECULE: AMIDOHYDROLASE;                                            
58:  2anu-A  5.6  3.4  142   224    9 PDB  MOLECULE: HYPOTHETICAL PROTEIN TM0559;                               
59:  3e38-A  5.6  4.5  165   342   10 PDB  MOLECULE: TWO-DOMAIN PROTEIN CONTAINING PREDICTED PHP-LIKE

Pairwise Structural Alignments

Notation: three-state secondary structure definitions by DSSP (reduced to H=helix, E=sheet, L=coil) are shown above the amino acid sequence. Structurally equivalent residues are in uppercase, structurally non-equivalent residues (e.g. in loops) are in lowercase. Amino acid identities are marked by vertical bars.

No 1: Query=1gkpA Sbjct=1gkpA Z-score=75.3

DSSP  LEEEELLEEEELLEEEELEEEELLLLLLEEELLLLLLLLLEEEELLLLEEEELEEEEEEL
Query PLLIKNGEIITADSRYKADIYAEGETITRIGQNLEAPPGTEVIDATGKYVFPGFIDPHVH   60
ident ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct PLLIKNGEIITADSRYKADIYAEGETITRIGQNLEAPPGTEVIDATGKYVFPGFIDPHVH   60
DSSP  LEEEELLEEEELLEEEELEEEELLLLLLEEELLLLLLLLLEEEELLLLEEEELEEEEEEL


DSSP  LLLEELLEELLLLHHHHHHHHHHLLEEEEEEEELLLLLLLHHHHHHHHHHHHLLLLLLEE
Query IYLPFMATFAKDTHETGSKAALMGGTTTYIEMCCPSRNDDALEGYQLWKSKAEGNSYCDY  120
ident ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct IYLPFMATFAKDTHETGSKAALMGGTTTYIEMCCPSRNDDALEGYQLWKSKAEGNSYCDY  120
DSSP  LLLEELLEELLLLHHHHHHHHHHLLEEEEEEEELLLLLLLHHHHHHHHHHHHLLLLLLEE


DSSP  EEEEELLLLLLLHHHHHHHHHHLLLLEEEEEELLLLLLLLLHHHHHHHHHHHHHHLLEEE
Query TFHMAVSKFDEKTEGQLREIVADGISSFXIFLSYKNFFGVDDGEMYQTLRLAKELGVIVT  180
ident ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct TFHMAVSKFDEKTEGQLREIVADGISSFXIFLSYKNFFGVDDGEMYQTLRLAKELGVIVT  180
DSSP  EEEEELLLLLLLHHHHHHHHHHLLLLEEEEEELLLLLLLLLHHHHHHHHHHHHHHLLEEE


DSSP  EEELLHHHHHHHHHHHHHLLLLLHHHLLLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLEEEELLLL
Query AHCENAELVGRLQQKLLSEGKTGPEWHEPSRPEAVEAEGTARFATFLETTGATGYVVHLS  240
ident ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct AHCENAELVGRLQQKLLSEGKTGPEWHEPSRPEAVEAEGTARFATFLETTGATGYVVHLS  240
DSSP  EEELLHHHHHHHHHHHHHLLLLLHHHLLLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLEEEELLLL


DSSP  LHHHHHHHHHHHHLLLLEEEEEEHHHHHLLHHHHHLLHHHHHLLLLLLLLLLLHHHHHHH
Query CKPALDAAMAAKARGVPIYIESVIPHFLLDKTYAERGGVEAMKYIMSPPLRDKRNQKVLW  300
ident ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct CKPALDAAMAAKARGVPIYIESVIPHFLLDKTYAERGGVEAMKYIMSPPLRDKRNQKVLW  300
DSSP  LHHHHHHHHHHHHLLLLEEEEEEHHHHHLLHHHHHLLHHHHHLLLLLLLLLLLHHHHHHH


DSSP  HHHHLLLLLEEELLLLLLLHHHHHHHLLLHHHLLLLLLLLLLHHHHHHHHHLLLLLLLHH
Query DALAQGFIDTVGTDHCPFDTEQKLLGKEAFTAIPNGIPAIEDRVNLLYTYGVSRGRLDIH  360
ident ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct DALAQGFIDTVGTDHCPFDTEQKLLGKEAFTAIPNGIPAIEDRVNLLYTYGVSRGRLDIH  360
DSSP  HHHHLLLLLEEELLLLLLLHHHHHHHLLLHHHLLLLLLLLLLHHHHHHHHHLLLLLLLHH


DSSP  HHHHHHLHHHHHHLLLLLLLLLLLLLLLLLEEEEELLLLEELLHHHLLLLLLLLLLLLLE
Query RFVDAASTKAAKLFGLFPRKGTIAVGSDADLVVYDPQYRGTISVKTQHVNNDYNGFEGFE  420
ident ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct RFVDAASTKAAKLFGLFPRKGTIAVGSDADLVVYDPQYRGTISVKTQHVNNDYNGFEGFE  420
DSSP  HHHHHHLHHHHHHLLLLLLLLLLLLLLLLLEEEEELLLLEELLHHHLLLLLLLLLLLLLE


DSSP  ELLEEEEEEELLEEEEELLEELLLLLLLLLLLLLLLLL
Query IDGRPSVVTVRGKVAVRDGQFVGEKGWGKLLRREPMYF  458
ident ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct IDGRPSVVTVRGKVAVRDGQFVGEKGWGKLLRREPMYF  458
DSSP  ELLEEEEEEELLEEEEELLEELLLLLLLLLLLLLLLLL

No 2: Query=1gkpA Sbjct=4b3zD Z-score=56.1

DSSP  -LEEEELLEEEELLEEEELEEEELLLLLLEEELLLLLLLLLEEEELLLLEEEELEEEEEE
Query -PLLIKNGEIITADSRYKADIYAEGETITRIGQNLEAPPGTEVIDATGKYVFPGFIDPHV   59
ident   |||| | ||  |    || | |   |  || ||  | |   | | |  | || ||   
Sbjct dRLLIKGGRIINDDQSLYADVYLEDGLIKQIGENLIVPGGVKTIEANGRMVIPGGIDVNT   60
DSSP  lEEEEEEEEEELLLLEEEEEEEEELLEEEEEELLLLLLLLLEEEELLLLEEEELEEEEEE


DSSP  LLLLeelleELLLLHHHHHHHHHHLLEEEEEEEELLLLLLLHHHHHHHHHHHHLLLLLLE
Query HIYLpfmatFAKDTHETGSKAALMGGTTTYIEMCCPSRNDDALEGYQLWKSKAEGNSYCD  119
ident           | |    |  ||| ||||  |    |      |     |   |   | ||
Sbjct YLQK-----TAADDFFQGTRAALVGGTTMIIDHVVPEPGSSLLTSFEKWHEAADTKSCCD  115
DSSP  LLLL-----LLLLLHHHHHHHHHHLLEEEEEEEELLLLLLLHHHHHHHHHHHHHLLLLLE


DSSP  EEEEEELLLLLLLHHHHHHHHHH-LLLLEEEEEELLLLLLLLLHHHHHHHHHHHHHHLLE
Query YTFHMAVSKFDEKTEGQLREIVA-DGISSFXIFLSYKNFFGVDDGEMYQTLRLAKELGVI  178
ident |  |             |   |   |  ||     ||      |   |      | ||  
Sbjct YSLHVDITSWYDGVREELEVLVQdKGVNSFQVYMAYKDVYQMSDSQLYEAFTFLKGLGAV  175
DSSP  EEEEEELLLLLLLHHHHHHHHHHlLLLLEEEEELLLLLLLLLLHHHHHHHHHHHHHHLLE


DSSP  EEEEELLHHHHHHHHHHHHHLLLLLHHHLLLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLEEEELL
Query VTAHCENAELVGRLQQKLLSEGKTGPEWHEPSRPEAVEAEGTARFATFLETTGATGYVVH  238
ident    | ||  |    |   |  | |||| |  ||||  |||   |  |         |   
Sbjct ILVHAENGDLIAQEQKRILEMGITGPEGHALSRPEELEAEAVFRAITIAGRINCPVYITK  235
DSSP  EEEELLLHHHHHHHHHHHHHLLLLLLHHHHHHLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLEEEEE


DSSP  LLLHHHHHHHHHHHHLLLLEEEEEEHHHHHLLHHHHHL-LHHHHHLLLLLLLLL-LLHHH
Query LSCKPALDAAMAAKARGVPIYIESVIPHFLLDKTYAER-GGVEAMKYIMSPPLR-DKRNQ  296
ident    | | |    |   |     |        | |         |     ||||  |    
Sbjct VMSKSAADIIALARKKGPLVFGEPIAASLGTDGTHYWSkNWAKAAAFVTSPPLSpDPTTP  295
DSSP  ELLHHHHHHHHHHHHHLLLEEEEELHHHHHLLLHHHHLlLHHHHHHLLLLLLLLlLLLHH


DSSP  HHHHHHHHLLLLLEEELLLLLLLHHHHHHHLLLHHHLLLLLLLLLLHHHHHHHHHLLLLL
Query KVLWDALAQGFIDTVGTDHCPFDTEQKLLGKEAFTAIPNGIPAIEDRVNLLYTYGVSRGR  356
ident   |   || |     |  |||  | ||  ||  || || |   || |        |  | 
Sbjct DYLTSLLACGDLQVTGSGHCPYSTAQKAVGKDNFTLIPEGVNGIEERMTVVWDKAVATGK  355
DSSP  HHHHHHHHHLLLLLLLLLLLLLLHHHHHHHLLLHHHLLLLLLLLLLHHHHHHHHHLLLLL


DSSP  LLHHHHHHHHLHHHHHHLLLLLLLLLLLLLLLLLEEEEELLLLEELLHHHLLLLLLLLLL
Query LDIHRFVDAASTKAAKLFGLFPRKGTIAVGSDADLVVYDPQYRGTISVKTQHVNNDYNGF  416
ident  |   ||   || ||| | | |||| |||||||| |  ||    ||  |       || |
Sbjct MDENQFVAVTSTNAAKIFNLYPRKGRIAVGSDADVVIWDPDKLKTITAKSHKSAVEYNIF  415
DSSP  LLHHHHHHHHLHHHHHHHLLLLLLLLLLLLLLLLEEEEEEEEEEELLLLLLLLLLLLLLL


DSSP  LLLEELLEEEEEEELLEEEEELLEELLLLLLLLLLLLLLLL-------------------
Query EGFEIDGRPSVVTVRGKVAVRDGQFVGEKGWGKLLRREPMY-------------------  457
ident || |  | | ||   ||    ||     || |    |                       
Sbjct EGMECHGSPLVVISQGKIVFEDGNINVNKGMGRFIPRKAFPehlyqrvkirnkvfglqgv  475
DSSP  LLLEEEEEEEEEEELLEEEEELLEELLLLLLLLLLLLLLLLhhhhhhhhhhhhhllllll


DSSP  -l
Query -f  458
ident   
Sbjct sr  477
DSSP  ll

No 3: Query=1gkpA Sbjct=3e74A Z-score=50.8

DSSP  --LEEEELLEEEELLEEEELEEEELLLLLLEEELLLLLLllLEEEELLLLEEEELEEEEE
Query --PLLIKNGEIITADSRYKADIYAEGETITRIGQNLEAPpgTEVIDATGKYVFPGFIDPH   58
ident    | ||||  |        ||   |  |  ||| |      || || |  | ||  | |
Sbjct sfDLIIKNGTVILENEARVVDIAVKGGKIAAIGQDLGDA--KEVXDASGLVVSPGXVDAH   58
DSSP  leEEEEELLEEELLLLEEELEEEEELLEEEEEELLLLLE--EEEEELLLLEEEELEEEEE


DSSP  ELLlleelleelllLHHHHHHHHHHLLEEEEEEEELL-lllllHHHHHHHHHHHHLLLLL
Query VHIylpfmatfakdTHETGSKAALMGGTTTYIEMCCP-srnddALEGYQLWKSKAEGNSY  117
ident  ||             |||  ||  || || ||                |    | |   
Sbjct THI-----------GYETGTRAAAKGGITTXIEXPLNqlpatvDRASIELKFDAAKGKLT  107
DSSP  ELL-----------LHHHHHHHHHHLLEEEEEELLLLllllllLHHHHHHHHHHHLLLLL


DSSP  LEEEEEEELLLLlllHHHHHHHHHHLLLLEEEEEElllllLLLLHHHHHHHHHHHHHHLL
Query CDYTFHMAVSKFdekTEGQLREIVADGISSFXIFLsyknfFGVDDGEMYQTLRLAKELGV  177
ident  |                 | |    |   || |        | |           ||| 
Sbjct IDAAQLGGLVSY---NIDRLHELDEVGVVGFXCFV-----RDVNDWQFFKGAQKLGELGQ  159
DSSP  LEEEELEELLLL---LLLLHHHHHHHLLLLEEEEL-----LLLLHHHHHHHHHHHHHHLL


DSSP  EEEEEELLHHHHHHHHHHHHHLLLLLHHHLLLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLEEEEL
Query IVTAHCENAELVGRLQQKLLSEGKTGPEWHEPSRPEAVEAEGTARFATFLETTGATGYVV  237
ident  |  |||||     |      ||         |||   | |   |        |    | 
Sbjct PVLVHCENALICDELGEEAKREGRVTAHDYVASRPVFTEVEAIRRVLYLAKVAGCRLHVC  219
DSSP  LEEEELLLHHHHHHHHHHHHHHLLLLHHHHHHLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLEEEL


DSSP  LLLLHHHHHHHHHHHHLLLLEEEEEEHHHHHLLHHHHHLlhhHHHLLLLLLLLLLLHHHH
Query HLSCKPALDAAMAAKARGVPIYIESVIPHFLLDKTYAERggvEAMKYIMSPPLRDKRNQK  297
ident | |          |   |  |  ||    | ||    |           ||| ||  |||
Sbjct HVSSPEGVEEVTRARQEGQDITCESCPHYFVLDTDQFEE---IGTLAKCSPPIRDLENQK  276
DSSP  LLLLHHHHHHHHHHHHLLLLEEEEELLHHHHLLHHHHHH---HLHHHLLLLLLLLHHHHH


DSSP  HHHHHHHLLLLLEEELLLLLLLHHHHHHHlllHHHLLLLLLLLLLHHHHHHHHHLLLLLL
Query VLWDALAQGFIDTVGTDHCPFDTEQKLLGkeaFTAIPNGIPAIEDRVNLLYTYGVSRGRL  357
ident   |  |  | ||    || |   | |            ||              |     
Sbjct GXWEKLFNGEIDCLVSDHSPCPPEXKAGN---IXKAWGGIAGLQSCXDVXFDEAVQKRGX  333
DSSP  HHHHHHHLLLLLEELLLLLLLLLLLLLLL---LLLLLLLLLLHHHHHHHHHHHHLLLLLL


DSSP  LHHHHHHHHLHHHHHHLLLLlLLLLLLLLLLLLEEEEELLLLEELLHHHLLLLLLLLLLL
Query DIHRFVDAASTKAAKLFGLFpRKGTIAVGSDADLVVYDPQYRGTISVKTQHVNNDYNGFE  417
ident     |     | ||  |||   || || | ||| |   |                     
Sbjct SLPXFGKLXATNAADIFGLQ-QKGRIAPGKDADFVFIQPNSSYVLTNDDLEYRHKVSPYV  392
DSSP  LHHHHHHHHLHHHHHHLLLL-LLLLLLLLLLLLEEEEELLLLEELLHHHLLLLLLLLLLL


DSSP  LLEELLEEEEEEELLEEEEELL-EELLLLlLLLLLLLLllll
Query GFEIDGRPSVVTVRGKVAVRDG-QFVGEKgWGKLLRREpmyf  458
ident |  |  |      || |       |      |          
Sbjct GRTIGARITKTILRGDVIYDIEqGFPVAP-KGQFILKH----  429
DSSP  LLEELLEEEEEEELLEEEEELLlLLLLLL-LLLEELLL----

No 4: Query=1gkpA Sbjct=3griA Z-score=43.9

DSSP  LEEEELLEEEelLEEEELEEEELLLLLLEEELLLLLLLLLEEEELLLLEEEELEEEEEEL
Query PLLIKNGEIItaDSRYKADIYAEGETITRIGQNLEAPPGTEVIDATGKYVFPGFIDPHVH   60
ident   |||||          |||   |  |  |    |   |   ||| |  | ||| | |||
Sbjct XKLIKNGKVLqnGELQQADILIDGKVIKQIAPAIEPSNGVDIIDAKGHFVSPGFVDVHVH   60
DSSP  LEEEELLEEEelLEEEELEEEEELLEEEEEELLLLLLLLLEEEELLLLEEEELEEEEEEL


DSSP  L-LLEElleELLLLHHHHHHHHHHLLEEEEEEEELLllllLHHHHHHHHHHHHLLLLLLE
Query I-YLPFmatFAKDTHETGSKAALMGGTTTYIEMCCPsrndDALEGYQLWKSKAEGNSYCD  119
ident            | | ||| |||  || ||           |  |           |    
Sbjct LrEPGG---EYKETIETGTKAAARGGFTTVCPXPNTrpvpDSVEHFEALQKLIDDNAQVR  117
DSSP  LlLLLL---LLLLLHHHHHHHHHHLLEEEEEELLLLllllLLHHHHHHHHHHHHHHLLLE


DSSP  EEEEEEL---LLLLllHHHHHHHHHHLLLLEEEEEellllLLLL-LHHHHHHHHHHHHHH
Query YTFHMAV---SKFDekTEGQLREIVADGISSFXIFlsyknFFGV-DDGEMYQTLRLAKEL  175
ident                         |  |   |          ||      |     |   
Sbjct VLPYASIttrQLGK--ELVDFPALVKEGAFAFTDD-----GVGVqTASXXYEGXIEAAKV  170
DSSP  ELLLEELlhhHLLL--LLLLHHHHHLLLLLLEEEL-----LLLLlLHHHHHHHHHHHHHH


DSSP  LLEEEEEELLHHHHHHHhhhhhhlllllhhHLLL----------LLLHHHHHHHHHHHHH
Query GVIVTAHCENAELVGRLqqkllsegktgpeWHEP----------SRPEAVEAEGTARFAT  225
ident      ||||   |                                 |   |    ||   
Sbjct NKAIVAHCEDNSLIYGG-------------AXHEgkrskelgipGIPNICESVQIARDVL  217
DSSP  LLLEEELLLLHHHLLLL-------------LEELlhhhhhhlllEELLHHHHHHHHHHHH


DSSP  HHHHHLLEEEELLLLLHHHHHHHHHHHHLLLLEEEEEEHHHHHLLHHHHhLLHHhhHLLL
Query FLETTGATGYVVHLSCKPALDAAMAAKARGVPIYIESVIPHFLLDKTYAeRGGVeaMKYI  285
ident   |  |    | | | |        ||  |     |    | ||       |      | 
Sbjct LAEAAGCHYHVCHVSTKESVRVIRDAKRAGIHVTAEVTPHHLLLTEDDI-PGNN--AIYK  274
DSSP  HHHHHLLLEEELLLLLHHHHHHHHHHHHLLLLEEEEELHHHHHLLHHHL-LLLL--HHHL


DSSP  LLLLLLLLHHHHHHHHHHHLLLLLEEELLLLLLLHHHHHHHlllHHHLLLLLLLLLLHHH
Query MSPPLRDKRNQKVLWDALAQGFIDTVGTDHCPFDTEQKLLGkeaFTAIPNGIPAIEDRVN  345
ident   ||||       |   |  | ||   ||| |     |          | ||   |    
Sbjct XNPPLRSTEDREALLEGLLDGTIDCIATDHAPHARDEKAQP---XEKAPFGIVGSETAFP  331
DSSP  LLLLLLLHHHHHHHHHHHHLLLLLEELLLLLLLLHHHHLLL---LLLLLLLLLLLLLHHH


DSSP  HHHHHHLLLLLLLHHHHHHHHLHHHHHHLLLLllLLLLLLLLLLLEEEEELLLLEELLHH
Query LLYTYGVSRGRLDIHRFVDAASTKAAKLFGLFprKGTIAVGSDADLVVYDPQYRGTISVK  405
ident ||||  |  |       ||    |    | |    ||      |||   |      |   
Sbjct LLYTHFVKNGDWTLQQLVDYLTIKPCETFNLE--YGTLKENGYADLTIIDLDSEQEIKGE  389
DSSP  HHHHHHLLLLLLLHHHHHHHHLHHHHHHLLLL--LLLLLLLLLLLEEEEELLLLEELLHH


DSSP  HLLLLLLLLLLLLLEELLEEEEEEELLEEEEELleelllllllllllllllll
Query TQHVNNDYNGFEGFEIDGRPSVVTVRGKVAVRDgqfvgekgwgkllrrepmyf  458
ident       |   | |    | |    | | |                        
Sbjct DFLSKADNTPFIGYKVYGNPILTXVEGEVKFEG--------------------  422
DSSP  HLLLLLLLLLLLLLEELLEEEEEEELLEEEEEL--------------------

No 5: Query=1gkpA Sbjct=3giqA Z-score=32.7

DSSP  ---LEEEELLEEEE--LLEEEELEEEELLLLLLEEELLLLLLlLLEEEELLLLEEEELEE
Query ---PLLIKNGEIIT--ADSRYKADIYAEGETITRIGQNLEAPpGTEVIDATGKYVFPGFI   55
ident       |  | ||      |  ||       |  ||     |      || || | ||||
Sbjct eklDFKITGGWIIDgtGAPRRRADLGVRDGRIAAIGELGAHP-ARHAWDASGKIVAPGFI   59
DSSP  lleEEEEELLEELLllLLLLEELEEEEELLEEEEEELLLLLL-EEEEEELLLLEEEELEE


DSSP  EEEELLLLeelleelllLHHHhHHHHHHLLEEEEEEE----ELLLLLL------------
Query DPHVHIYLpfmatfakdTHETgSKAALMGGTTTYIEM----CCPSRND------------   99
ident | | |  |                     | ||                           
Sbjct DVHGHDDL------mfvEKPD-LRWKTSQGITTVVVGncgvSAAPAPLpgntaaalallg  112
DSSP  ELLLLLLL------hhhHLLL-LHHHHLLLEEEEEELllllLLLLLLLlllllhhhhhhl


DSSP  --lhhHHHHHHHHHHL-LLLLLEEEEEEELL----------------llLLLHHHHHHHH
Query --dalEGYQLWKSKAE-GNSYCDYTFHMAVS----------------kfDEKTEGQLREI  140
ident                                                         |   
Sbjct etplfADVPAYFAALDaQRPMINVAALVGHAnlrlaamrdpqaaptaaeQQAMQDMLQAA  172
DSSP  lllllLLHHHHHHHHHhLLLLLEEEEEEEHHhhhhhhlllllllllhhhHHHHHHHHHHH


DSSP  HHLLLLEEEEEELLlLLLL-LLHHHHHHHHHHHHHHLLEEEEEELLhhhhhhhhhhhhhl
Query VADGISSFXIFLSYkNFFG-VDDGEMYQTLRLAKELGVIVTAHCENaelvgrlqqkllse  199
ident    |   |   | |          |     | | |     | |  |              
Sbjct LEAGAVGFSTGLAY-QPGAvAQAAELEGLARVAAERRRLHTSHIRN--------------  217
DSSP  HHHLLLEEEEELLL-LLHHhLLHHHHHHHHHHHHHLLLEEEEELLL--------------


DSSP  llllhhhllllllHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLEEEELLLLL---------HHHHHHHHH
Query gktgpewhepsrpEAVEAEGTARFATFLETTGATGYVVHLSC---------KPALDAAMA  250
ident                               ||    | |  |            |     
Sbjct ------------eADGVEAAVEEVLAIGRGTGCATVVSHHKCmmpqnwgrsRATLANIDR  265
DSSP  ------------lLLLHHHHHHHHHHHHHHHLLEEEELLLLLllhhhlllhHHHHHHHHH


DSSP  HHHLLLLEEEEEEHhhHHLL-----------HHHHhllhhhHHLL---------------
Query AKARGVPIYIESVIphFLLD-----------KTYAerggveAMKY---------------  284
ident |   ||                                                      
Sbjct AREQGVEVALDIYP--YPGSstiliperaetIDDI------RITWstphpecsgeyladi  317
DSSP  HHHLLLLEEEEELL--LLEEeeellhhhlllLLLL------EEEEelllhhhllllhhhh


DSSP  ----------------lllllLLLLhHHHHHHHHHHlLLLLEEELLLL-LLLHhhhhhhl
Query ----------------imsppLRDKrNQKVLWDALAqGFIDTVGTDHC-PFDTeqkllgk  327
ident                                           || |              
Sbjct aarwgcdkttaarrlapagaiYFAM-DEDEVKRIFQ-HPCCMVGSDGLpNDAR-------  368
DSSP  hhhhlllhhhhhhhhlleeeeEELL-LHHHHHHHHH-LLLEEELLLLLlLLLL-------


DSSP  llhhhlllLLLLLLLHHHHHHHHHLLLL-LLLHHHHHHHHLHHHHHHLLLLlLLLLLLLL
Query eaftaipnGIPAIEDRVNLLYTYGVSRG-RLDIHRFVDAASTKAAKLFGLFpRKGTIAVG  386
ident           |             |           |       |  ||     |    |
Sbjct --------PHPRLWGSFTRVLGRYVREArLMTLEQAVARMTALPARVFGFA-ERGVLQPG  419
DSSP  --------LLLHHHHHHHHHHHHHHHHLlLLLHHHHHHHHLHHHHHHHLLL-LLLLLLLL


DSSP  LLLLEEEEELLL-leELLHhhlllllLLLLlllleelLEEEEEEELLEEEEelleELLL-
Query SDADLVVYDPQY-rgTISVktqhvnnDYNGfegfeidGRPSVVTVRGKVAVrdgqFVGE-  444
ident   || || ||                |               | | |             
Sbjct AWADVVVFDPDTvadRATW-------DEPT----lasVGIAGVLVNGAEVF----PQPPa  464
DSSP  LLLLEEEELLLLlllLLLL-------LLLL----lllLLEEEEEELLEEEE----LLLLl


DSSP  -LLLLLLLLLlllll
Query -KGWGKLLRRepmyf  458
ident     |  ||      
Sbjct dGRPGQVLRA----x  475
DSSP  lLLLLLLLLL----l

No 6: Query=1gkpA Sbjct=3pnuA Z-score=30.5

DSSP  leeeelleeeelleeeeleeeelllllleeellllllllleeeELLL-LEEEELEEEEEE
Query pllikngeiitadsrykadiyaegetitrigqnleappgteviDATG-KYVFPGFIDPHV   59
ident                                                         | | 
Sbjct ----------------------------------------enlYFQSnAMKLKNPLDMHL   20
DSSP  ----------------------------------------lllLLLLlLEEEELLEEEEE


DSSP  LLLLeelleelllLHHHHHHHHHHlLEEEEEEEELLLlllLHHHHHHHHHHHHLLLL---
Query HIYLpfmatfakdTHETGSKAALMgGTTTYIEMCCPSrndDALEGYQLWKSKAEGNS---  116
ident |              |                |         ||     |          
Sbjct HLRD-------nqMLELIAPLSAR-DFCAAVIMPNLIpplCNLEDLKAYKMRILKACkde   72
DSSP  LLLL-------hhHHHHHHHHHHL-LLLEEEELLLLLlllLLHHHHHHHHHHHHHHHlll


DSSP  LLEEEEEEELlLLLLlhHHHHHHHHhLLLLEEEEEELL----LLLLLLLHH--HHHHHHH
Query YCDYTFHMAVsKFDEktEGQLREIVaDGISSFXIFLSY----KNFFGVDDG--EMYQTLR  170
ident            |     |  |     | |   |          |             || 
Sbjct NFTPLMTLFF-KNYD--EKFLYSAK-DEIFGIXLYPAGittnSNGGVSSFDieYLKPTLE  128
DSSP  LLEEEEEEEL-LLLL--HHHHHHHL-LLLLEEEELLLLllllLLLLLLLLLhhHHHHHHH


DSSP  HHHHHLLEEEEEELLHHhhhhhhhhhhhlllllhhhlllLLLHhHHHHHHHHHHHHHHHH
Query LAKELGVIVTAHCENAElvgrlqqkllsegktgpewhepSRPEaVEAEGTARFATFLETT  230
ident     |      | |                               |              
Sbjct AMSDLNIPLLVHGETND----------------------FVMD-RESNFAKIYEKLAKHF  165
DSSP  HHHHLLLLEEELLLLLL----------------------LHHH-LLHHHHHHHHHHHHHL


DSSP  L-LEEEELLLLLHHHHHHHHHHhhllLLEEEEEEHHHHHLLHHHHHLLHhHHHLLLLLLL
Query G-ATGYVVHLSCKPALDAAMAAkargVPIYIESVIPHFLLDKTYAERGGvEAMKYIMSPP  289
ident         |   |                |      |          |          | 
Sbjct PrLKIVMEHITTKTLCELLKDY----ENLYATITLHHLIITLDDVIGGK-MNPHLFCKPI  220
DSSP  LlLLEEELLLLLHHHHHHHHHL----LLEEEEELLHHHLLLHHHHHLLL-LLHHHLLLLL


DSSP  LLLLHHHHHHHHHHHLLL-LLEEELLLLLLLHHhhhhhlllhhhLLLLLLLLLLHHHHHH
Query LRDKRNQKVLWDALAQGF-IDTVGTDHCPFDTEqkllgkeaftaIPNGIPAIEDRVNLLY  348
ident          |      |      | |  |                  |          | 
Sbjct AKRYEDKEALCELAFSGYeKVMFGSDSAPHPKG-----------CAAGVFSAPVILPVLA  269
DSSP  LLLHHHHHHHHHHHHLLLlLEEELLLLLLLLLL-----------LLLLLLLHHHHHHHHH


DSSP  HHHLllLLLLHHHHHHHHLHHHHHHlLLLLLlllllllLLLLEEEEELlLLEELLHHH-l
Query TYGVsrGRLDIHRFVDAASTKAAKLfGLFPRkgtiavgSDADLVVYDPqYRGTISVKT-q  407
ident                   |    |                                    
Sbjct ELFK--QNSSEENLQKFLSDNTCKI-YDLKF-------KEDKILTLEE-KEWQVPNVYed  318
DSSP  HHHH--HHLLHHHHHHHHLHHHHHH-HLLLL-------LLLLEEEEEL-LLEELLLLEel


DSSP  llLLLLLLLLLLEELLEEEEeeelleeeeelleelllllllllllllllll
Query hvNNDYNGFEGFEIDGRPSVvtvrgkvavrdgqfvgekgwgkllrrepmyf  458
ident   |       |                                        
Sbjct kyNQVVPYMAGEILKFQLKH-------------------------------  338
DSSP  llLEELLLLLLLEELLEELL-------------------------------

No 7: Query=1gkpA Sbjct=1onxA Z-score=29.5

DSSP  --------LEEEELLEEEELLEEEELEEEELLLLLLEEELLLLL--LLLLEEEELLLLEE
Query --------PLLIKNGEIITADSRYKADIYAEGETITRIGQNLEA--PPGTEVIDATGKYV   50
ident           |           |   |       |     |      |   | |  |   
Sbjct midytaagFTLLQGAHLYAPEDRGICDVLVANGKIIAVASNIPSdiVPNCTVVDLSGQIL   60
DSSP  llllhhhlLEEEEEEEEELLLEEEEEEEEEELLEEEEEELLLLLllLLLLEEEELLLLEE


DSSP  EELEEEEEELL-LLEE---LLEELLLLhhhHHHHHHHLLEEEEEEEELLLLLLlhhhHHH
Query FPGFIDPHVHI-YLPF---MATFAKDThetGSKAALMGGTTTYIEMCCPSRNDdaleGYQ  106
ident  ||||| |||           |                | |                   
Sbjct CPGFIDQHVHLiGGGGeagPTTRTPEV---ALSRLTEAGVTSVVGLLGTDSIS---rHPE  114
DSSP  EELEEEEEELLlLLLLlllHHHLLLLL---LHHHHHHLLEEEEEELLLLLLLL---lLHH


DSSP  HHHHHHLL--LLLLEEEEEE-ELLLLlllhhHHHHHH-HHLL-LLEEEEEE---LLLLll
Query LWKSKAEG--NSYCDYTFHM-AVSKFdekteGQLREI-VADG-ISSFXIFL---SYKNff  158
ident     |                |         |               |            
Sbjct SLLAKTRAlnEEGISAWMLTgAYHVPsrtitGSVEKDvAIIDrVIGVXCAIsdhRSAA--  172
DSSP  HHHHHHHHhhHHLLEEEEEEeLLLLLlllllLLHHHHhHHLLlEEEEEEEElllLLLL--


DSSP  lLLHHHHHHHHHHHHHHL------LEEEEEELlhhhhhhhhhhhhhlllllhhhlllllL
Query gVDDGEMYQTLRLAKELG------VIVTAHCEnaelvgrlqqkllsegktgpewhepsrP  212
ident   |              |           |                              
Sbjct -PDVYHLANMAAESRVGGllggkpGVTVFHMG---------------------------D  204
DSSP  -LLHHHHHHHHHHHHHHHhhhlllLEEEEEEL---------------------------L


DSSP  HHHHhhhHHHHHHHHH-HHLL--EEEELLLL-LHHHHHHHHHHHHLLllEEEEEEHHHHh
Query EAVEaegTARFATFLE-TTGA--TGYVVHLS-CKPALDAAMAAKARGvpIYIESVIPHFl  268
ident               ||            |     |    |      |    |        
Sbjct SKKA---LQPIYDLLEnCDVPisKLLPTHVNrNVPLFEQALEFARKG--GTIDITSSID-  258
DSSP  LLLL---LHHHHHHHHlLLLLhhHEEEELHHhLHHHHHHHHHHHHLL--LLEEEELLLL-


DSSP  llhhhhhllhhhhhlllllllllllHHHHhHHHHHHLLL-------lLEEELLLLLLlhh
Query ldktyaerggveamkyimspplrdkRNQKvLWDALAQGF-------iDTVGTDHCPFdte  321
ident                                    |            |   |       
Sbjct -------------------------EPVA-PAEGIARAVqagiplarVTLSSDGNGS---  289
DSSP  -------------------------LLLL-HHHHHHHHHhllllhhhEEEELLLLLE---


DSSP  hhhhhlllHHHLLLlLLLLlLHHHHHHHHHLLLLLLLHHHHHHHHLHHHHHHLLLLlLLL
Query qkllgkeaFTAIPNgIPAIeDRVNLLYTYGVSRGRLDIHRFVDAASTKAAKLFGLFpRKG  381
ident                               |      |           |    |   ||
Sbjct qpffddegNLTHIG-VAGF-ETLLETVQVLVKDYDFSISDALRPLTSSVAGFLNLT-GKG  346
DSSP  eeeellllLEEEEE-ELLL-HHHHHHHHHHHHHHLLLHHHHHHHHLHHHHHHLLLL-LLL


DSSP  LLLLLLLLLEEEEELLlleellhhhllllllllllllleelLEEEEEEELLEEEEELLEE
Query TIAVGSDADLVVYDPQyrgtisvktqhvnndyngfegfeidGRPSVVTVRGKVAVRDGQF  441
ident  |  | |||| |  |                           |   |  |||  | ||  
Sbjct EILPGNDADLLVMTPE-------------------------LRIEQVYARGKLMVKDGKA  381
DSSP  LLLLLLLLLEEEELLL-------------------------LLEEEEEELLEEEEELLEE


DSSP  LLLLLllllllllllll
Query VGEKGwgkllrrepmyf  458
ident                  
Sbjct CVKGT--------fetd  390
DSSP  LLLLL--------llll

No 8: Query=1gkpA Sbjct=3nqbA Z-score=28.6

DSSP  ------------------------LEEEELLEEEEL--LEEEELEEEELLLLLLEEEL--
Query ------------------------PLLIKNGEIITA--DSRYKADIYAEGETITRIGQ--   32
ident                           ||  |            |||   |  |       
Sbjct epadlnddtlraravaaargdqrfDVLITGGTLVDVvtGELRPADIGIVGALIASVHEpa   60
DSSP  llhhhllhhhhhhhhhhhhlllleEEEEELLEEELLllLLEEELEEEEELLEEEEEELll


DSSP  LLLLLllLEEEELLLLEEEELEEEEEELLLLeelleeLLLLHHHHHHHHHHLLEEEEEEE
Query NLEAPpgTEVIDATGKYVFPGFIDPHVHIYLpfmatfAKDTHETGSKAALMGGTTTYIEM   92
ident          |||| | || || || | ||           |      |    | ||    
Sbjct SRRDA--AQVIDAGGAYVSPGLIDTHXHIES------SXITPAAYAAAVVARGVTTIVWD  112
DSSP  LLLLE--EEEEELLLLEEEELEEEEEELHHH------HLLLHHHHHHHHHLLLEEEEEEL


DSSP  EL--LLLLLlhHHHHHHHHHHHLLlLLLEEEEEEELLL---------llllHHHHHHHHH
Query CC--PSRNDdaLEGYQLWKSKAEGnSYCDYTFHMAVSK---------fdekTEGQLREIV  141
ident              |        |                                |    
Sbjct PHefGNVHG--VDGVRWAAKAIEN-LPLRAILLAPSCVpsapglerggadfDAAILADLL  169
DSSP  LHhhHHHHL--HHHHHHHHHHHLL-LLLEEEEEELLLLlllllllllllllLHHHHHHHH


DSSP  HL-LLLE-EEEEellllllLLLH-----HHHHHHHHHHHHHLLEEEEEELlhhhhhhhhh
Query AD-GISS-FXIFlsyknffGVDD-----GEMYQTLRLAKELGVIVTAHCEnaelvgrlqq  194
ident     |     |                                 |  |            
Sbjct SWpEIGGiAEIX-------NXRGvierdPRXSGIVQAGLAAEKLVCGHAR----------  212
DSSP  LLlLEEEeEEEL-------LHHHhhlllHHHHHHHHHHHHHLLEEEELLL----------


DSSP  hhhhlllllhhhllllllhhHHHH-HHHHHHHHHhhhllEEEELLLLLHHHHHHHHHHHh
Query kllsegktgpewhepsrpeaVEAE-GTARFATFLettgaTGYVVHLSCKPALDAAMAAKa  253
ident                              |               |     | |   |  
Sbjct --------------------GLKNaDLNAFXAAG-----VSSDHELVSGEDLXAKLRAG-  246
DSSP  --------------------LLLHhHHHHHHHLL-----LLEELLLLLHHHHHHHHHLL-


DSSP  llllEEEEEEHHHHHllhhhhhllhhhhhlllllllllllhHHHHHHHHH---HLLL-LL
Query rgvpIYIESVIPHFLldktyaerggveamkyimspplrdkrNQKVLWDAL---AQGF-ID  309
ident       ||    |                                   ||          
Sbjct ----LTIELRGSHDH--------------------------LLPEFVAALntlGHLPqTV  276
DSSP  ----LEEEEELLLHH--------------------------HHHHHHHHHhhhLLLLlLE


DSSP  EEELLLLLLlhhhhhhhlllhhhlllLLLL-lLLHHhHHHHHHLlLLLLLHHHHHHHHLH
Query TVGTDHCPFdteqkllgkeaftaipnGIPA-iEDRVnLLYTYGVsRGRLDIHRFVDAAST  368
ident |  ||                                      | |  |       ||  
Sbjct TLCTDDVFP-----------------DDLLqgGGLD-DVVRRLV-RYGLKPEWALRAATL  317
DSSP  EEELLLLLH-----------------HHHHhlLLHH-HHHHHHH-HLLLLHHHHHHHHLH


DSSP  HHHHHLLLlLLLLLLLLLLLLLEEEEELllleellhhhllllllllllllleELLEEEEE
Query KAAKLFGLfPRKGTIAVGSDADLVVYDPqyrgtisvktqhvnndyngfegfeIDGRPSVV  428
ident  ||   |     | || |  || ||                                  |
Sbjct NAAQRLGR-SDLGLIAAGRRADIVVFED-----------------------lNGFSARHV  353
DSSP  HHHHHHLL-LLLLLLLLLLLLLEEEELL-----------------------lLLLLEEEE


DSSP  EELLEEEEELLEELLLLL------------------------------------------
Query TVRGKVAVRDGQFVGEKG------------------------------------------  446
ident    |      |                                                 
Sbjct LASGRAVAEGGRXLVDIPtcdttvlkgsxklplrxandflvksqgakvrlatidrprftq  413
DSSP  EELLEEEEELLEELLLLLllllhhhllllllllllhhhhllllllleeeeeeeellllle


DSSP  ------------------------------------------------------------
Query ------------------------------------------------------------  446
ident                                                             
Sbjct wgeteadvkdgfvvppegatxisvthrhgxaepttktgfltgwgrwngafattvshdshn  473
DSSP  eeeeeeeeelleellllleeeeeeellllllllleeeeeeellllllleeeellllllll


DSSP  ------------------------------------------------------------
Query ------------------------------------------------------------  446
ident                                                             
Sbjct ltvfggnagdxalaanavigtgggxavasegkvtailplplsglvsdapleevarafedl  533
DSSP  eeeeellhhhhhhhhhhhhhllleeeeeelleeeeeeelllllllllllhhhhhhhhhhh


DSSP  ------------------------------------------llllllllllll
Query ------------------------------------------wgkllrrepmyf  458
ident                                                       
Sbjct reavgkvvewqppylvfkacfgatlacnigphqtdxgiadvltgkvxespviev  587
DSSP  hhhhhhhlllllllllhhhhhlllllllllleelllleeelllleeellleeel

No 9: Query=1gkpA Sbjct=1yrrB Z-score=27.9

DSSP  lEEEELLEEEELLEEEE-LEEEELLLLLLEEELLLLLLLLLEEEELLLLEEEELEEEEEE
Query pLLIKNGEIITADSRYK-ADIYAEGETITRIGQNLEAPPGTEVIDATGKYVFPGFIDPHV   59
ident       | | |                |       | ||  |     |    |||||   
Sbjct -YALTQGRIFTGHEFLDdHAVVIADGLIKSVCPVAELPPEIEQRSLNGAILSPGFIDVQL   59
DSSP  -LEEELLEEELLLLEELlEEEEEELLEEEEEEEHHHLLLLLLEEELLLLEEEELEEEEEE


DSSP  LL-----LLEELleellLLHHHHHHHHHHLLEEEEEEEELLLlLLLHHHHHHHHHHHHLL
Query HI-----YLPFMatfakDTHETGSKAALMGGTTTYIEMCCPSrNDDALEGYQLWKSKAEG  114
ident                   | |   ||    | | |         |               
Sbjct NGcggvqFNDTAeavsvETLEIMQKANEKSGCTNYLPTLITT-SDELMKQGVRVMREYLA  118
DSSP  LEelleeLLLLLllllhHHHHHHHHHHHLLLEEEEEEEELLL-LHHHHHHHHHHHHHHHH


DSSP  LLLLEEE-EEEELLLLLLLHHHHHHHHHhLLLLEEEEEelllllllLLHHhhHHHHHHHH
Query NSYCDYT-FHMAVSKFDEKTEGQLREIVaDGISSFXIFlsyknffgVDDGemYQTLRLAK  173
ident          |             | |   | |                            
Sbjct KHPNQALgLHLEGPWLNAALVDFLCENA-DVITKVTLA-------pEMVP--AEVISKLA  168
DSSP  HLLLLLLlEEEELLLLLLHHHHHHHHLH-HHEEEEEEL-------hHHLL--HHHHHHHH


DSSP  HHLLEEEEEELLhhhhhhhhhhhhhlllllhhhllllllhhhhhHHHHHHHHHHHhhLLE
Query ELGVIVTAHCENaelvgrlqqkllsegktgpewhepsrpeaveaEGTARFATFLEttGAT  233
ident   |  | |   |                                                
Sbjct NAGIVVSAGHSN--------------------------------ATLKEAKAGFR--AGI  194
DSSP  HHLLEEEELLLL--------------------------------LLHHHHHHHHH--HLE


DSSP  EEELLLL---------lhHHHHHHHHHHhlllLEEEEEEH--HHHHllhhhhhllhhhhh
Query GYVVHLS---------ckPALDAAMAAKargvPIYIESVI--PHFLldktyaerggveam  282
ident     ||                |          ||        |                
Sbjct TFATHLYnampyitgrepGLAGAILDEA----DIYCGIIAdgLHVD--------------  236
DSSP  EEELLLLlllllllllllHHHHHHHHLL----LLEEEEELllLLLL--------------


DSSP  lllllllllllhhHHHHHHHHHLLL-LLEEELLLLlllhhhhhhhlllhhhllLLLLLll
Query kyimspplrdkrnQKVLWDALAQGF-IDTVGTDHCpfdteqkllgkeaftaipNGIPAie  341
ident                    |           ||                     |     
Sbjct -------------YANIRNAKRLKGdKLCLVTDAT------------------SGSSL--  263
DSSP  -------------HHHHHHHHHHHHhHEEEELLLL------------------LLLLL--


DSSP  LHHHHHHhHHLLLLLLLHHHHHHHHLHHHHHHLLLLLLLLLLLLLLLLLEEEEELLllee
Query DRVNLLYtYGVSRGRLDIHRFVDAASTKAAKLFGLFPRKGTIAVGSDADLVVYDPQyrgt  401
ident           |             |    |   |   | || | |  | |    |     
Sbjct TMIEGVR-NLVEHCGIALDEVLRMATLYPARAIGVEKRLGTLAAGKVANLTAFTPD----  318
DSSP  LHHHHHH-HHHHHHLLLHHHHHHHHLHHHHHHLLLLLLLLLLLLLLLLLEEEELLL----


DSSP  llhhhllllllllllllleelLEEEEEEELLEEEEELleelllllllllllllllll
Query isvktqhvnndyngfegfeidGRPSVVTVRGKVAVRDgqfvgekgwgkllrrepmyf  458
ident                             | |   |                      
Sbjct ---------------------FKITKTIVNGNEVVTQ--------------------  334
DSSP  ---------------------LLEEEEEELLEEEEEL--------------------

No 10: Query=1gkpA Sbjct=2vunA Z-score=27.8

DSSP  -LEEEELL-EEEEL----LEEEELEEEELLLLLLEEE-LLLL-lLLLLEEEELLLLEEEE
Query -PLLIKNG-EIITA----DSRYKADIYAEGETITRIG-QNLE-aPPGTEVIDATGKYVFP   52
ident     |||   |              |  |   |  ||   |         ||| |  | |
Sbjct sKTIIKNIgKIVSGdiksPVLQADTIVVEDGLIAAIGgEELMkdAGDATIIDAAGSTVTP   60
DSSP  lEEEEELLlEEELLllllLEELLLEEEEELLEEEEEElHHHHllLLLLEEEELLLLEEEE


DSSP  LEEEEEELLLleelleELLLLhhHHHHHHHHLLEEEEEEEEL-----LLLL-LLHHHHHH
Query GFIDPHVHIYlpfmatFAKDTheTGSKAALMGGTTTYIEMCC-----PSRN-DDALEGYQ  106
ident |  | |||          |         || || || |                      
Sbjct GLLDTHVHVSggdyapRQKTM--DFISSALHGGVTTMISAGSphfpgRPKDaAGTKALAI  118
DSSP  LEEEEEELLLllleehHHLEE--LHHHHHHLLLEEEEEELLLlllllLLLLhHHHHHHHH


DSSP  HHHHHH-LLLLL-LEEEE-EEELLLLLllHHHHHHHHHHLLLLEE-EEEElllllLLLLH
Query LWKSKA-EGNSY-CDYTF-HMAVSKFDekTEGQLREIVADGISSF-XIFLsyknfFGVDD  162
ident                         |    ||    |    |        |          
Sbjct TLSKSYyNARPAgVKVHGgAVILEKGL--TEEDFIEMKKEGVWIVgEVGL-----GTIKN  171
DSSP  HHHHHHhHLLHHhLEEELlEELLLLLL--LHHHHHHHHHLLLLEEeEELL-----LLLLL


DSSP  -HHHHHHHHHHHHHLLEEEEEE-LLHHHHHhhhhhhhhlllllhhhllllllhhHHHHhh
Query -GEMYQTLRLAKELGVIVTAHC-ENAELVGrlqqkllsegktgpewhepsrpeaVEAEgt  220
ident           |   |  |  |                                       
Sbjct pEDAAPMVEWAHKHGFKVQMHTgGTSIPGS-----------------------sTVTA--  206
DSSP  hHHHHHHHHHHHHLLLEEEEELlLLLLLLL-----------------------lLLLH--


DSSP  HHHHHHHhhhllEEEELLLL------LHHHHHHHHHHHhlllLEEEEEEHHHHHllhhhh
Query ARFATFLettgaTGYVVHLS------CKPALDAAMAAKargvPIYIESVIPHFLldktya  274
ident                | |             |  |           | |           
Sbjct DDVIKTK-----PDVVSHINggptaiSVQEVDRIMDET----DFAMEIVQCGNP------  251
DSSP  HHHHHHL-----LLEEELLLllllllLHHHHHHHHHHL----LLEEEEELLLLH------


DSSP  hllhhhhhlllllllllllHHHHHHHHHHH---LLLLLEEELLLLLllhhhhhhhlllhh
Query erggveamkyimspplrdkRNQKVLWDALA---QGFIDTVGTDHCPfdteqkllgkeaft  331
ident                              |   |      | |                 
Sbjct -------------------KIADYVARRAAekgQLGRVIFGNDAPS--------------  278
DSSP  -------------------HHHHHHHHHHHhhlLHHHEEEELLLLL--------------


DSSP  hllLLLLLlLLHHHHHHHHHLLLLLLLHHHHHHHHLHHHHHHLLLllLLLLLLLLLLLLE
Query aipNGIPAiEDRVNLLYTYGVSRGRLDIHRFVDAASTKAAKLFGLfpRKGTIAVGSDADL  391
ident                      |    |    |  |        ||    | || |  |||
Sbjct ---GTGLI-PLGILRNMCQIASMSDIDPEVAVCMATGNSTAVYGL--NTGVIAPGKEADL  332
DSSP  ---LLLLL-LLHHHHHHHHHHHHLLLLHHHHHHHHLHHHHHHHLL--LLLLLLLLLLLLE


DSSP  EEEElLLLEellhhhlllllllllllllEELLEEEEEEELLEEEEELLEellllllllll
Query VVYDpQYRGtisvktqhvnndyngfegfEIDGRPSVVTVRGKVAVRDGQfvgekgwgkll  451
ident    |    |                         |||   |   |               
Sbjct IIMD-TPLG-------svaedamgaiaaGDIPGISVVLIDGEAVVTKSR------ntppa  378
DSSP  EEEE-LLLL-------lllllhhhhhhhLLLLEEEEEEELLEEEELLLL------lllll


DSSP  lllllll
Query rrepmyf  458
ident        
Sbjct kraakil  385
DSSP  lllleel

No 11: Query=1gkpA Sbjct=4cqbA Z-score=26.9

DSSP  ----LEEEELLEEEelLEEEELEEEELLLLLLEEELLLLlLLLLEEEELLLLEEEELEEE
Query ----PLLIKNGEIItaDSRYKADIYAEGETITRIGQNLEaPPGTEVIDATGKYVFPGFID   56
ident      | | |            ||   |  |  |    |       ||| |  | ||| |
Sbjct skdfDLIIRNAYLS--EKDSVYDIGIVGDRIIKIEAKIE-GTVKDEIDAKGNLVSPGFVD   57
DSSP  llleEEEEEEEEEL--LLLEEEEEEEELLEEEEEELLLL-LLEEEEEELLLLLEEELEEE


DSSP  EEELLLL------------------------EELLE-------ellLLHHHHHHHHHHLL
Query PHVHIYL------------------------PFMAT-------fakDTHETGSKAALMGG   85
ident  | |                                                       |
Sbjct AHTHMDKsftstgerlpkfwsrpytrdaaieDGLKYyknatheeikRHVIEHAHMQVLHG  117
DSSP  EEELHHHllllllllllllllllllhhhhhhHHHHHhhhllhhhhhHHHHHHHHHHHHLL


DSSP  EEEEEEEELLLlLLLHHHHHHHHHHHHLLLL-LLEEEEEEEL-LLLL--LLHHHHHHHHH
Query TTTYIEMCCPSrNDDALEGYQLWKSKAEGNS-YCDYTFHMAV-SKFD--EKTEGQLREIV  141
ident |                          |      |        | |      |   |   
Sbjct TLYTRTHVDVD-SVAKTKAVEAVLEAKEELKdLIDIQVVAFAqSGFFvdLESESLIRKSL  176
DSSP  EEEEEEEEELL-LLLLLHHHHHHHHHHHHLLlLLEEEEEEELlLLLLllLLHHHHHHHHH


DSSP  HLLLLEEEEEE--LLLLllllLHHHHHHHHHHHHHHLLEEEEEELLhhhhhhhhhhhhhl
Query ADGISSFXIFL--SYKNffgvDDGEMYQTLRLAKELGVIVTAHCENaelvgrlqqkllse  199
ident   |             |      |       ||||  |    |                 
Sbjct DMGCDLVGGVDpaTREN---nVEGSLDLCFKLAKEYDVDIDYHIHD--------------  219
DSSP  HHLLLEEELLLllLLLL---lHHHHHHHHHHHHHHLLLEEEEEELL--------------


DSSP  llllhhhlllllLHHHHHHHHHHHHHHHHHHLL--EEEELLLL-LHHH----hhhHHHHH
Query gktgpewhepsrPEAVEAEGTARFATFLETTGA--TGYVVHLS-CKPA----ldaAMAAK  252
ident                |      | |      |        |      |       |    
Sbjct ------------IGTVGVYSINRLAQKTIENGYkgRVTTSHAWcFADApsewldeAIPLY  267
DSSP  ------------LHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLllLEEEEELLhHHHLlhhhhhhHHHHH


DSSP  HlLLLEEEEEEHHHHhllhhhhhllhhhhhlllllllllllhhHHHHhhHHHLL----LL
Query ArGVPIYIESVIPHFlldktyaerggveamkyimspplrdkrnQKVLwdALAQG----FI  308
ident                                                             
Sbjct K-DSGMKFVTCFSST----------------------------PPTM--PVIKLleagIN  296
DSSP  H-HHLLEEEEELLLL----------------------------LLLL--LHHHHhhllLE


DSSP  LEEELLLLLLlhhhhhhhlllhhhlLLLL-LLLLlHHHHHHHHH-llLLLL--LHHHHHH
Query DTVGTDHCPFdteqkllgkeaftaiPNGI-PAIEdRVNLLYTYG-vsRGRL--DIHRFVD  364
ident      |                              |                |      
Sbjct LGCASDNIRD---------------FWVPfGNGD-MVQGALIETqrlELKTnrDLGLIWK  340
DSSP  EEEELLLLLL---------------LLLLlLLLL-HHHHHHHHHhhhLLLLhhHHHHHHH


DSSP  HHLHHHHHHLLLLLLLlLLLLLLLLLEEEEELLlleellhhhlllllllllllllEELLE
Query AASTKAAKLFGLFPRKgTIAVGSDADLVVYDPQyrgtisvktqhvnndyngfegfEIDGR  424
ident       |   |       | ||  |||||                               
Sbjct MITSEGARVLGIEKNY-GIEVGKKADLVVLNSL----------------spqwaiIDQAK  383
DSSP  HHLHHHHHHHLLHHHL-LLLLLLLLLEEEELLL----------------lhhhhhHHLLL


DSSP  EEEEEELLEEEEELLEELLlllllllllllllll
Query PSVVTVRGKVAVRDGQFVGekgwgkllrrepmyf  458
ident    |   |   | |   |                
Sbjct RLCVIKNGRIIVKDEVIVA---------------  402
DSSP  EEEEEELLEEEEELLEELL---------------

No 12: Query=1gkpA Sbjct=2pajA Z-score=25.2

DSSP  -LEEEELL-EEEEL--------LEEEELEEEELLLLLLEEELlLLLLLLLEEEELLLLEE
Query -PLLIKNG-EIITA--------DSRYKADIYAEGETITRIGQnLEAPPGTEVIDATGKYV   50
ident    || |   | |               ||   | ||  ||  |   ||    |||    
Sbjct pSTLIRNAaAIMTGgrgtaddpSRVPGPDIRIVGDTIDAIGA-LAPRPGETIVDATDCVI   59
DSSP  lEEEEELLlEELLLllllllllLLLLLLLEEEELLEEEEELL-LLLLLLLEEEELLLLEE


DSSP  EELEEEEEELLLL-------EELLE---ellLLHHHHHHHHHHLLEEEEEEEELLLLLLl
Query FPGFIDPHVHIYL-------PFMAT---fakDTHETGSKAALMGGTTTYIEMCCPSRNDd  100
ident  |     | |                          |       |  |            
Sbjct YPAWVNTHHHLFQsllkgepFRALFderrfrLAARIGLIELARSGCATVADHNYVYYPG-  118
DSSP  EELEELLLLLHHHhhlllllLHHHLlhhhhhHHHHHHHHHHHLLLEEEEEELLLLLLLL-


DSSP  hhhhhHHHHHHHLLLL---LLEEEEEEELLL----------------LLLLHHHHHHHHH
Query alegyQLWKSKAEGNS---YCDYTFHMAVSK----------------FDEKTEGQLREIV  141
ident                                                             
Sbjct ---mpFDSSAILFEEAeklGLRFVLLRGGATqtrqleadlptalrpeTLDAYVADIERLA  175
DSSP  ---llLLHHHHHHHHHhhlLLEEEEEELLLLllllllllllhhhlllLHHHHHHHHHHHH


DSSP  HLLL---------LEEEE-EELLllllLLLHHHHHHHHHHHHHHLLEEEEEELlhhhhhh
Query ADGI---------SSFXI-FLSYknffGVDDGEMYQTLRLAKELGVIVTAHCEnaelvgr  191
ident |                     |         ||  |   |  ||     |         
Sbjct ARYHdaspramrrVVMAPtTVLY----SISPREMRETAAVARRLGLRMHSHLS-------  224
DSSP  HHLLllllllleeEEELLlLLLL----LLLHHHHHHHHHHHHHLLLEEEEELL-------


DSSP  hhhhhhhlllllhhhllllllhhhhhHHHHHHHHHHhhhllEEEELLLLLHH--HHHHHH
Query lqqkllsegktgpewhepsrpeaveaEGTARFATFLettgaTGYVVHLSCKP--ALDAAM  249
ident                              |                ||            
Sbjct ------------------------gkSPVAFCGEHD-wlgsDVWYAHLVKVDadEIALLA  259
DSSP  ------------------------llLHHHHHHHLL-llllLEEEELLLLLLhhHHHHHH


DSSP  HHHhllllEEEEEEHHHHHLLhhhhhllhhhhhlllllllllllhhhhHHHHHHHLLLLL
Query AAKargvpIYIESVIPHFLLDktyaerggveamkyimspplrdkrnqkVLWDALAQGFID  309
ident                                                         |   
Sbjct QTG-----TGVAHCPQSNGRL---------------------------PVREMADAGVPV  287
DSSP  HHL-----LEEEELHHHHHLL---------------------------LLLLHHHHLLLE


DSSP  EEELLLLLllhhhhhhhlllhhhlllLLLLLL--LHHHHHHHHHlLLLLLLHHHHHHHHL
Query TVGTDHCPfdteqkllgkeaftaipnGIPAIE--DRVNLLYTYGvSRGRLDIHRFVDAAS  367
ident   | |                        |      |              |        
Sbjct SIGVDGAA------------------SNEAADmiSEVHMTWLAQ-RARLASIAEVIHWGT  328
DSSP  EELLLHHH------------------HLLLLLhhHHHHHHHHHH-HHLLLLHHHHHHHHL


DSSP  HHHHHHLLLLlLLLLLLLLLLLLEEEEELLLL--------------EELLhhhlllllll
Query TKAAKLFGLFpRKGTIAVGSDADLVVYDPQYR--------------GTISvktqhvnndy  413
ident    |   ||    |  |||  ||  ||                                 
Sbjct AGGARVMGLD-EVGKVAVGYAADIAVYRLDDPryfglhdpaigpvaSGGR----------  377
DSSP  HHHHHHHLLL-LLLLLLLLLLLLEEEEELLLHhhlllllhhhhhhhLLLL----------


DSSP  lllllleelLEEEEEEELLEEEEELLEEL--------llllllllllllllll
Query ngfegfeidGRPSVVTVRGKVAVRDGQFV--------gekgwgkllrrepmyf  458
ident                   ||  | |                            
Sbjct ---------PSVMALFSAGKRVVVDDLIEgvdikelggearrvvrellrevvv  421
DSSP  ---------LEEEEEEELLEEEEELLLLLlllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhl

No 13: Query=1gkpA Sbjct=2ogjA Z-score=24.9

DSSP  --LEEEELLEEEELL---EEEELEEEELL-LLLLEEELLLLLLlLLEEEELLlLEEEELE
Query --PLLIKNGEIITAD---SRYKADIYAEG-ETITRIGQNLEAPpGTEVIDATgKYVFPGF   54
ident   | |  |          |    ||   |   |   |  | ||              || 
Sbjct qaPILLTNVKPVGFGkgaSQSSTDILIGGdGKIAAVGSALQAP-ADTQRIDA-AFISPGW   58
DSSP  llLEEEEEEEELLLLlllLLLLEEEEELLlLLEEEEELLLLLL-LLEEELLL-LEEEELE


DSSP  EEEEELLLLEelleELLLLhhhHHHHHHHLLEEEEEEEELLlllllHHHHHHHHHHHHLL
Query IDPHVHIYLPfmatFAKDThetGSKAALMGGTTTYIEMCCPsrnddALEGYQLWKSKAEG  114
ident  | ||||                |      | ||                          
Sbjct VDLHVHIWHG--gtDISIR---PSECGAERGVTTLVDAGSA-----GEANFHGFREYIIE  108
DSSP  EEEEELLLLL--llLLLLL---HHHLLHHHLEEEEEEELLL-----LLLLHHHHHHHLLL


DSSP  LLLLEEEEEEELL-------------lLLLL-HHHHHHH-HHHLL--LLEEEEEELllLL
Query NSYCDYTFHMAVS-------------kFDEK-TEGQLRE-IVADG--ISSFXIFLSykNF  157
ident  |                                    |        |   |   |    
Sbjct PSRERIKAFLNLGsiglvacnrvpelrDIKDiDLDRILEcYAENSehIVGLXVRAS--HV  166
DSSP  LLLLEEEEEEELLllllllllllllllLHHHlLHHHHHHhHHLLLllEEEEEEEEL--HH


DSSP  LL--lLHHHHHHHHHHHHHHLLEEEEEELLHHhhhhhhhhhhhlllllhhhllllllhhh
Query FG--vDDGEMYQTLRLAKELGVIVTAHCENAElvgrlqqkllsegktgpewhepsrpeav  215
ident                 || | |    |                                 
Sbjct ITgswGVTPVKLGKKIAKILKVPXXVHVGEPP----------------------------  198
DSSP  HHlllLLHHHHHHHHHHHHHLLLEEEEELLLL----------------------------


DSSP  hhhHHHHHHHHHHhhllEEEELLL-------LLHH---HHHHHHHHHhlllLEEEEEEHH
Query eaeGTARFATFLEttgaTGYVVHL-------SCKP---ALDAAMAAKargvPIYIESVIP  265
ident            |        | |        |          |         |       
Sbjct --aLYDEVLEILG---pGDVVTHCfngksgsSIXEdedLFNLAERCE----GIRLDIGHG  249
DSSP  --lLHHHHHHHLL---lLLEEELLlllllllLLLLlhhHHHHHHHLL----LLEEELLLL


DSSP  hhhllhhhhhllhhhhhlllLLLLLlllHHHHHHHHHhhLLLLLEEELLLLLllhhhhhh
Query hflldktyaerggveamkyiMSPPLrdkRNQKVLWDAlaQGFIDTVGTDHCPfdteqkll  325
ident                                                ||           
Sbjct --------------------GASFS--fKVAEAAIAR--GLLPFSISTDLHG--------  277
DSSP  --------------------LLLLL--hHHHHHHHHL--LLLLLLLLLLLLL--------


DSSP  hlllhhhlllLLLL--lLLHHHHHhHHHLlLLLLLHHHHHHHHLHHHHHHLLLLLLllLL
Query gkeaftaipnGIPA--iEDRVNLLyTYGVsRGRLDIHRFVDAASTKAAKLFGLFPRkgTI  383
ident                   |                    | |     |    |       
Sbjct ----------HSXNfpvWDLATTX-SKLL-SVDXPFENVVEAVTRNPASVIRLDXE-nRL  324
DSSP  ----------LLLLlllLLHHHHH-HHHH-HLLLLHHHHHHLLLHHHHHHLLLLLL-lLL


DSSP  LLLLLLLEEEEELlLLEELLhhhlllllllllllLLEELLEEEEEEELLEEeEELLeell
Query AVGSDADLVVYDPqYRGTISvktqhvnndyngfeGFEIDGRPSVVTVRGKVaVRDGqfvg  443
ident  ||  ||  | |                             |                  
Sbjct DVGQRADFTVFDL-VDADLE-----atdsngdvsRLKRLFEPRYAVIGAEA-IAAS----  373
DSSP  LLLLLLEEEEEEE-EEEEEE-----eellllleeEEEEEEEEEEEEELLEE-EELL----


DSSP  lllllllllllllll
Query ekgwgkllrrepmyf  458
ident                
Sbjct ---------ryipra  379
DSSP  ---------llllll

No 14: Query=1gkpA Sbjct=3mtwA Z-score=24.8

DSSP  --LEEEELLEEEEL--LEEEE-LEEEELLLLLLEEEL-LLLLLLLLEEEELLLLEEEELE
Query --PLLIKNGEIITA--DSRYK-ADIYAEGETITRIGQ-NLEAPPGTEVIDATGKYVFPGF   54
ident                                || ||      | |    |  |    || 
Sbjct aeIKAVSAARLLDVasGKYVDnPLVIVTDGRITSIGKkGDAVPAGATAVDLPGVTLLPGL   60
DSSP  llEEEEEEEEEEELllLEEEElEEEEEELLEEEEEEElLLLLLLLLEEEEEEEEEEEELE


DSSP  EEEEELLLL-------eELLE---ELLLLHHHHHHHHHHLLEEEEEEEELllllllhhhh
Query IDPHVHIYL-------pFMAT---FAKDTHETGSKAALMGGTTTYIEMCCpsrnddaleg  104
ident || |||                  |         |  |  | ||                
Sbjct IDMHVHLDSlaevggynSLEYsdrFWSVVQTANAKKTLEAGFTTVRNVGA----------  110
DSSP  EEEEELLLLlllllhhhHHHLlhhHHHHHHHHHHHHHHHLLEEEEEELLL----------


DSSP  HHHH-HHHHLLL-----LLLEEEEE-EELL---------------------LLLL--LHH
Query YQLW-KSKAEGN-----SYCDYTFH-MAVS---------------------KFDE--KTE  134
ident          |                                           |      
Sbjct ADYDdVGLREAIdagyvPGPRIVTAaISFGatgghcdstffppsmdqknpfNSDSpdEAR  170
DSSP  LLLHhHHHHHHHhllllLLLEEEELlLLEEllllllllllllhhhllllllLLLLhhHHH


DSSP  HHHHHHHHLLLLEEEEEELL--------llllLLLHHHHHHHHHHHHHHLLEEEEEELlh
Query GQLREIVADGISSFXIFLSY--------knffGVDDGEMYQTLRLAKELGVIVTAHCEna  186
ident    |     |    ||                     ||      |   |  | ||    
Sbjct KAVRTLKKYGAQVIXICATGgvfsrgnepgqqQLTYEEMKAVVDEAHMAGIKVAAHAH--  228
DSSP  HHHHHHHHLLLLEEEEELLLllllllllllllLLLHHHHHHHHHHHHHLLLEEEEEEL--


DSSP  hhhhhhhhhhhhlllllhhhllllllhhhHHHHHHHHHHHHhhhllEEEELLLLLhhHHH
Query elvgrlqqkllsegktgpewhepsrpeavEAEGTARFATFLettgaTGYVVHLSCkpALD  246
ident                               | |                  | |     |
Sbjct -----------------------------GASGIREAVRAG-----VDTIEHASL--VDD  252
DSSP  -----------------------------LHHHHHHHHHLL-----LLEEEELLL--LLH


DSSP  HHHHHHHlLLLEEEEEEhhHHHLL--HHHHhllhHHHHL--lllllLLLLLHH-HHHHHH
Query AAMAAKArGVPIYIESVipHFLLD--KTYAerggVEAMK--yimspPLRDKRN-QKVLWD  301
ident             |          |                                    
Sbjct EGIKLAV-QKGAYFSMD--IYNTDytQAEG----KKNGVlednlrkDRDIGELqRENFRK  305
DSSP  HHHHHHH-HHLLEEELL--LLLHHhhHHHH----HHHLLlhhhhhhHHHHHHHhHHHHHH


DSSP  HHHLLLLLEEELLLLlllhhhhhhhlllhhhllllLLLLLLHHhHHHHHHLlLLLLLHHH
Query ALAQGFIDTVGTDHCpfdteqkllgkeaftaipngIPAIEDRVnLLYTYGVsRGRLDIHR  361
ident ||  |     |||                      |    |         | |       
Sbjct ALKAGVKMVYGTDAG--------------------IYPHGDNA-KQFAVMV-RYGATPLQ  343
DSSP  HHHHLLEEELLLLLL--------------------LLLLLLHH-HHHHHHH-HLLLLHHH


DSSP  HHHHHLHHHHHHLLLLLLLLLLLLLLLLLEEEEELLlleellhhhlllllllllllllEE
Query FVDAASTKAAKLFGLFPRKGTIAVGSDADLVVYDPQyrgtisvktqhvnndyngfegfEI  421
ident     |   ||   |     |  |||   |                               
Sbjct AIQSATLTAAEALGRSKDVGQVAVGRYGDMIAVAGD-------------------plaDV  384
DSSP  HHHHLLHHHHHHHLLLLLLLLLLLLLLLLEEEELLL-------------------lllLH


DSSP  LL--EEEEEEELLEEEEELleelllllllllllllllll
Query DG--RPSVVTVRGKVAVRDgqfvgekgwgkllrrepmyf  458
ident      |  |   | |                        
Sbjct TTleKPVFVMKGGAVVKAP-------------------x  404
DSSP  HHhhLLLEEEELLEEEELL-------------------l

No 15: Query=1gkpA Sbjct=2oofA Z-score=24.0

DSSP  ---LEEEELLEEEEL------LEEE-ELEEEELLLLLLEEELL-lllLLLLeEEELLLLE
Query ---PLLIKNGEIITA------DSRY-KADIYAEGETITRIGQN-leaPPGTeVIDATGKY   49
ident         |    |                      |           |     |  || 
Sbjct lncERVWLNVTPATLrsdladYGLLePHALGVHEGRIHALVPXqdlkYPAH-WQDXKGKL   59
DSSP  lllLEEEEEEEELLLllllllLLLLlLEEEEEELLEEEEEEEHhhllLLLL-LEELLLLE


DSSP  EEELEEEEEELLLLE----------------------------ELLEE-------lllLH
Query VFPGFIDPHVHIYLP----------------------------FMATF-------akdTH   74
ident | || || | |                                                 
Sbjct VTPGLIDCHTHLIFAgsraeefelrqkgvpyaeiarkgggiisTVRATraasedqlfeLA  119
DSSP  EEELEEEEEELLLLLlllhhhhhhhhhlllhhhhhhllllhhhHHHHHhhllhhhhhhHH


DSSP  HHHHHHHHHLLEEEEEEEELLLllLLHHHHHHHHHHHHL--LLLLLEEEEEEELL-----
Query ETGSKAALMGGTTTYIEMCCPSrnDDALEGYQLWKSKAE--GNSYCDYTFHMAVS-----  127
ident     |     | ||                                              
Sbjct LPRVKSLIREGVTTVEIKSGYG--LTLEDELKXLRVARRlgEALPIRVKTTLLAAhavpp  177
DSSP  HHHHHHHHHHLEEEEEEELLLL--LLHHHHHHHHHHHHHhhHHLLLEEEEEEEEEllllh


DSSP  -------lLLLLH-HHHHHHHHHLL-LLEEEEEELLLlllLLLHHHHHHHHHHHHHHLLE
Query -------kFDEKT-EGQLREIVADG-ISSFXIFLSYKnffGVDDGEMYQTLRLAKELGVI  178
ident           |             |       |       |       |    |   |  
Sbjct eyrddpdsWVETIcQEIIPAAAEAGlADAVDVFCEHI---GFSLAQTEQVYLAADQYGLA  234
DSSP  hhlllhhhHHHHHhHLHHHHHHHLLlLLEEEEEELLL---LLLHHHHHHHHHHHHHLLLE


DSSP  EEEEELlhhhhhhhhhhhhhlllllhhhllllllhhhHHHHhhHHHHHHhhhLLEE-EEL
Query VTAHCEnaelvgrlqqkllsegktgpewhepsrpeavEAEGtaRFATFLettGATG-YVV  237
ident |  |                                          |           | 
Sbjct VKGHXD------------------------------qLSNL--GGSTLA--aNFGAlSVD  260
DSSP  EEEEEL------------------------------lLLLL--LHHHHH--hHLLLlEEE


DSSP  LLLLhhHHHHHHHHHHlLLLEEEEEEHHHHHLlhhhhhllhhhhhllllllLLLLlhHHH
Query HLSCkpALDAAMAAKArGVPIYIESVIPHFLLdktyaerggveamkyimspPLRDkrNQK  297
ident ||           | |             |                              
Sbjct HLEY--LDPEGIQALA-HRGVVATLLPTAFYF-------------------LKET--KLP  296
DSSP  ELLL--LLHHHHHHHH-HHLLEEEELHHHHHH-------------------LLLL--LLL


DSSP  HHhHHHHL-LLLLEEELLLLLllhhhhhhhlllhhhllLLLLLLlLHHHHHhHHHLlllL
Query VLwDALAQ-GFIDTVGTDHCPfdteqkllgkeaftaipNGIPAIeDRVNLLyTYGVsrgR  356
ident     ||   |    |  |  |                    |                  
Sbjct PV-VALRKaGVPXAVSSDINP-----------------GTAPIV-SLRXAX-NXACtlfG  336
DSSP  LH-HHHHHlLLLEEELLLLLL-----------------LLLLLL-LHHHHH-HHHHhhhL


DSSP  LLHHHHHHHHLHHHHHHLLLLLLLLLLLLLLLLLEEEEELLlleellhhhllllllllll
Query LDIHRFVDAASTKAAKLFGLFPRKGTIAVGSDADLVVYDPQyrgtisvktqhvnndyngf  416
ident |            ||   |     |   ||  ||  |                       
Sbjct LTPVEAXAGVTRHAARALGEQEQLGQLRVGXLADFLVWNCG---------------hpae  381
DSSP  LLHHHHHHHLLHHHHHHLLLLLLLLLLLLLLLLLEEEELLL---------------lllh


DSSP  lllEELL-EEEEEEELLEEEEElleelllllllllllllllll
Query egfEIDG-RPSVVTVRGKVAVRdgqfvgekgwgkllrrepmyf  458
ident     |         | |                          
Sbjct lsyLIGVdQLVSRVVNGEETLH---------------------  403
DSSP  hhhLLLLlLEEEEEELLEELLL---------------------

No 16: Query=1gkpA Sbjct=1a5kC Z-score=23.8

DSSP  ------------------------------------------------------------
Query ------------------------------------------------------------    0
ident                                                             
Sbjct snisrqayadmfgptvgdkvrladtelwieveddlttygeevkfgggkvirdgmgqgqml   60
DSSP  leeehhhhhhhhlllllleeelllllleeelleellllllllllllllllllllllllll


DSSP  -----LEEEELLEEEELLEEEELEEEELLLLLLEEELL----------LLLLLLLEEEEL
Query -----PLLIKNGEIITADSRYKADIYAEGETITRIGQN----------LEAPPGTEVIDA   45
ident       |   |  |       ||||      |  ||                  |||| |
Sbjct aadcvDLVLTNALIVDHWGIVKADIGVKDGRIFAIGKAgnpdiqpnvtIPIGAATEVIAA  120
DSSP  hhhllLEEEEEEEEEELLEEEEEEEEEELLEEEEEELEelllllllllEELLLLLEEEEL


DSSP  LLLEEEELEEEEEELLlleelleellLLHHhHHHHHHHLLEEEEEE------------EE
Query TGKYVFPGFIDPHVHIylpfmatfakDTHEtGSKAALMGGTTTYIE------------MC   93
ident  || |  | || | |                    ||  | ||                |
Sbjct EGKIVTAGGIDTHIHW----------ICPQ-QAEEALVSGVTTMVGggtgpaagthatTC  169
DSSP  LLLEEEELEEEEEEEL----------LLLL-HHHHHHHHLEEEEEEelllllhhhhhlLL


DSSP  LLlllllHHHHHHHHHHHHLlLLLLEEEEEEELLLLlllHHHHHHHHHHLLLLEEEEEEL
Query CPsrnddALEGYQLWKSKAEgNSYCDYTFHMAVSKFdekTEGQLREIVADGISSFXIFLS  153
ident  |                |                        ||| || |     |   
Sbjct TP-----GPWYISRMLQAAD-SLPVNIGLLGKGNVS---QPDALREQVAAGVIGLEIHED  220
DSSP  LL-----HHHHHHHHHHHHL-LLLLEEEEEEELLLL---LHHHHHHHHHHLLLEEEEEHH


DSSP  llllLLLLHHHHHHHHHHHHHHLLEEEEEELLHHHhhhhhhhhhhlllllhhhllllllh
Query yknfFGVDDGEMYQTLRLAKELGVIVTAHCENAELvgrlqqkllsegktgpewhepsrpe  213
ident      |         |  | |    |  |                               
Sbjct ----WGATPAAIDCALTVADEMDIQVALHSDTLNE-------------------------  251
DSSP  ----HLLLHHHHHHHHHHHHHHLLEEEEELLLLLL-------------------------


DSSP  hhhhHHHHHHHHHHHhhLLEEEELLLLL------hHHHHhHHHHHhlllLEEEEEEHHHH
Query aveaEGTARFATFLEttGATGYVVHLSC------kPALDaAMAAKargvPIYIESVIPHF  267
ident                  | |    |               | |       |   |  |  
Sbjct ---sGFVEDTLAAIG--GRTIHTFHTEGaggghapDIIT-ACAHP----NILPSSTNPTL  301
DSSP  ---lLLHHHHHHHHL--LLLEEELLLLLlllllllLHHH-HHHLL----LEEEEEEHHHL


DSSP  HL---LHHHHhllhhhhHLLL---------------lllllLLLHHHHHHHHHHHLLLLL
Query LL---DKTYAerggveaMKYI---------------mspplRDKRNQKVLWDALAQGFID  309
ident                                                         |   
Sbjct PYtlnTIDEH-------LDMLmvchhldpdiaedvafaesrIRRETIAAEDVLHDLGAFS  354
DSSP  LLlllHHHHH-------HHHHhhhhllllllhhhhhlllllLLHHHHHHHHHHHHLLLLL


DSSP  EEELLLLlllhhhhhhhlllhhhlllLLLLLLLHHHHHHhHHLLLLL-------------
Query TVGTDHCpfdteqkllgkeaftaipnGIPAIEDRVNLLYtYGVSRGR-------------  356
ident     |                                       |               
Sbjct LTSSDSQ-------------------AMGRVGEVILRTW-QVAHRMKvqrgalaeetgdn  394
DSSP  EEELLLL-------------------LLLLLLLHHHHHH-HHHHHHHhhhllllllllll


DSSP  --lLHHHHHHHHLHHHHHHLLLLLLLLLLLLLLLLLEEEEELLLleellhhhllllllll
Query --lDIHRFVDAASTKAAKLFGLFPRKGTIAVGSDADLVVYDPQYrgtisvktqhvnndyn  414
ident       |         |   |     | | ||  |||||  |                  
Sbjct dnfRVKRYIAKYTINPALTHGIAHEVGSIEVGKLADLVVWSPAF----------------  438
DSSP  lhhHHHHHHHLLLHHHHHHLLLLLLLLLLLLLLLLLEEEELHHH----------------


DSSP  llllleelLEEEEEEELLEEEEEL---------------LEEL-LLLL-----LLLLLL-
Query gfegfeidGRPSVVTVRGKVAVRD---------------GQFV-GEKG-----WGKLLR-  452
ident           |  |   |  |                       |  |            
Sbjct ------fgVKPATVIKGGMIAIAPmgdinasiptpqpvhYRPMfGALGsarhhCRLTFLs  492
DSSP  ------llLLLLEEEELLEEEEEEellllllllllllleEEELhHHLHhhhhhHLEEEEl


DSSP  --------------------LLLLLL----------------------------------
Query --------------------REPMYF----------------------------------  458
ident                                                             
Sbjct qaaaangvaerlnlrsaiavVKGCRTvqkadmvhnslqpnitvdaqtyevrvdgelitse  552
DSSP  hhhhhhlhhhhllllleeeeLLLLLLllhhhllllllllleeelllllleeelleellll


DSSP  --------------
Query --------------  458
ident               
Sbjct padvlpmaqryflf  566
DSSP  llllllllllllll

No 17: Query=1gkpA Sbjct=3mkvA Z-score=23.6

DSSP  --LEEEELLEEEELL--EEEE-LEEEELLLLLLEEEL-LLLLLlLLEEEELLLLEEEELE
Query --PLLIKNGEIITAD--SRYK-ADIYAEGETITRIGQ-NLEAPpGTEVIDATGKYVFPGF   54
ident     |  ||     |         |  |   |               |||  ||   || 
Sbjct ltTFLFRNGALLDPDhpDLLQgFEILIEDGFIREVSDkPIKSS-NAHVIDVKGKTIMPGL   59
DSSP  llEEEEEEEEELLLLllLLEEeEEEEEELLEEEEEELlLLLLL-LLEEEELLLLEEEELE


DSSP  EEEEELLLL------eELLE----ELLLLHhHHHHHHHHLLEEEEEEEELllllllhhhh
Query IDPHVHIYL------pFMAT----FAKDTHeTGSKAALMGGTTTYIEMCCpsrnddaleg  104
ident || |||                             | |  | ||                
Sbjct IDLHVHVVAiefnlprVATLpnvlVTLRAV-PIMRAMLRRGFTTVRDAGG----------  108
DSSP  EEEEELLLLllllhhhHLLLlhhhHHHHHH-HHHHHHHHLLEEEEEELLL----------


DSSP  hhhHHHHHLL-----LLLLEEEEE-EELLL------------------------------
Query yqlWKSKAEG-----NSYCDYTFH-MAVSK------------------------------  128
ident                           | |                               
Sbjct --aGYPFKQAvesglVEGPRLFVSgRALSQtgghadprarsdymppdspcgccvrvgalg  166
DSSP  --lLHHHHHHhhlllLLLLEEEELlLEEELllllllllllllllllllllllllllllle


DSSP  ----LLLLHHHHHHHHHHLLLLEEEEEELL--------llllLLLHHHHHHHHHHHHHHL
Query ----FDEKTEGQLREIVADGISSFXIFLSY--------knffGVDDGEMYQTLRLAKELG  176
ident              ||    |    ||  |             |    |       |   |
Sbjct rvadGVDEVRRAVREELQMGADQIXIMASGgvasptdpvgvfGYSEDEIRAIVAEAQGRG  226
DSSP  eellLHHHHHHHHHHHHHHLLLLEEEELLLllllllllllllLLLHHHHHHHHHHHHLLL


DSSP  LEEEEEELlhhhhhhhhhhhhhlllllhhhllllllhhhHHHHHHHHHHHHhhhllEEEE
Query VIVTAHCEnaelvgrlqqkllsegktgpewhepsrpeavEAEGTARFATFLettgaTGYV  236
ident   | ||                                      ||              
Sbjct TYVLAHAY-------------------------------TPAAIARAVRCG-----VRTI  250
DSSP  LLEEEEEL-------------------------------LHHHHHHHHHLL-----LLEE


DSSP  LLLLLhhHHHHHHHHHHlLLLEEEEEEHHHHHLLHHHHhllhHHHHL-lllllLLLL-LH
Query VHLSCkpALDAAMAAKArGVPIYIESVIPHFLLDKTYAerggVEAMK-yimspPLRD-KR  294
ident  |       |      |     |                                 |   
Sbjct EHGNL--IDDETARLVA-EHGAYVVPTLVTYDALASEG----EKYGLppesiaKIADvHG  303
DSSP  EELLL--LLHHHHHHHH-HHLLEEELLHHHHHHHHHHL----LLLLLlhhhhlLHHHhHL


DSSP  HHHHHHHHHHL-LLLLEEELLLLlllhhhhhhhlllhhhlllLLLLlLLHHhHHHHHHLl
Query NQKVLWDALAQ-GFIDTVGTDHCpfdteqkllgkeaftaipnGIPAiEDRVnLLYTYGVs  353
ident             |     |||                     |                 
Sbjct AGLHSIEIMKRaGVKMGFGTDLL-------------------GEAQ-RLQS-DEFRILA-  341
DSSP  LHHHHHHHHHHhLLLLLLLLLLL-------------------HHHH-HHLL-HHHHHHH-


DSSP  lLLLLHHHHHHHHLHHHHHHLLLLLLLLLLLLLLLLLEEEEELLlleellhhhlllllll
Query rGRLDIHRFVDAASTKAAKLFGLFPRKGTIAVGSDADLVVYDPQyrgtisvktqhvnndy  413
ident    |        |    |   |     | |  |  ||  | |                  
Sbjct -EVLSPAEVIASATIVSAEVLGMQDKLGRIVPGAHADVLVVDGN----------------  384
DSSP  -LLLLHHHHHHHLLHHHHHHLLLLLLLLLLLLLLLLLEEEELLL----------------


DSSP  lllllleELLE------EEEEEELLEEEEELleelllllllllllllllll
Query ngfegfeIDGR------PSVVTVRGKVAVRDgqfvgekgwgkllrrepmyf  458
ident         |           |   |   |                      
Sbjct ---plksVDCLlgqgehIPLVMKDGRLFVNE------------------le  414
DSSP  ---llllLLLLllllllLLEEEELLEEEEEL------------------ll

No 18: Query=1gkpA Sbjct=3ls9A Z-score=23.3

DSSP  LEEEELL-EEEEL---LEEEE-LEEEELLLLLLEEELLLLLLLLLEEEELLLLEEEELEE
Query PLLIKNG-EIITA---DSRYK-ADIYAEGETITRIGQNLEAPPGTEVIDATGKYVFPGFI   55
ident   ||      ||          |||   |  |   |  |        ||  |    || |
Sbjct MILIRGLtRVITFddqERELEdADILIDGPKIVAVGKDLSDRSVSRTIDGRGMIALPGLI   60
DSSP  LEEEEEEeEEELLlllLLEEEeEEEEEELLEEEEEELLLLLLLLLEEEELLLEEEEELEE


DSSP  EEEELLLL-------------------eELLEE-------------llLLHHHHHHHHHH
Query DPHVHIYL-------------------pFMATF-------------akDTHETGSKAALM   83
ident   | | |                                                   | 
Sbjct NSHQHLYEgamraipqlervtmaswlegVLTRSagwwrdgkfgpdvirEVARAVLLESLL  120
DSSP  EEEELHHHhhhlllhhhllllhhhhhhhHHHHHhhhhhlllllhhhhhHHHHHHHHHHHH


DSSP  LLEEEEEEEELLLLLLLHHhhhHHHHHHHL--LLLLLEEEEEEELLL-------------
Query GGTTTYIEMCCPSRNDDALegyQLWKSKAE--GNSYCDYTFHMAVSK-------------  128
ident || ||            |           |                              
Sbjct GGITTVADQHLFFPGATAD---SYIDATIEaaTDLGIRFHAARSSMTlgkseggfcddlf  177
DSSP  LLEEEEEEEELLLLLLLLL---LHHHHHHHhhHHHLLEEEEEELLLLllhhhlllllhhh


DSSP  --LLLLHHHHHHHHHHLL---------LLEEE-EEELlllllLLLHHHHHHHHHHHHHHL
Query --FDEKTEGQLREIVADG---------ISSFX-IFLSyknffGVDDGEMYQTLRLAKELG  176
ident                                                        |    
Sbjct vePVDRVVQHCLGLIDQYhepepfgmvRIALGpCGVP-----YDKPELFEAFAQMAADYD  232
DSSP  llLHHHHHHHHHHHHHHHlllllllleEEEELlLLLL-----LLLHHHHHHHHHHHHHHL


DSSP  LEEEEEEllhhhhhhhhhhhhhlllllhhhllllLLHHH------hhHHHHHHH-HHHHh
Query VIVTAHCenaelvgrlqqkllsegktgpewhepsRPEAV------eaEGTARFA-TFLEt  229
ident |    |                               |                      
Sbjct VRLHTHF-------------------------yePLDAGmsdhlygmTPWRFLEkHGWA-  266
DSSP  LEEEEEE-------------------------llLLHHHhhhhhhllLHHHHHHhLLLL-


DSSP  hllEEEELLLLLHHhhHHHHHHHHlLLLEEEEEEHHHHHLLHhhhhllhhhhhlllllll
Query tgaTGYVVHLSCKPalDAAMAAKArGVPIYIESVIPHFLLDKtyaerggveamkyimspp  289
ident         |    |         |      |   |   |                     
Sbjct -sdRVWLAHAVVPP--REEIPEFA-DAGVAIAHLIAPDLRMG------------------  304
DSSP  -llLEEEEELLLLL--HHHHHHHH-HHLLEEEELHHHHHHLL------------------


DSSP  llllhhHHHHHHHHHL-LLLLEEELLLLLllhhhhhhhlllhhhlllLLLLLlLHHHHHh
Query lrdkrnQKVLWDALAQ-GFIDTVGTDHCPfdteqkllgkeaftaipnGIPAIeDRVNLLy  348
ident                  |     ||                                 | 
Sbjct -----wGLAPIREYLDaGITVGFGTTGSA------------------SNDGG-NLLGDL-  339
DSSP  -----lLLLLHHHHHHlLLEEEELLLLLL------------------LLLLL-LHHHHH-


DSSP  HHHLLLL----------LLLHHHHHHHHLHHHHHHLLLLlLLLLLLLLLLLLEEEEELLL
Query TYGVSRG----------RLDIHRFVDAASTKAAKLFGLFpRKGTIAVGSDADLVVYDPQY  398
ident                   |        |    |   |     |    |  ||        
Sbjct RLAALAHrpadpnepekWLSARELLRMATRGSAECLGRP-DLGVLEEGRAADIACWRLDG  398
DSSP  HHHHHHLhhhllllhhhLLLHHHHHHHLLHHHHHHLLLL-LLLLLLLLLLLLEEEEELLL


DSSP  ---------------LEELlhhhllllllllllllleelLEEEEEEELLEEEEELLEELL
Query ---------------RGTIsvktqhvnndyngfegfeidGRPSVVTVRGKVAVRDGQFVG  443
ident                 |                       | | | | | | |     | 
Sbjct vdrvgvhdpaiglimTGLS--------------------DRASLVVVNGQVLVENERPVL  438
DSSP  hhhlllllhhhhhhhLLLL--------------------LLLLEEEELLEEEEELLEELL


DSSP  LLlllllllllllll
Query EKgwgkllrrepmyf  458
ident                
Sbjct ADlerivanttalip  453
DSSP  LLhhhhhhhhhhhll

No 19: Query=1gkpA Sbjct=1j6pA Z-score=22.9

DSSP  -LEEEELLEEE-ELLE-EEELEEEELLLLLLEEEL-LLLLlllleEEELLLLEEEELEEE
Query -PLLIKNGEII-TADS-RYKADIYAEGETITRIGQ-NLEAppgteVIDATGKYVFPGFID   56
ident     | |  |     |         |  || |  |            |  || | |    
Sbjct hHXIIGNCLILkDFSSePFWGAVEIENGTIKRVLQgEVKV-----DLDLSGKLVXPALFN   55
DSSP  lEEEEEEEEELlLLLLlLEEEEEEEELLEEEEEEElLLLL-----LEELLLEEEEELEEE


DSSP  EEELLLL------------------eELLEE-------llLLHHHHHHHHHHLLEEEEEE
Query PHVHIYL------------------pFMATF-------akDTHETGSKAALMGGTTTYIE   91
ident  | |                                                 |      
Sbjct THTHAPXtllrgvaedlsfeewlfskVLPIEdrltekxayYGTILAQXEXARHGIAGFVD  115
DSSP  EEELHHHhhhllllllllhhhhhhllHHHHHllllhhhhhHHHHHHHHHHHLLLEEEEEE


DSSP  EELllllllhhhHHHHHHHHHLLlLLLEEEEEEELLL---lLLLHHHHHHHHHHLLL---
Query MCCpsrnddaleGYQLWKSKAEGnSYCDYTFHMAVSK---fDEKTEGQLREIVADGI---  145
ident                                          |                  
Sbjct XYF---------HEEWIAKAVRD-FGXRALLTRGLVDsngdDGGRLEENLKLYNEWNgfe  165
DSSP  EEL---------LHHHHHHHHHH-HLLEEEEEEEELLllllLLLHHHHHHHHHHHHLlhh


DSSP  ----LEEE-EEELlllllLLLHHHHHHHHHHHHHHLLEEEEEELlhhhhhhhhhhhhhll
Query ----SSFX-IFLSyknffGVDDGEMYQTLRLAKELGVIVTAHCEnaelvgrlqqkllseg  200
ident       |                        || |   || |                  
Sbjct grifVGFGpHSPY-----LCSEEYLKRVFDTAKSLNAPVTIHLY----------------  204
DSSP  hleeEEEEeLLLL-----LLLHHHHHHHHHHHHHHLLLEEEEEL----------------


DSSP  lllhhhllllLLHHhhhHHHHHHH-HHHHhhLLEEEELLLLLhhHHHHHHHHHHlLLLEE
Query ktgpewhepsRPEAveaEGTARFA-TFLEttGATGYVVHLSCkpALDAAMAAKArGVPIY  259
ident             |              |          |                  |  
Sbjct --------etSKEE---YDLEDILnIGLK--EVKTIAAHCVH--LPERYFGVLK-DIPFF  248
DSSP  --------llLLLL---LLLHHHHlLLLL--LLLEEEEELLL--LLHHHHHHHL-LLLEE


DSSP  EEEEHHHHHLlhhhhhllhhhhhllllllLLLLlhhHHHHHHHHHLLLLLEEELLLLLll
Query IESVIPHFLLdktyaerggveamkyimspPLRDkrnQKVLWDALAQGFIDTVGTDHCPfd  319
ident         |                                     |   | |||     
Sbjct VSHNPASNLK-------------------LGNG---IAPVQRXIEHGXKVTLGTDGAA--  284
DSSP  EEELHHHHHH-------------------LLLL---LLLHHHHHHLLLEEEELLLLLL--


DSSP  hhhhhhhlllhhhlllLLLLLlLHHHHHHHHH-----llllLLLHHHHHHHHLHHHHHHL
Query teqkllgkeaftaipnGIPAIeDRVNLLYTYG-----vsrgRLDIHRFVDAASTKAAKLF  374
ident                                           ||            |   
Sbjct ----------------SNNSL-NLFFEXRLASllqkaqnprNLDVNTCLKXVTYDGAQAX  327
DSSP  ----------------LLLLL-LHHHHHHHHHhhhhlllllLLLHHHHHHHHLHHHHHHH


DSSP  LLllLLLLLLLLLLLLEEEEELLLLEellhhhlllllllllllllEELL-EEEEEEELLE
Query GLfpRKGTIAVGSDADLVVYDPQYRGtisvktqhvnndyngfegfEIDG-RPSVVTVRGK  433
ident |     | |  |  ||||| |                                   | ||
Sbjct GF--KSGKIEEGWNADLVVIDLDLPE-------xfpvqniknhlvHAFSgEVFATXVAGK  378
DSSP  LL--LLLLLLLLLLLLEEEEELLLHH-------hllhhhhhhhhhHLLLlLLLEEEELLE


DSSP  EEEELlEELLLL-----lllllllllllll
Query VAVRDgQFVGEK-----gwgkllrrepmyf  458
ident     |                         
Sbjct WIYFD-GEYPTIdseevkrelariekelys  407
DSSP  EEEEL-LLLLLLlhhhhhhhhhhhhhhhhl

No 20: Query=1gkpA Sbjct=3ooqA Z-score=22.9

DSSP  LEEEELLEEE-ELLEEEELEEEELLLLLLEEELLLLLLLlLEEEELLLLEEEELEEEEEE
Query PLLIKNGEII-TADSRYKADIYAEGETITRIGQNLEAPPgTEVIDATGKYVFPGFIDPHV   59
ident   | ||           | |           | | | |   |  | |||  |||| | | 
Sbjct KILFKNATVFpITSRPFKGDVLVSNGKVEKVGENIEDPD-AEIVDLTGKFLFPGFVDAHS   59
DSSP  LEEEEEEEELlLLLLLEEEEEEEELLEEEEEELLLLLLL-LEEEELLLLEEEELEEEEEE


DSSP  L-LLLE---ELLEEL----------------LLLHH-HHHHHHHHLLEEEEEEEEL-lll
Query H-IYLP---FMATFA----------------KDTHE-TGSKAALMGGTTTYIEMCC-psr   97
ident |                                         || || |           
Sbjct HiGLFEegvGYYYSDgneatdpvtphvkaldGFNPQdPAIERALAGGVTSVXIVPGsanp  119
DSSP  LlLLLLlllLHHHLLlllllllllllllhhhHLLLLlHHHHHHHLLLEEEEEELLLllll


DSSP  lllhhhhhhhhhhHHLLllllEEEEeeelllllllhhhhhhhhhhlLLLEEEEEEL--LL
Query nddalegyqlwksKAEGnsycDYTFhmavskfdektegqlreivadGISSFXIFLS--YK  155
ident                |                                           |
Sbjct vggqgsvikfrsiIVEE----CIVK---------------------DPAGLKXAFGenPK  154
DSSP  eeeeeeeeellllLHHH----HEEE---------------------EEEEEEEELLhhHH


DSSP  LL----------lllLHHHHHH------------------------------hhHHHHHH
Query NF----------fgvDDGEMYQ------------------------------tlRLAKEL  175
ident                  |                                          
Sbjct RVygerkqtpstrxgTAGVIRDyftkvknyxkkkelaqkegkeftetdlkxevgEXVLRK  214
DSSP  HHhhhlllllllhhhHHHHHHHhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllllllhhhhhhHHHHLL


DSSP  LLEEEEEEllhhhhhhhhhhhhhlllllhhhllllllhhhHHHHHHHHHHHHHHHLLEEE
Query GVIVTAHCenaelvgrlqqkllsegktgpewhepsrpeavEAEGTARFATFLETTGATGY  235
ident       |                                  |          |  |    
Sbjct KIPARXHA-------------------------------hRADDILTAIRIAEEFGFNLV  243
DSSP  LLLEEEEE-------------------------------lLHHHHHHHHHHHHHHLLLEE


DSSP  ELLLLLhhHHHHhHHHHHLlLLEEEEEEHhHHHLLHhhhhllhhhhhllllllLLLLlhH
Query VVHLSCkpALDAaMAAKARgVPIYIESVIpHFLLDKtyaerggveamkyimspPLRDkrN  295
ident   |     |        |    |                               | |   
Sbjct IEHGTE--AYKI-SKVLAE-KKIPVVVGP-LLTFRT---------------klELKD--L  281
DSSP  EEELLL--HHHH-HHHHHH-HLLLEEELL-LLLLLL---------------lhHHLL--L


DSSP  HHHHHHHHHL-LLLLEEELLLLlllhhhhhhhlllhhhllllLLLLLLHHHHHhHHHLlL
Query QKVLWDALAQ-GFIDTVGTDHCpfdteqkllgkeaftaipngIPAIEDRVNLLyTYGVsR  354
ident        |   |       ||                         |            |
Sbjct TXETIAKLLKdGVLIALXCDHP--------------------VIPLEFATVQA-ATAX-R  319
DSSP  LLLHHHHHHHlLLLEEELLLLL--------------------LLLHHHHHHHH-HHHH-H


DSSP  LLLLHHHHHHHHLHHHHHHLLLLLLLLLLLLLLLLLEEEEELllleellhhhllllllll
Query GRLDIHRFVDAASTKAAKLFGLFPRKGTIAVGSDADLVVYDPqyrgtisvktqhvnndyn  414
ident                 ||  ||  | | |  | ||||||                     
Sbjct YGAKEEDLLKILTVNPAKILGLEDRIGSIEPGKDADLVVWSG------------------  361
DSSP  HLLLHHHHHHLLLHHHHHHLLLLLLLLLLLLLLLLLEEEELL------------------


DSSP  lllllEELLEEEEEEELLEEEEELleelllllllllllllllll
Query gfegfEIDGRPSVVTVRGKVAVRDgqfvgekgwgkllrrepmyf  458
ident              |   |    |                     
Sbjct --hpfDXKSVVERVYIDGVEVFRR-------------------e  384
DSSP  --lllLLLLLEEEEEELLEEEEEL-------------------l

No 21: Query=1gkpA Sbjct=1k6wA Z-score=22.9

DSSP  -LEEEELLEEeelLEEE-ELEEEELLLLLLEEELL-lllllLLEEEELLLLEEEELEEEE
Query -PLLIKNGEIitaDSRY-KADIYAEGETITRIGQN-leappGTEVIDATGKYVFPGFIDP   57
ident     | |              |      |  |              ||    | | |  |
Sbjct aLQTIINARL---PGEEgLWQIHLQDGKISAIDAQsgvmpiTENSLDAEQGLVIPPFVEP   57
DSSP  lLLEEEEELL---LLLLlEEEEEEELLEEEEEEEEllllllLLLEEELLLLEEELLEEEE


DSSP  EELLLL--------------------eELLE-------elllLHHHHHHHHHHLLEEEEE
Query HVHIYL--------------------pFMAT-------fakdTHETGSKAALMGGTTTYI   90
ident | |                                             |     |     
Sbjct HIHLDTtqtagqpnwnqsgtlfegierWAERkallthddvkqRAWQTLKWQIANGIQHVR  117
DSSP  EELLLLllllllllllllllhhhhhhhHHLLhhhllhhhhhhHHHHHHHHHHHLLEEEEE


DSSP  EEELLLllLLHHHHHHHHHHHHLLLL-LLEEEEEEEL-LLLL--LLHHHHHHHHHHLLLL
Query EMCCPSrnDDALEGYQLWKSKAEGNS-YCDYTFHMAV-SKFD--EKTEGQLREIVADGIS  146
ident      |  |  |                 |                 |  | |    |  
Sbjct THVDVS--DATLTALKAMLEVKQEVApWIDLQIVAFPqEGILsyPNGEALLEEALRLGAD  175
DSSP  EEEELL--LLLLHHHHHHHHHHHHHLlLLEEEEEEELlLLLLllLLHHHHHHHHHHLLLL


DSSP  EEEEEELLLLlllLLHHHHHHHHHHHHHHLLEEEEEELlhhhhhhhhhhhhhlllllhhh
Query SFXIFLSYKNffgVDDGEMYQTLRLAKELGVIVTAHCEnaelvgrlqqkllsegktgpew  206
ident                      |  ||         ||                       
Sbjct VVGAIPHFEFtreYGVESLHKTFALAQKYDRLIDVHCD----------------------  213
DSSP  EEEELHHHLLlhhHHHHHHHHHHHHHHHHLLEEEEEEL----------------------


DSSP  llllLLHHHhhHHHHHHHHHHHHHLL--EEEELLLL-LHHH----hhhHHHHHHlLLLEE
Query hepsRPEAVeaEGTARFATFLETTGA--TGYVVHLS-CKPA----ldaAMAAKArGVPIY  259
ident       |          |      |        |                        | 
Sbjct --eiDDEQS--RFVETVAALAHHEGMgaRVTASHTTaMHSYngaytsrLFRLLK-MSGIN  268
DSSP  --llLLLLL--LHHHHHHHHHHHHLLhhHEEEEELHhHHHLlhhhhhhHHHHHH-HHLLE


DSSP  EEEEHHHHHLlhhhhhllhhhhhllllllLLLL------LHHHhHHHHHHHLLLLLEEEL
Query IESVIPHFLLdktyaerggveamkyimspPLRD------KRNQkVLWDALAQGFIDTVGT  313
ident                                         |        |  |     | 
Sbjct FVANPLVNIH-------------------LQGRfdtypkRRGItRVKEMLESGINVCFGH  309
DSSP  EEELHHHHHH-------------------HLLLllllllLLLLlLHHHHHHLLLLEEELL


DSSP  LLLLLlhhhhhhhlllhhhlLLLL-LLLLlHHHHHHHHH----llllLLLHHhHHHHHLH
Query DHCPFdteqkllgkeaftaiPNGI-PAIEdRVNLLYTYG----vsrgRLDIHrFVDAAST  368
ident |                   |             |                         
Sbjct DDVFD---------------PWYPlGTAN-MLQVLHMGLhvcqlmgyGQIND-GLNLITH  352
DSSP  LLLLL---------------LLLLlLLLL-HHHHHHHHHhhlllllhHHHHH-HHHHHLH


DSSP  HHHHHLLlLLLLlLLLLLLLLLEEEEELllleellhhhlllllllllllllEELLEEEEE
Query KAAKLFGlFPRKgTIAVGSDADLVVYDPqyrgtisvktqhvnndyngfegfEIDGRPSVV  428
ident   |           || |  | |                                     
Sbjct HSARTLN-LQDY-GIAAGNSANLIILPA----------------engfdalRRQVPVRYS  394
DSSP  HHHHHLL-LLLL-LLLLLLLLLEEEELL----------------llhhhhhHHLLLLLEE


DSSP  EELLEEEEELLeelllllllllllllllll
Query TVRGKVAVRDGqfvgekgwgkllrrepmyf  458
ident    |||                        
Sbjct VRGGKVIASTQ-paqttvyleqpeaidykr  423
DSSP  EELLEEEEELL-llleeeellleeeellll

No 22: Query=1gkpA Sbjct=3icjA Z-score=22.7

DSSP  -LEEEELLEEE-ELLE-EEELEEEELLLLLLEE-ELLL---LLLL-LLEEEELLLLEEEE
Query -PLLIKNGEII-TADS-RYKADIYAEGETITRI-GQNL---EAPP-GTEVIDATGKYVFP   52
ident       || |                 |              |   | | ||  || | |
Sbjct cMKALINGTIYtSFSPvKKVSGLVISNERVLYAgDSSTalrIAELaGGEIIDLKGKFVMP   60
DSSP  lEEEEELLEEEeEELLeEEELEEEEELLEEEEEeLHHHhhhHHHHhLLEEEELLLLEEEE


DSSP  LEEEEEELLLL-------------------------------------------------
Query GFIDPHVHIYL-------------------------------------------------   63
ident  | | | |                                                    
Sbjct AFFDSHLHLDElgmslemvdlrgvksmeelvervkkgrgriifgfgwdqdelgrwptred  120
DSSP  LEEEEEELHHHhhhhhhleellllllhhhhhhhhhlllllleeeeeelhhhhlllllhhh


DSSP  --------------------------------------------------eELLEE----
Query --------------------------------------------------pFMATF----   69
ident                                                             
Sbjct ldvidrpvflyrrcfhvavmnskmidllnlkpskdfdestgivreraleesRKIINekil  180
DSSP  hlllllleeeeelllleeeelhhhhhhhllllllleelllleeehhhhhhhHHHHHhlll


DSSP  ----lllLHHHHHHHHHHLLEEEEEEEELLlllllhHHHHHHHHHHHL-LLLLLEEEEEE
Query ----akdTHETGSKAALMGGTTTYIEMCCPsrnddaLEGYQLWKSKAE-GNSYCDYTFHM  124
ident          |      |  |      |                      |          
Sbjct tvkdykhYIESAQEHLLSLGVHSVGFMSVG------EKALKALFELEReGRLKMNVFAYL  234
DSSP  lhhhhhhHHHHHHHHHHHLLEEEEEEEEEL------HHHHHHHHHHHHlLLLLLEEEEEE


DSSP  ELLlllllHHHHHH--HHHHLL-----LLEEEEEELL-------------------llll
Query AVSkfdekTEGQLR--EIVADG-----ISSFXIFLSY-------------------knff  158
ident             |              |   | |                          
Sbjct SPE-----LLDKLEelNLGKFEgrrlrIWGVXLFVDGslgartallsepytdnpttsgel  289
DSSP  LHH-----HHHHHHhhLLLLEEllleeEEEEEEELLLlllllllllllllllllllllll


DSSP  LLLHHHHHHHHHHHHHHLLEEEEEELlhhhhhhhhhhhhhlllllhhhllllllhhhHHH
Query GVDDGEMYQTLRLAKELGVIVTAHCEnaelvgrlqqkllsegktgpewhepsrpeavEAE  218
ident      |       || ||  |  |                                    
Sbjct VMNKDEIVEVIERAKPLGLDVAVHAI-------------------------------GDK  318
DSSP  LLLHHHHHHHHHHHLLLLLEEEEEEL-------------------------------LHH


DSSP  HHHHHHHHHHHHLLEEEELLLLLhhHHHHHHHHHHlLLLEEEEEEHHHHHLLhhhhhllh
Query GTARFATFLETTGATGYVVHLSCkpALDAAMAAKArGVPIYIESVIPHFLLDktyaergg  278
ident          |     |   | |     |             |         |        
Sbjct AVDVALDAFEEAEFSGRIEHASL--VRDDQLERIK-ELKVRISAQPHFIVSD--------  367
DSSP  HHHHHHHHHHHHLLLLEEEELLL--LLHHHHHHHH-HHLLEEEELLLHHHHL--------


DSSP  hhhhllllllllLLLH-------HHHHHhhHHHLLL---lLEEELLLLlllhhhhhhhll
Query veamkyimspplRDKR-------NQKVLwdALAQGF---iDTVGTDHCpfdteqkllgke  328
ident                                |            ||              
Sbjct ------------WWIVnrvgeerAKWAY--RLKTLSsitkLGFSTDSP------------  401
DSSP  ------------LLHHhhhhhhhHHHLL--LHHHHHhhllEEELLLLL------------


DSSP  lhhhllllLLLLllHHHHHHHHHLL------llLLLHHHHHHHHLHHHHHHLLLLlLLLL
Query aftaipngIPAIedRVNLLYTYGVS------rgRLDIHRFVDAASTKAAKLFGLFpRKGT  382
ident         |              |         |              |         | 
Sbjct --------IEPA--DPWVSIDAAVNryvvdpgeRVSREEALHLYTHGSAQVTLAE-DLGK  450
DSSP  --------LLLL--LHHHHHHHHHHlllllhhhLLLHHHHHHHLLHHHHHHLLLL-LLLL


DSSP  LLLLLLLLEEEEELLlleellhhhllllllllllllleelleeeeeeelleeeeelleel
Query IAVGSDADLVVYDPQyrgtisvktqhvnndyngfegfeidgrpsvvtvrgkvavrdgqfv  442
ident    |  |     |                                               
Sbjct LERGFRAEYIILDRD---------------------------------------------  465
DSSP  LLLLLLLLEEEELLL---------------------------------------------


DSSP  llllllllllllllll
Query gekgwgkllrrepmyf  458
ident                 
Sbjct -------------plk  468
DSSP  -------------lll

No 23: Query=1gkpA Sbjct=4c5yA Z-score=21.4

DSSP  ----LEEEELLEEE-ELLEEEE-LEEEELLLLLLEEE--LLLL--LLLLL-EEEELllLE
Query ----PLLIKNGEII-TADSRYK-ADIYAEGETITRIG--QNLE--APPGT-EVIDAtgKY   49
ident        |  |  |         |        |   |            |          
Sbjct deakVTIIYAGLLIpGDGEPLRnAALVISDKIIAFVGseADIPkkYLRSTqSTHRV--PV   58
DSSP  llllEEEEEEEEELlLLLLLEEeEEEEEELLEEEEEEehHHLLhhHHHHLlLEEEE--EE


DSSP  EEELEEEEEELLLLE---------ELLEE---LLLLHHHHHHHHHHLLEEEEEEEELlll
Query VFPGFIDPHVHIYLP---------FMATF---AKDTHETGSKAALMGGTTTYIEMCCpsr   97
ident   ||  | | |               ||           |   ||  | | |        
Sbjct LMPGLWDCHMHFGGDddyyndytsGLATHpasSGARLARGCWEALQNGYTSYRDLAG---  115
DSSP  EEELEEEEEELLLLLlllllllhhHHHLLhhhHHHHHHHHHHHHHHLLEEEEEELLL---


DSSP  lllhhhhhhhHHHHHLLL-----LLLEEEEE-EELL------------------------
Query nddalegyqlWKSKAEGN-----SYCDYTFH-MAVS------------------------  127
ident               |                  | |                        
Sbjct ---------yGCEVAKAIndgtiVGPNVYSSgAALSqtaghgdifalpagevlgsygvmn  166
DSSP  ---------lHHHHHHHHhllllLLLEEEELlLEEEllllllllllllhhhhhhhhllll


DSSP  ------------LLLL--LHHHHHHHHHHLLLLEEEEEELL--------llllLLLHHHH
Query ------------KFDE--KTEGQLREIVADGISSFXIFLSY--------knffGVDDGEM  165
ident               |         |     |    |   |                  | 
Sbjct prpgywgagplcIADGveEVRRAVRLQIRRGAKVIXVMASGgvmsrddnpnfaQFSPEEL  226
DSSP  lllllllllleeELLLhhHHHHHHHHHHHHLLLLEEEELLLllllllllllllLLLHHHH


DSSP  HHHHHHHHHHLLEEEEEELlhhhhhhhhhhhhhlllllhhhllllllhhhHHHHHHHHHH
Query YQTLRLAKELGVIVTAHCEnaelvgrlqqkllsegktgpewhepsrpeavEAEGTARFAT  225
ident       |     || ||                                    |      
Sbjct KVIVEEAARQNRIVSAHVH-------------------------------GKAGIMAAIK  255
DSSP  HHHHHHHHHLLLLEEEEEL-------------------------------LHHHHHHHHH


DSSP  HHhhhllEEEELLLLLhhHHHHHHHHHHlLLLEEEEEEHHHHHLLHHHHhllhhhHHLL-
Query FLettgaTGYVVHLSCkpALDAAMAAKArGVPIYIESVIPHFLLDKTYAerggveAMKY-  284
ident             | |   |             |                           
Sbjct AG-----CKSLEHVSY--ADEEVWELMK-EKGILYVATRSVIEIFLASN------GEGLv  301
DSSP  HL-----LLEEEELLL--LLHHHHHHHH-HHLLEEELLHHHHHHHHHHL------LLLLl


DSSP  --llllllLLLHH-HHHHHHHHHLLLLLEEELLLLlllhhhhhhhlllhhhlllllllLL
Query --imspplRDKRN-QKVLWDALAQGFIDTVGTDHCpfdteqkllgkeaftaipngipaIE  341
ident                |    |   |     |||                           
Sbjct keswaklqALADShLKAYQGAIKAGVTIALGTDTA----------------------pGG  339
DSSP  llhhhlllHHHHHhHHHHHHHHHLLLLEELLLLLL----------------------lLL


DSSP  LHHhHHHHHHLlllLLLHHHHHHHHLHHHHHHL--LLLLlLLLLLLLLLLLEEEEELLll
Query DRVnLLYTYGVsrgRLDIHRFVDAASTKAAKLF--GLFPrKGTIAVGSDADLVVYDPQyr  399
ident     |     |            ||   |            |    |  ||         
Sbjct PTA-LELQFAVergGMTPLEAIKAATANAPLSVgpQAPL-TGQLREGYEADVIALEEN--  395
DSSP  LLH-HHHHHHHhllLLLHHHHHHHHLLLHHHHHhhHLLL-LLLLLLLLLLLEEEELLL--


DSSP  eellhhhlllllllllllllEELL-----EEEEEEELLEEEEEL-lEELLLlllllllll
Query gtisvktqhvnndyngfegfEIDG-----RPSVVTVRGKVAVRD-gQFVGEkgwgkllrr  453
ident                      |           |   ||          ||         
Sbjct -----------------pleDIKVfqepkAVTHVWKGGKLFKGPgiGPWGE-------da  431
DSSP  -----------------lllLHHHhhlhhHEEEEEELLEEEELLllLLLLL-------ll


DSSP  lllll
Query epmyf  458
ident      
Sbjct rnpfl  436
DSSP  lllll

No 24: Query=1gkpA Sbjct=2uz9A Z-score=20.1

DSSP  --LEEEELlEEEEL-----LEEEE-LEEEELL-LLLLEEE-LLLL------LLLL-lEEE
Query --PLLIKNgEIITA-----DSRYK-ADIYAEG-ETITRIG-QNLE------APPG-tEVI   43
ident                                    |                     |  
Sbjct plAHIFRG-TFVHStwtcpMEVLRdHLLGVSDsGKIVFLEeASQQeklakeWCFKpcEIR   59
DSSP  llLEEEEE-EEEELlllllLEEEEeEEEEELLlLLEEEEEeHHHHhhhhhhHLLLhhHEE


DSSP  ELL-LLEEEELEEEEEELLLL--------------eELLEE------------lllLHHH
Query DAT-GKYVFPGFIDPHVHIYL--------------pFMATF------------akdTHET   76
ident          ||  | | |                                          
Sbjct ELShHEFFMPGLVDTHIHASQysfagssidlpllewLTKYTfpaehrfqnidfaeeVYTR  119
DSSP  ELLlLLEEEELEEEEEEEHHHhhhllllllllhhhhHHHLHhhhhhhhhlhhhhhhHHHH


DSSP  HHHHHHHLLEEEEEEEELLlllllhhhHHHHHHHHHLL--LLLLEEEEEEELLL------
Query GSKAALMGGTTTYIEMCCPsrnddaleGYQLWKSKAEG--NSYCDYTFHMAVSK------  128
ident      |  ||||                       |                        
Sbjct VVRRTLKNGTTTACYFATI--------HTDSSLLLADItdKFGQRAFVGKVCMDlndtfp  171
DSSP  HHHHHHHLLEEEEEEELLL--------LHHHHHHHHHHhhHHLLEEEEELEELLllllll


DSSP  ----LLLLHHHHHHHHHHLL--------LLEEE-EEELlllllLLLHHHHHHHHHHHHHH
Query ----FDEKTEGQLREIVADG--------ISSFX-IFLSyknffGVDDGEMYQTLRLAKEL  175
ident       |         |                  |             |      ||  
Sbjct eykeTTEESIKETERFVSEMlqknysrvKPIVTpRFSL-----SCSETLMGELGNIAKTR  226
DSSP  llllLHHHHHHHHHHHHHHHhhhlllleEEEEEeLLHH-----HLLHHHHHHHHHHHHHH


DSSP  LLEEEEEE-------lLHHHHHHhhhhhhhlllllhhhllllllhhhhhHHHHHHHHHHh
Query GVIVTAHC-------eNAELVGRlqqkllsegktgpewhepsrpeaveaEGTARFATFLe  228
ident       |                                            |        
Sbjct DLHIQSHIsenrdeveAVKNLYP-----------------------sykNYTSVYDKNN-  262
DSSP  LLEEEEEElllhhhhhHHHHHLL-----------------------lllLHHHHHHHLL-


DSSP  hhllEEEELLLLLhhHHHHHHHHHHlLLLEEEEEEHHHHHLlhhhhhllhhhhhlllllL
Query ttgaTGYVVHLSCkpALDAAMAAKArGVPIYIESVIPHFLLdktyaerggveamkyimsP  288
ident          |                     |       |                    
Sbjct lltnKTVMAHGCY--LSAEELNVFH-ERGASIAHCPNSNLS------------------L  301
DSSP  llllLEEEEELLL--LLHHHHHHHH-HHLLEEEELHHHHHH------------------L


DSSP  LLLllhhhhhHHHHHHL-LLLLEEELLLLlllhhhhhhhlllhhhlllLLLLLlLHHHHH
Query PLRdkrnqkvLWDALAQ-GFIDTVGTDHCpfdteqkllgkeaftaipnGIPAIeDRVNLL  347
ident                         |||                     |           
Sbjct SSG-----flNVLEVLKhEVKIGLGTDVA-------------------GGYSY-SMLDAI  336
DSSP  LLL-----llLHHHHHHlLLEEEELLLLL-------------------LLLLL-LHHHHH


DSSP  HHHH----------llllLLLHHHHHHHHLHHHHHHLLLLLLLLLLLLLLLLLEEEEELL
Query YTYG----------vsrgRLDIHRFVDAASTKAAKLFGLFPRKGTIAVGSDADLVVYDPQ  397
ident                    |        |        ||    |   ||   |     | 
Sbjct RRAVmvsnillinkvnekSLTLKEVFRLATLGGSQALGLDGEIGNFEVGKEFDAILINPK  396
DSSP  HHHHhhhhhhhhllllllLLLHHHHHHHHLHHHHHHLLLLLLLLLLLLLLLLLEEEELLL


DSSP  ---LLEEllhhhllllllllllllleELLE---EEEEEELLEEEeelleELLLlllllll
Query ---YRGTisvktqhvnndyngfegfeIDGR---PSVVTVRGKVAvrdgqFVGEkgwgkll  451
ident                             |       | | ||                  
Sbjct asdSPIDlfygdffgdiseaviqkflYLGDdrnIEEVYVGGKQV-----VPFS-------  444
DSSP  lllLLLLlllhhhhlllllhhhhhhhHHLLhhhEEEEEELLEEE-----ELLL-------


DSSP  lllllll
Query rrepmyf  458
ident        
Sbjct -------  444
DSSP  -------

No 25: Query=1gkpA Sbjct=2ob3A Z-score=18.9

DSSP  leeeelleeeelleeeeleeeelllllleeellllllllleeeelllleeeeLEEEEEEL
Query pllikngeiitadsrykadiyaegetitrigqnleappgtevidatgkyvfpGFIDPHVH   60
ident                                                     ||   | |
Sbjct -------------------------------------drintvrgpitiseaGFTLTHEH   23
DSSP  -------------------------------------lleeelleeelhhhhLLEEEEEL


DSSP  LLLEE-------LLEE-----lllLHHHHHHHHHHLLEEEEEEEELLLllllhhhhhhhH
Query IYLPF-------MATF-----akdTHETGSKAALMGGTTTYIEMCCPSrnddalegyqlW  108
ident |              |            |   |   |  |                    
Sbjct ICGSSagflrawPEFFgsrkalaeKAVRGLRRARAAGVRTIVDVSTFD--------igrD   75
DSSP  LEELLllhhhhlHHHHllhhhhhhHHHHHHHHHHHLLLLEEEELLLHH--------hllL


DSSP  HHHHLLLL---LLEEEEEEELL------LLLL---LHHHHHHHHHHL-------LLLEEE
Query KSKAEGNS---YCDYTFHMAVS------KFDE---KTEGQLREIVAD-------GISSFX  149
ident  |     |                                                   |
Sbjct VSLLAEVSraaDVHIVAATGLWfdpplsMRLRsveELTQFFLREIQYgiedtgiRAGIIX  135
DSSP  HHHHHHHHhhhLLEEELEEELLllllhhHHLLlhhHHHHHHHHHHHLlllllllLLLEEE


DSSP  EEELllllllLLHHHHHHHHHHHHHHLLEEEEEELlhhhhhhhhhhhhhlllllhhhlll
Query IFLSyknffgVDDGEMYQTLRLAKELGVIVTAHCEnaelvgrlqqkllsegktgpewhep  209
ident                     |     || || |                           
Sbjct VATT-gkatpFQELVLKAAARASLATGVPVTTHTA-------------------------  169
DSSP  EELL-llllhHHHHHHHHHHHHHHHHLLLEEEELL-------------------------


DSSP  lllhhHHHHHHHHHHHHHHHHLL---EEEELLL-LLHHhHHHHHHHHHllLLEEEEE-EH
Query srpeaVEAEGTARFATFLETTGA---TGYVVHL-SCKPaLDAAMAAKArgVPIYIES-VI  264
ident               |   |  |         |       |    |  |      |    |
Sbjct -----ASQRDGEQQAAIFESEGLspsRVCIGHSdDTDD-LSYLTALAA--RGYLIGLdHI  221
DSSP  -----HHHLHHHHHHHHHHHLLLlhhHEEELLHhHLLL-HHHHHHHHH--LLLEEEElLL


DSSP  HHhhlLHHHHHLlhhHHHLLLLllLLLLL-hHHHHH-HHHHHL--LLLLEEELLLLLL--
Query PHfllDKTYAERggvEAMKYIMspPLRDK-rNQKVL-WDALAQ--GFIDTVGTDHCPF--  318
ident |         |     |                  |      |       |  |      
Sbjct PY---SAIGLED---NASASAL--LGIRSwqTRALLiKALIDQgyMKQILVSNDWTFGfs  273
DSSP  LL---LLLLLLL---LHHHHHH--HLLLLhhHHHHHhHHHHHLllHHHEEELLLLLLEel


DSSP  -lHHHHhhhlllhhhllllllLLLLHHHHHHHHHLlLLLLLHHHHHHHHLHHHHHHLLll
Query -dTEQKllgkeaftaipngipAIEDRVNLLYTYGVsRGRLDIHRFVDAASTKAAKLFGlf  377
ident                                                   |  |      
Sbjct syVTNI-----mdvmdrvnpdGMAFIPLRVIPFLR-EKGVPQETLAGITVTNPARFLS--  325
DSSP  llLLLH-----hhhhhhhlllHHHHHHHLHHHHHH-HLLLLHHHHHHHHLHHHHHHHL--


DSSP  llllllllllllleeeeelllleellhhhllllllllllllleelleeeeeeelleeeee
Query prkgtiavgsdadlvvydpqyrgtisvktqhvnndyngfegfeidgrpsvvtvrgkvavr  437
ident                                                             
Sbjct ------------------------------------------------------------  325
DSSP  ------------------------------------------------------------


DSSP  lleelllllllllllllLLLL
Query dgqfvgekgwgkllrrePMYF  458
ident                  |   
Sbjct -----------------PTLR  329
DSSP  -----------------LLLL

No 26: Query=1gkpA Sbjct=4rdvB Z-score=18.9

DSSP  lEEEELLEEEELLEEEE-LEEEELL-LLLLEEE--LLLLLlllleEEELLlLEEEELEEE
Query pLLIKNGEIITADSRYK-ADIYAEG-ETITRIG--QNLEAppgteVIDATgKYVFPGFID   56
ident    |                           |    |                | ||   
Sbjct -SAIFAERALLPEGWARnVRFEISAdGVLAEIRpdANADG-----AERLG-GAVLPGMPN   53
DSSP  -LEEEEEEEEELLEEEEeEEEEELLlLLEEEEEllLLLLL-----LEELL-LLEEELEEE


DSSP  EEELLLL----------------------eELLEE-------llLLHHHHHHHHHHLLEE
Query PHVHIYL----------------------pFMATF-------akDTHETGSKAALMGGTT   87
ident  | |                                                  |  | |
Sbjct LHSHAFQramaglaevagnpndsfwtwrelMYRMVarlspeqieVIACQLYIEMLKAGYT  113
DSSP  EEELHHHhhhlllllllllllllhhhhhhhHHHHHllllhhhhhHHHHHHHHHHHHHLEE


DSSP  EEEEEELLL---llllhhHHHHHHHhHHLLLL---LLEEEEEEELLL-------------
Query TYIEMCCPS---rnddalEGYQLWKsKAEGNS---YCDYTFHMAVSK-------------  128
ident    |                  |                |                    
Sbjct AVAEFHYVHhdldgrsyaDPAELSL-RISRAAsaaGIGLTLLPVLYShagfggqpasegq  172
DSSP  EEEEEELLLlllllllllLLLHHHH-HHHHHHhhhLLEEEEEELLLLeeellleellhhh


DSSP  -----LLLLHHHHHHHHHHLL-----LLEEE-EEELlllllLLLHHHHHHHHHHhHHHLL
Query -----FDEKTEGQLREIVADG-----ISSFX-IFLSyknffGVDDGEMYQTLRLaKELGV  177
ident        |     |    |               |       |        |        
Sbjct rrfinGSEAYLELLQRLRAPLeaaghSLGLCfHSLR-----AVTPQQIATVLAA-GHDDL  226
DSSP  lllllLHHHHHHHHHHHHHHHhhhllEELEEeLLLL-----LLLHHHHHHHHLL-LLLLL


DSSP  EEEEEELlhhhhhhhhhhhhhlllllhhhllllLLHHH-------hhHHHHHHHHHHHhh
Query IVTAHCEnaelvgrlqqkllsegktgpewhepsRPEAV-------eaEGTARFATFLEtt  230
ident  |  |                                |                      
Sbjct PVHIHIA-------------------------eQQKEVddcqawsgrRPLQWLYENVA-v  260
DSSP  LEEEEEL-------------------------lLHHHHhhhhhhhllLHHHHHHHHLL-l


DSSP  llEEEELLLLLHH--HHHHHHHHHhllllEEEEEEHH-HHHLlhhhhhllhhhhhlllll
Query gaTGYVVHLSCKP--ALDAAMAAKargvpIYIESVIP-HFLLdktyaerggveamkyims  287
ident       ||          |                      |                  
Sbjct dqRWCLVHATHADpaEVAAMARSG-----AVAGLCLStEANL------------------  297
DSSP  llLEEEEELLLLLhhHHHHHHHHL-----LEEEELHHhHHHL------------------


DSSP  lLLLLlhhhhHHHHHHHLLLLLEEELLLllllhhhhhhhlllhhhllllLLLLllHHHHH
Query pPLRDkrnqkVLWDALAQGFIDTVGTDHcpfdteqkllgkeaftaipngIPAIedRVNLL  347
ident              | ||||     | |                             |   
Sbjct -GDGI----fPATDFLAQGGRLGIGSDS---------------------HVSL--SVVEE  329
DSSP  -LLLL----lLHHHHHHLLLEEEELLLL---------------------LLLL--LHHHH


DSSP  HHH--------hllLLLL-------LHHHHHHHHLHHHHHHLLLllLLLLLLLLLLLLEE
Query YTY--------gvsRGRL-------DIHRFVDAASTKAAKLFGLfpRKGTIAVGSDADLV  392
ident               | ||             |||    |   |     |  |||  ||| 
Sbjct LRWleygqrlrdrkRNRLyrddqpmIGRTLYDAALAGGAQALGQ--PIGSLAVGRRADLL  387
DSSP  HHHhhhhhhhhhllLLLLlllllllHHHHHHHHHHHHHHHHHLL--LLLLLLLLLLLLEE


DSSP  EEELLLleellhhhlllllllllllllEELL--EEEEEEELLEEEEELLEELLL-lllll
Query VYDPQYrgtisvktqhvnndyngfegfEIDG--RPSVVTVRGKVAVRDGQFVGE-kgwgk  449
ident | |                           |      | | |   ||||   ||      
Sbjct VLDGND-----pylasaegdallnrwlFAGGdrQVRDVMVAGRWVVRDGRHAGEersara  442
DSSP  EELLLL-----hhhhllllhhhhhhhhHHLLhhHEEEEEELLEEEELLLLLLLHhhhhhh


DSSP  lllllllll
Query llrrepmyf  458
ident          
Sbjct fvqvlgell  451
DSSP  hhhhhhhhl

No 27: Query=1gkpA Sbjct=3irsA Z-score=18.8

DSSP  leeeelleeeelleeeeleeeelllllleeellllllllleeeelllleeeELEEEEEEL
Query pllikngeiitadsrykadiyaegetitrigqnleappgtevidatgkyvfPGFIDPHVH   60
ident                                                       ||    
Sbjct ---------------------------------------------------LKIIDFRLR    9
DSSP  ---------------------------------------------------LLLEELLLL


DSSP  L----LLEEllEELL----------------------LLHHHHHHHHHHLLEEEEEEEEL
Query I----YLPFmaTFAK----------------------DTHETGSKAALMGGTTTYIEMCC   94
ident       |                                 |         |         
Sbjct PpamgFLNA--RIYTrpdirnrftrqlgfepapsaeeKSLELMFEEMAAAGIEQGVCVGR   67
DSSP  LllhhHHHL--HHHHlhhhhhhhhhhhlllllhhhhhLLHHHHHHHHHHLLLLEEEEELL


DSSP  LLLlllhhhHHHHHHHHHLLLllLEEEEEEELLLLL-LLHHHHHHHHHHLLLLEEEEEEL
Query PSRnddaleGYQLWKSKAEGNsyCDYTFHMAVSKFD-EKTEGQLREIVADGISSFXIFLS  153
ident  |               |                        |  ||   ||        
Sbjct NSS-vlgsvSNADVAAVAKAY-pDKFHPVGSIEAATrKEAMAQMQEILDLGIRIVNLEPG  125
DSSP  EEL-lleelLHHHHHHHHHHL-lLLEEEEEELLLLLhHHHHHHHHHHHHLLLLLEEELHH


DSSP  LLLlLLLL--HHHHHHHHHHHHHHLLEEEEEE--lLHHHHhhhhhhhhhlllllhhhlll
Query YKNfFGVD--DGEMYQTLRLAKELGVIVTAHC--eNAELVgrlqqkllsegktgpewhep  209
ident           |   |         |  |                                
Sbjct VWA-TPMHvdDRRLYPLYAFCEDNGIPVIMMTggnAGPDI--------------------  164
DSSP  HLL-LLLLllLHHHHHHHHHHHHLLLLEEEELlllLLLLH--------------------


DSSP  lllhhHHHHhhHHHHHHHHHHL-LEEEELLL---lLHHHHHHHHHHHhlllLEEEEEEhH
Query srpeaVEAEgtARFATFLETTG-ATGYVVHL---sCKPALDAAMAAKargvPIYIESViP  265
ident                  |      |    |            |          |      
Sbjct ----tYTNP--EHIDRVLGDFPdLTVVSSHGnwpwVQEIIHVAFRRP----NLYLSPD-M  213
DSSP  ----hHHLH--HHHHHHHHHLLlLLEEEEHHhlllHHHHHHHHHHLL----LEEEELH-H


DSSP  HHHLLhhhhhllhhhhhlllllllllllHHHHHHHHHHHLLL--LLEEELLLLlllhhhh
Query HFLLDktyaerggveamkyimspplrdkRNQKVLWDALAQGF--IDTVGTDHCpfdteqk  323
ident                                     |           ||          
Sbjct YLYNL-----------------------PGHADFIQAANSFLadRMLFGTAYP-------  243
DSSP  HHLLL-----------------------LLHHHHHHHHLLHHhhLLLLLLLLL-------


DSSP  hhhlllhhhllllLLLLLLHHHHHHHHHlllllLLHHHHHHHHLHHHHHHLLllllllll
Query llgkeaftaipngIPAIEDRVNLLYTYGvsrgrLDIHRFVDAASTKAAKLFGlfprkgti  383
ident                          |                    |  |          
Sbjct -------------MCPLKEYTEWFLTLP-----IKPDAMEKILHGNAERLLA--------  277
DSSP  -------------LLLHHHHHHHHHLLL-----LLHHHHHHHHLHHHHHHHH--------


DSSP  llllllleeeeelllleellhhhllllllllllllleelleeeeeeelleeeeelleell
Query avgsdadlvvydpqyrgtisvktqhvnndyngfegfeidgrpsvvtvrgkvavrdgqfvg  443
ident                                                             
Sbjct ------------------------------------------------------------  277
DSSP  ------------------------------------------------------------


DSSP  lllllllllLLLLll
Query ekgwgkllrREPMyf  458
ident                
Sbjct ---------QAGR--  281
DSSP  ---------HLLL--

No 28: Query=1gkpA Sbjct=3cjpA Z-score=18.8

DSSP  leeeelleeeelleeeeleeeelllllleeellllllllleeeelllleeeeLEEEEEEL
Query pllikngeiitadsrykadiyaegetitrigqnleappgtevidatgkyvfpGFIDPHVH   60
ident                                                       || | |
Sbjct ----------------------------------------------------LIIDGHTH    8
DSSP  ----------------------------------------------------LLEEEEEE


DSSP  LLleelleellLLHHHHHHHHHHLLEEEEEEEELL-------------------------
Query IYlpfmatfakDTHETGSKAALMGGTTTYIEMCCP-------------------------   95
ident               |   |     |    |                              
Sbjct VI---------LPVEKHIKIMDEAGVDKTILFSTSihpetavnlrdvkkemkklndvvng   59
DSSP  LL---------LLHHHHHHHHHHHLLLEEEEELLLllhhhlllhhhhhhhhhhhhhhhll


DSSP  --LLLL-LHHHHHHHHHHHHLLLLlLEEEEEEELLLLLL--LHHHHHHHH-HHLLLLEEE
Query --SRND-DALEGYQLWKSKAEGNSyCDYTFHMAVSKFDE--KTEGQLREI-VADGISSFX  149
ident                            |     |        |     |  |        
Sbjct ktNSMIdVRRNSIKELTNVIQAYP-SRYVGFGNVPVGLSenDTNSYIEENiVNNKLVGIG  118
DSSP  llLLLHhHHHHHHHHHHHHHHHLL-LLEEEEELLLLLLLhhHHHHHHHHHlLLLLLLEEE


DSSP  -EEELlllllllLHHHHHHHHHHHHHH-LLEEEEEELLHhhhhhhhhhhhhlllllhhhl
Query -IFLSyknffgvDDGEMYQTLRLAKEL-GVIVTAHCENAelvgrlqqkllsegktgpewh  207
ident                                   |  |                      
Sbjct eLTPA-----sgQIKSLKPIFKYSMDSgSLPIWIHAFNP---------------------  152
DSSP  eELLL-----llLHHHHHHHHHHHHHLlLLLEEELLLLL---------------------


DSSP  lllllhhHHHHHHHHHHHHHHHHL-LEEEELLLLLHhHHHHHHHHHHLLLLEEEEEEhHH
Query epsrpeaVEAEGTARFATFLETTG-ATGYVVHLSCKpALDAAMAAKARGVPIYIESViPH  266
ident                 |              |         |          |       
Sbjct -------LVLQDIKEIAELCKAFPkVPVILGHMGGS-NWMTAVELAKEIQNLYLDTS-AY  203
DSSP  -------LLHHHHHHHHHHHHHLLlLLEEEHHHHHH-HHHHHHHHHHHLLLEEEELL-LL


DSSP  HHllhhhhhllhhhhhlllllllllllhhHHHHHHHHHLLL-LLEEELLLLlllhhhhhh
Query FLldktyaerggveamkyimspplrdkrnQKVLWDALAQGF-IDTVGTDHCpfdteqkll  325
ident |                              ||             |||           
Sbjct FS---------------------------TFVLKIVINELPlKCIFGTDMP---------  227
DSSP  LL---------------------------HHHHHHHHHHLLlLEELLLLLL---------


DSSP  hlllhhhllllLLLLLLHHHHHHHHHlllllLLHHHHHHHHLHHHHHHLLLlllllllll
Query gkeaftaipngIPAIEDRVNLLYTYGvsrgrLDIHRFVDAASTKAAKLFGLfprkgtiav  385
ident                                 |              |            
Sbjct -----------FGDLQLSIEAIKKMS-----NDSYVANAVLGDNISRLLNI---------  262
DSSP  -----------LLLHHHHHHHHHHHL-----LLHHHHHHHHLHHHHHHHLL---------


DSSP  llllleeeeelllleellhhhllllllllllllleelleeeeeeelleeeeelleellll
Query gsdadlvvydpqyrgtisvktqhvnndyngfegfeidgrpsvvtvrgkvavrdgqfvgek  445
ident                                                             
Sbjct ------------------------------------------------------------  262
DSSP  ------------------------------------------------------------


DSSP  lllllllllllll
Query gwgkllrrepmyf  458
ident              
Sbjct -------------  262
DSSP  -------------

No 29: Query=1gkpA Sbjct=1bf6A Z-score=18.1

DSSP  leeeelleeeelleeeeleeeelllllleeellllllllleeeelllleeeELEEEEEEL
Query pllikngeiitadsrykadiyaegetitrigqnleappgtevidatgkyvfPGFIDPHVH   60
ident                                                     |    | |
Sbjct -----------------------------------------------sfdpTGYTLAHEH   13
DSSP  -----------------------------------------------llllLLEEEEEEL


DSSP  LLLEELL------EELLLL--HHHHHHHHHHLLEEEEEEEELLLllllhhhhhhhHHHHH
Query IYLPFMA------TFAKDT--HETGSKAALMGGTTTYIEMCCPSrnddalegyqlWKSKA  112
ident                                 |    |||                    
Sbjct LHIDLSGfknnvdCRLDQYafICQEMNDLMTRGVRNVIEMTNRY--------mgrNAQFM   65
DSSP  LLEELHHhhllhhHEELLHhhHHHHHHHHHHLLEEEEEELLLHH--------hllLHHHH


DSSP  LLLL---LLEEEEEEELL-----------llLLLHHHHHHHHHHL-------LLLEEE-E
Query EGNS---YCDYTFHMAVS-----------kfDEKTEGQLREIVAD-------GISSFX-I  150
ident                                                            |
Sbjct LDVMretGINVVACTGYYqdaffpehvatrsVQELAQEMVDEIEQgidgtelKAGIIAeI  125
DSSP  HHHHhhhLLEEEEEELLLlhhhlllhhhhllHHHHHHHHHHHHHLlllllllLEEEEEeE


DSSP  EELLlllllLLHHHHHHHHHHHHHHLLEEEEEELlhhhhhhhhhhhhhlllllhhhllll
Query FLSYknffgVDDGEMYQTLRLAKELGVIVTAHCEnaelvgrlqqkllsegktgpewheps  210
ident   |                      |     |                            
Sbjct GTSEgkitpLEEKVFIAAALAHNQTGRPISTHTS--------------------------  159
DSSP  ELLLllllhHHHHHHHHHHHHHHHHLLLEEEELH--------------------------


DSSP  llhhhHHHHHHHHHHHHHHHLL---EEEELLLL---LHHHHHHHHHHHhllllEEEEEEH
Query rpeavEAEGTARFATFLETTGA---TGYVVHLS---CKPALDAAMAAKargvpIYIESVI  264
ident                 |   |       | |                       |     
Sbjct -----FSTMGLEQLALLQAHGVdlsRVTVGHCDlkdNLDNILKMIDLG-----AYVQFDT  209
DSSP  -----HHLLHHHHHHHHHHLLLlhhHEEELLLLlllLHHHHHHHHHLL-----LEEEELL


DSSP  HhhHLLHhhhhllhhhhhllllllLLLLLHHHHHHHHHH--hLLLLLEEELLLLLLLhhh
Query PhfLLDKtyaerggveamkyimspPLRDKRNQKVLWDAL--aQGFIDTVGTDHCPFDteq  322
ident                            |      |                |        
Sbjct I--GKNS-----------------YYPDEKRIAMLHALRdrgLLNRVMLSMDITRRS---  247
DSSP  L--LLLL-----------------LLLHHHHHHHHHHHHhllLHHHEEELLLLLLHH---


DSSP  hhhhlllhhhlllllLLLLLHHHHHHHHHLlLLLLLHHHHHHHHLHHHHHHLLlllllll
Query kllgkeaftaipngiPAIEDRVNLLYTYGVsRGRLDIHRFVDAASTKAAKLFGlfprkgt  382
ident                                                    |        
Sbjct --------hlkanggYGYDYLLTTFIPQLR-QSGFSQADVDVMLRENPSQFFQ-------  291
DSSP  --------hlhhhllLLLLHHHHLHHHHHH-HLLLLHHHHHHHHLHHHHHHLL-------


DSSP  lllllllleeeeelllleellhhhllllllllllllleelleeeeeeelleeeeelleel
Query iavgsdadlvvydpqyrgtisvktqhvnndyngfegfeidgrpsvvtvrgkvavrdgqfv  442
ident                                                             
Sbjct ------------------------------------------------------------  291
DSSP  ------------------------------------------------------------


DSSP  llllllllllllllll
Query gekgwgkllrrepmyf  458
ident                 
Sbjct ----------------  291
DSSP  ----------------

No 30: Query=1gkpA Sbjct=2dvtA Z-score=17.4

DSSP  leeeelleeeelleeeeleeeelllllleeellllllllleeeelllleeEELEEEEEEL
Query pllikngeiitadsrykadiyaegetitrigqnleappgtevidatgkyvFPGFIDPHVH   60
ident                                                     |      |
Sbjct --------------------------------------------------MQGKVALEEH   10
DSSP  --------------------------------------------------LLLEEEEEEE


DSSP  lLLEE--LLEE---------------LLLLHHHHHHHHHHLLEEEEEEEEL--LLLL---
Query iYLPF--MATF---------------AKDTHETGSKAALMGGTTTYIEMCC--PSRN---   98
ident                             |   |  |     |  | |             
Sbjct -FAIPetLQDSagfvpgdywkelqhrLLDIQDTRLKLMDAHGIETMILSLNapAVQAipd   69
DSSP  -ELLHhhHHHHlllllllhhhhhhhhHHLLLLHHHHHHHHLLEEEEEEEELllHHHHlll


DSSP  -----LLHHHHHHHHHHHHLLLLlLEEEEEEELLL-LLLLHHHHHHHHHHL-LLLEEEEE
Query -----DDALEGYQLWKSKAEGNSyCDYTFHMAVSK-FDEKTEGQLREIVAD-GISSFXIF  151
ident        |                       |            |   | | |       
Sbjct rrkaiEIARRANDVLAEECAKRP-DRFLAFAALPLqDPDAATEELQRCVNDlGFVGALVN  128
DSSP  hhhhhHHHHHHHHHHHHHHHHLL-LLEEEEELLLLlLHHHHHHHHHHHHHLlLLLEEEEE


DSSP  ELLLL----llLLLH-HHHHHHHHHHHHHLLEEEEEEllhhhHHHHHHHHhhlllLLHHH
Query LSYKN----ffGVDD-GEMYQTLRLAKELGVIVTAHCenaelVGRLQQKLlsegkTGPEW  206
ident               |             | |    |                    |  |
Sbjct GFSQEgdgqtpLYYDlPQYRPFWGEVEKLDVPFYLHP---rnPLPQDSRI----yDGHPW  181
DSSP  LLLLLllllllLLLLlHHHHHHHHHHHHHLLLEEEEL---llLLHHHLHH----hLLLHH


DSSP  LL--llLLHHHHHHHHHHHH--HHHHHHL-LEEEELLLLLHhHHHH--------------
Query HE--psRPEAVEAEGTARFA--TFLETTG-ATGYVVHLSCKpALDA--------------  247
ident             |    |                  |                       
Sbjct LLgptwAFAQETAVHALRLMasGLFDEHPrLNIILGHMGEG-LPYMmwridhrnawvklp  240
DSSP  HLhhhlHHHHHHHHHHHHHHhlLHHHHLLlLLEEELHHHLL-HHHHhhhhhhllllllll


DSSP  --------hHHHHHllLLEEEEEEhHHHHllhhhhhllhhhhhlllllllllllhhHHHH
Query --------aMAAKArgVPIYIESViPHFLldktyaerggveamkyimspplrdkrnQKVL  299
ident          |          |      |                               |
Sbjct prypakrrfMDYFN--ENFHITTS-GNFR---------------------------TQTL  270
DSSP  llllllllhHHHHH--HHEEEELL-LLLL---------------------------HHHH


DSSP  HHHH--hLLLLLEEELLLLlllhhhhhhhlllhhhllllLLLLLLHHHHHHHHHlllllL
Query WDAL--aQGFIDTVGTDHCpfdteqkllgkeaftaipngIPAIEDRVNLLYTYGvsrgrL  357
ident  ||            ||                         |                 
Sbjct IDAIleiGADRILFSTDWP--------------------FENIDHASDWFNATS-----I  305
DSSP  HHHHlllLHHHEELLLLLL--------------------LLLHHHHHHHHHHLL-----L


DSSP  LHHHHHHHHLHHHHHHLLLLllllllllllllleeeeelllleellhhhlllllllllll
Query DIHRFVDAASTKAAKLFGLFprkgtiavgsdadlvvydpqyrgtisvktqhvnndyngfe  417
ident      |    | |  || |                                         
Sbjct AEADRVKIGRTNARRLFKLD----------------------------------------  325
DSSP  LHHHHHHHHLHHHHHHLLLL----------------------------------------


DSSP  lleelleeeeeeelleeeeelleelllllllllllllllll
Query gfeidgrpsvvtvrgkvavrdgqfvgekgwgkllrrepmyf  458
ident                                          
Sbjct -----------------------------------------  325
DSSP  -----------------------------------------

No 31: Query=1gkpA Sbjct=4dlfA Z-score=17.4

DSSP  leeeelleeeelleeeeleeeelllllleeellllllllleeeelllleeeELEEEEEEL
Query pllikngeiitadsrykadiyaegetitrigqnleappgtevidatgkyvfPGFIDPHVH   60
ident                                                       || | |
Sbjct ---------------------------------------------------ALRIDSHQH    9
DSSP  ---------------------------------------------------LLLEEEEEL


DSSP  LlLEELL-------------EELLlLHHHHHHHHHHLLEEEEEEEELLLllllHHHHHHH
Query IyLPFMA-------------TFAKdTHETGSKAALMGGTTTYIEMCCPSrnddALEGYQL  107
ident       |                                   |                 
Sbjct F-WRYRAadypwigagmgvlARDY-LPDALHPLMHAQALGASIAVQARA----GRDETAF   63
DSSP  L-LLLLHhhllllllllhhhLLLL-LHHHHHHHHHHLLLLEEEEELLLL----LHHHHHH


DSSP  HHHHHLLLLlLEEEEEEELLLLLLLHHHHHHHhHHLL-LLEEEEEELLLL-lllLLHH-H
Query WKSKAEGNSyCDYTFHMAVSKFDEKTEGQLREiVADG-ISSFXIFLSYKN-ffgVDDG-E  164
ident     |                          |         |   |          |   
Sbjct LLELACDEA-RIAAVVGWEDLRAPQLAERVAE-WRGTkLRGFRHQLQDEAdvraFVDDaD  121
DSSP  HHHHHLLLL-LEEEEEELLLLLLLLHHHHHHL-LLLLlEEEEEELHHHLLlhhhHHHLhH


DSSP  HHHHHHHHHHHLLEEEEEELlhhhhhhhhhhhhhlllllhhhllllllhhhHHHHhHHHH
Query MYQTLRLAKELGVIVTAHCEnaelvgrlqqkllsegktgpewhepsrpeavEAEGtARFA  224
ident                                                    |        
Sbjct FARGVAWLQANDYVYDVLVF-------------------------------ERQL-PDVQ  149
DSSP  HHHHHHHHHHLLLEEEELLL-------------------------------HHHH-HHHH


DSSP  HHHHHHL-LEEEELL-LLLH------------HHHHHHHHHHHlLLLEEEEEEHHHhhLL
Query TFLETTG-ATGYVVH-LSCK------------PALDAAMAAKArGVPIYIESVIPHflLD  270
ident  |            |                     |     |                 
Sbjct AFCARHDaHWLVLDHaGKPAlaefdrddtalaRWRAALRELAA-LPHVVCKLSGLV-tEA  207
DSSP  HHHHHLLlLLEEEHHhHLLLhhhllllllhhhHHHHHHHHHHL-LLLEEEEELLLL-lLL


DSSP  HHHHHllhhhhhlllllllllLLHHHHHHHHHHHLLL---LLEEELLLLlllhhhhhhhl
Query KTYAErggveamkyimspplrDKRNQKVLWDALAQGF---IDTVGTDHCpfdteqkllgk  327
ident                      | |      ||    |       | |             
Sbjct DWRRG------------lrasDLRHIEQCLDAALDAFgpqRLMFGSDWP-----------  244
DSSP  LLLLL------------llhhHHHHHHHHHHHHHHHHlhhHEEELLLLL-----------


DSSP  llhhhlllLLLL---LLLHHHHHHHHHLllLLLLHHHHHHHHLHHHHHHLLLLlllllll
Query eaftaipnGIPA---IEDRVNLLYTYGVsrGRLDIHRFVDAASTKAAKLFGLFprkgtia  384
ident                      |         ||            ||    |        
Sbjct --------VCLLaasYDEVASLVERWAE--SRLSAAERSALWGGTAARCYALP-------  287
DSSP  --------HHHHlllHHHHHHHHHHHHH--HHLLHHHHHHHLLHHHHHHLLLL-------


DSSP  lllllleeeeelllleellhhhllllllllllllleelleeeeeeelleeeeelleelll
Query vgsdadlvvydpqyrgtisvktqhvnndyngfegfeidgrpsvvtvrgkvavrdgqfvge  444
ident                                                             
Sbjct ------------------------------------------------------------  287
DSSP  ------------------------------------------------------------


DSSP  llllllllllllll
Query kgwgkllrrepmyf  458
ident               
Sbjct --------------  287
DSSP  --------------

No 32: Query=1gkpA Sbjct=3k2gB Z-score=17.3

DSSP  leeeelleeeelleeeeleeeelllllleeellllllllleeeelllleeeeLEEEEEEL
Query pllikngeiitadsrykadiyaegetitrigqnleappgtevidatgkyvfpGFIDPHVH   60
ident                                                     |    | |
Sbjct -------------------------slselspchvrsgrixtvdgpipssalGHTLXHEH   35
DSSP  -------------------------llllllllllllleeeelleeeehhhlLLEELLLL


DSSP  LLLEELL------------------------------------EELLLL--HHHHHHHHH
Query IYLPFMA------------------------------------TFAKDT--HETGSKAAL   82
ident                                                |        |   
Sbjct LQNDCRCwwnppqeperqylaeapisieilselrqdpfvnkhnIALDDLdlAIAEVKQFA   95
DSSP  LLEELHHhllllllhhhhhhhhllllhhhhhhhhllhhhllllLEELLHhhHHHHHHHHH


DSSP  HLLEEEEEEEELLLllllhhhhhhhHHHHHLLLL---LLEEEEEEELL-------lLLLL
Query MGGTTTYIEMCCPSrnddalegyqlWKSKAEGNS---YCDYTFHMAVS-------kFDEK  132
ident   |        |                |    |                          
Sbjct AVGGRSIVDPTCRG--------igrDPVKLRRISaetGVQVVXGAGYYlassxpetAARL  147
DSSP  HLLLLEEEELLLLL--------lllLHHHHHHHHhhhLLEEEELLLLLlhhhllhhHHLL


DSSP  ----HHHHHHHHHHL-------LLLEEE-EEELLLllllLLHHHHHHHHHHHHHHLLEEE
Query ----TEGQLREIVAD-------GISSFX-IFLSYKnffgVDDGEMYQTLRLAKELGVIVT  180
ident                        |     |  |                |     |    
Sbjct saddIADEIVAEALEgtdgtdaRIGLIGeIGVSSD-ftaEEEKSLRGAARAQVRTGLPLX  206
DSSP  lhhhHHHHHHHHHHLlllllllLLLLEEeELLLLL-llhHHHHHHHHHHHHHHHHLLLEE


DSSP  EEELlhhhhhhhhhhhhhlllllhhhllllllhhHHHHhHHHHHHHHHHHLLE---EEEL
Query AHCEnaelvgrlqqkllsegktgpewhepsrpeaVEAEgTARFATFLETTGAT---GYVV  237
ident  |                                       |     |  ||        
Sbjct VHLP-----------------------------gWFRL-AHRVLDLVEEEGADlrhTVLC  236
DSSP  ELLL-----------------------------lLLLL-HHHHHHHHHHLLLLhhhEEEL


DSSP  LL--LLHH--HHHHHHHHHhllllEEEEE-EHHHhhllhhhhhllhhhhhLLLL---llL
Query HL--SCKP--ALDAAMAAKargvpIYIES-VIPHflldktyaerggveamKYIM---spP  289
ident |   |                      |   |                            
Sbjct HXnpSHXDpvYQATLAQRG-----AFLEFdXIGX----------------DFFYadqgvQ  275
DSSP  LLhhHLLLhhHHHHHHHHL-----LEEEElLLLL----------------LLEElllleE


DSSP  LLL-LHHHHHHHHHH--hLLLLLEEELLLLLLLhhhhhhhlllhhhlllllLLLLLHHHH
Query LRD-KRNQKVLWDAL--aQGFIDTVGTDHCPFDteqkllgkeaftaipngiPAIEDRVNL  346
ident                            |                                
Sbjct CPSdDEVARAILGLAdhgYLDRILLSHDVFVKX-----------xltryggNGYAFVTKH  324
DSSP  LLLhHHHHHHHHHHHhllLHHHEEELLLLLLHH-----------hlhhhllLLLLHHHHL


DSSP  HHHHHLlLLLLLHHHHHHHHLHHHHHHLLllllllllllllllleeeeelllleellhhh
Query LYTYGVsRGRLDIHRFVDAASTKAAKLFGlfprkgtiavgsdadlvvydpqyrgtisvkt  406
ident        |  ||         |     |                                
Sbjct FLPRLR-RHGLDDAALETLXVTNPRRVFD-------------------------------  352
DSSP  HHHHHH-HLLLLHHHHHHHHLHHHHHHHL-------------------------------


DSSP  llllllllllllleelleeeeeeelleeeeelleelllllllllllllllll
Query qhvnndyngfegfeidgrpsvvtvrgkvavrdgqfvgekgwgkllrrepmyf  458
ident                                                     
Sbjct ----------------------------------------------asiegh  358
DSSP  ----------------------------------------------llllll

No 33: Query=1gkpA Sbjct=2vc5A Z-score=17.3

DSSP  leeeelleeeelleeeeleeeelllllleeellllllllleeeelllleeeeLEEEEEEL
Query pllikngeiitadsrykadiyaegetitrigqnleappgtevidatgkyvfpGFIDPHVH   60
ident                                                     ||   | |
Sbjct ------------------------------------mriplvgkdsieskdiGFTLIHEH   24
DSSP  ------------------------------------llllllllllllhhhlLLEELLLL


DSSP  LLLEELLE-----------elllLHHHHHHHHHHLLEEEEEEEELLLllllhhhhhhhHH
Query IYLPFMAT-----------fakdTHETGSKAALMGGTTTYIEMCCPSrnddalegyqlWK  109
ident       |                      | |   |  |                     
Sbjct LRVFSEAVrqqwphlynedeefrNAVNEVKRAMQFGVKTIVDPTVMG--------lgrDI   76
DSSP  LLLLLHHHhhhlhhhllhhhhhhHHHHHHHHHHHLLLLEEEELLLLL--------lllLH


DSSP  HHHLLLL---LLEEEEEEELLL-----------lLLLHHHHHHHHHHL-------LLLEE
Query SKAEGNS---YCDYTFHMAVSK-----------fDEKTEGQLREIVAD-------GISSF  148
ident    |                                                        
Sbjct RFMEKVVkatGINLVAGTGIYIyidlpfyflnrsIDEIADLFIHDIKEgiqgtlnKAGFV  136
DSSP  HHHHHHHhllLLEEEELEELLLlllllhhhllllHHHHHHHHHHHHHLlllllllLLLLE


DSSP  EEEELLLllllLLHHHHHHHHHHHHHHLLEEEEEELlhhhhhhhhhhhhhlllllhhhll
Query XIFLSYKnffgVDDGEMYQTLRLAKELGVIVTAHCEnaelvgrlqqkllsegktgpewhe  208
ident ||                      ||  |    |                          
Sbjct XIAADEPgitkDVEKVIRAAAIANKETKVPIITHSN------------------------  172
DSSP  EEELLLLlllhHHHHHHHHHHHHHHHHLLLEEEELL------------------------


DSSP  llllhhHHHHHHHHHHHHHHHHLL---EEEELLL-LLHH--HHHHHHHHHhllllEEEEE
Query psrpeaVEAEGTARFATFLETTGA---TGYVVHL-SCKP--ALDAAMAAKargvpIYIES  262
ident                   |   |         ||                       |  
Sbjct ------AHNNTGLEQQRILTEEGVdpgKILIGHLgDTDNidYIKKIADKG-----SFIGL  221
DSSP  ------LLLLHHHHHHHHHHHLLLlhhHEEELLHhHLLLhhHHHHHHHLL-----LEEEE


DSSP  -EHHHhhllhhhhhllhhhhhllllllLLLL-LHHHHHHHHHHHLLL--LLEEELLLLLL
Query -VIPHflldktyaerggveamkyimspPLRD-KRNQKVLWDALAQGF--IDTVGTDHCPF  318
ident                                              |         | |  
Sbjct dRYGL---------------------dLFLPvDKRNETTLRLIKDGYsdKIMISHDYCCT  260
DSSP  lLLLL---------------------lLLLLhHHHHHHHHHHHHLLLllLEEELLLLLLL


DSSP  lhhhhhhhlllhHHLL--------lllLLLLLHHHHHHHHHLlLLLLLHHHHHHHHLHHH
Query dteqkllgkeafTAIP--------ngiPAIEDRVNLLYTYGVsRGRLDIHRFVDAASTKA  370
ident                              |             |                
Sbjct ----------idWGTAkpeykpklaprWSITLIFEDTIPFLK-RNGVNEEVIATIFKENP  309
DSSP  ----------llLLLLlhhhhhhhlllLLLLHHHHLHHHHHH-LLLLLHHHHHHHHLHHH


DSSP  HHHLLllllllllllllllleeeeelllleellhhhllllllllllllleelleeeeeee
Query AKLFGlfprkgtiavgsdadlvvydpqyrgtisvktqhvnndyngfegfeidgrpsvvtv  430
ident  | |                                                        
Sbjct KKFFS-------------------------------------------------------  314
DSSP  HHHLL-------------------------------------------------------


DSSP  lleeeeelleelllllllllllllllll
Query rgkvavrdgqfvgekgwgkllrrepmyf  458
ident                             
Sbjct ----------------------------  314
DSSP  ----------------------------

No 34: Query=1gkpA Sbjct=4ofcA Z-score=17.2

DSSP  leeeelleeeelleeeeleeeelllllleeellllllllleeeelllleeeeLEEEEEEL
Query pllikngeiitadsrykadiyaegetitrigqnleappgtevidatgkyvfpGFIDPHVH   60
ident                                                       || | |
Sbjct ----------------------------------------------------MKIDIHSH    8
DSSP  ----------------------------------------------------LLEEEEEE


DSSP  LLL--------------eELLE------------------ELLL--LHHHHHHHHHHLLE
Query IYL--------------pFMAT------------------FAKD--THETGSKAALMGGT   86
ident |                                               |         | 
Sbjct ILPkewpdlkkrfgyggwVQLQhhskgeakllkdgkvfrvVRENcwDPEVRIREMDQKGV   68
DSSP  LLLlllllhhhhhlllllEEEEeeelleeeeeelleeeeeEEHHhlLHHHHHHHHHHHLL


DSSP  EEEEEEEL--LLLL--------LLHHHHHHHHHHHHLLLllLEEEEEEELLLLL-LLHHH
Query TTYIEMCC--PSRN--------DDALEGYQLWKSKAEGNsyCDYTFHMAVSKFD-EKTEG  135
ident |                                |                     |    
Sbjct TVQALSTVpvMFSYwakpedtlNLCQLLNNDLASTVVSY-pRRFVGLGTLPMQApELAVK  127
DSSP  LEEEEELLhhHHLLlllhhhhhHHHHHHHHHHHHHHHHL-lLLEEEEELLLLLLhHHHHH


DSSP  HHHHHHHL-LLLEEEEEELLLLllllLHHHhHHHHHHHHHHLLEEEEEEllhhhhhhHHH
Query QLREIVAD-GISSFXIFLSYKNffgvDDGEmYQTLRLAKELGVIVTAHCenaelvgrLQQ  194
ident      |   |     |                     |  |      |            
Sbjct EMERCVKElGFPGVQIGTHVNEwdlnAQEL-FPVYAAAERLKCSLFVHP-----wdmQMD  181
DSSP  HHHHHHHLlLLLEEEEELEELLeellLHHH-HHHHHHHHHHLLEEEEEL-----lllLLL


DSSP  HHhhllllLHHHLL-llLLHHHHHHHHHHHH--HHHHHHL-LEEEELLLLLhHHHH----
Query KLlsegktGPEWHE-psRPEAVEAEGTARFA--TFLETTG-ATGYVVHLSCkPALD----  246
ident            |        |               |          |            
Sbjct GR-----mAKYWLPwlvGMPAETTIAICSMImgGVFEKFPkLKVCFAHGGG-AFPFtvgr  235
DSSP  HH-----hHLLLHHhhlHHHHHHHHHHHHHHllLHHHHLLlLLEEELHHHL-LHHHhhhh


DSSP  ------------------hhHHHHhlllLEEEEEehHHHHllhhhhhllhhhhhllllll
Query ------------------aaMAAKargvPIYIESviPHFLldktyaerggveamkyimsp  288
ident                               |                             
Sbjct ishgfsmrpdlcaqdnpmnpKKYL---gSFYTDA--LVHD--------------------  270
DSSP  hhhhhhhlhhhhlllllllhHHHL---lLLEEEL--LLLL--------------------


DSSP  lllllhhHHHHHHHHH--LLLLLEEELLLLLllhhhhhhhlllhhhlllLLLLllLHHHH
Query plrdkrnQKVLWDALA--QGFIDTVGTDHCPfdteqkllgkeaftaipnGIPAieDRVNL  346
ident           |              |||                               |
Sbjct -------PLSLKLLTDviGKDKVILGTDYPF------------------PLGE-lEPGKL  304
DSSP  -------HHHHHHHHHhhLLLLEELLLLLLL------------------LLLL-lLLLHH


DSSP  HhHHHLlllLLLHHHHHHHHLHHHHHHLLLLLLLlllllllllleeeeelllleellhhh
Query LyTYGVsrgRLDIHRFVDAASTKAAKLFGLFPRKgtiavgsdadlvvydpqyrgtisvkt  406
ident            |           |    ||                              
Sbjct I-ESME---EFDEETKNKLKAGNALAFLGLERKQ--------------------------  334
DSSP  H-HHLL---LLLHHHHHHHHLHHHHHHHLLLHHH--------------------------


DSSP  llllllllllllleelleeeeeeelleeeeelleelllllllllllllllll
Query qhvnndyngfegfeidgrpsvvtvrgkvavrdgqfvgekgwgkllrrepmyf  458
ident                                                     
Sbjct ---------------------------------------------------f  335
DSSP  ---------------------------------------------------l

No 35: Query=1gkpA Sbjct=2imrA Z-score=17.1

DSSP  --LEEEElLEEEElLEEEELEEEELLLLLLEE--ELLL--LLLLlLEEEELLlLEEEELE
Query --PLLIKnGEIITaDSRYKADIYAEGETITRI--GQNL--EAPPgTEVIDATgKYVFPGF   54
ident   | |                    |||         |    |       |      |  
Sbjct htPRLLT-CDVLYtGAQSPGGVVVVGETVAAAghPDELrrQYPH-AAEERAG-AVIAPPP   57
DSSP  llEEEEE-ELEEElLEELLEEEEEELLEEEEEelHHHHhhHLLL-LEEEELL-LEELLLL


DSSP  EEEEELLLLEEL-----------------lEELL--lLHHHHHHHHHHLLEEEEEEEELl
Query IDPHVHIYLPFM-----------------aTFAK--dTHETGSKAALMGGTTTYIEMCCp   95
ident    | |                                   |       |          
Sbjct VNAHTHLDMSAYefqalpyfqwipevvirgRHLRgvaAAQAGADTLTRLGAGGVGDIVW-  116
DSSP  LEEEEELLLLHHhhhhlhhhhllhhhhhhhLLLLhhhHHHHHHHHHHHLLLLLEEEEEL-


DSSP  lllllhhhhHHHHHHHHLLLLLLEEEEEEELLL--------LLLLHHHHHHHHHHLL---
Query srnddalegYQLWKSKAEGNSYCDYTFHMAVSK--------FDEKTEGQLREIVADG---  144
ident                          |    |                  |          
Sbjct ---------APEVMDALLAREDLSGTLYFEVLNpfpdkadeVFAAARTHLERWRRLErpg  167
DSSP  ---------LHHHHHHHHLLLLLLEEEEEEELLllhhhhhhHHHHHHHHHHHHHLLLlll


DSSP  -LLEEE-EEELlllllLLLHHHHHHHHHHHHHHLLEEEEEEL-----------lhhHHHH
Query -ISSFX-IFLSyknffGVDDGEMYQTLRLAKELGVIVTAHCE-----------naeLVGR  191
ident                  |    |      |   |     |                    
Sbjct lRLGLSpHTPF-----TVSHRLMRLLSDYAAGEGLPLQIHVAehptelemfrtgggPLWD  222
DSSP  eEEEEEeLLLL-----LLLHHHHHHHHHHHHHHLLLLEEEELllhhhhhhhhhlllLLHH


DSSP  HHHHhhhlllllhhhllllllhhhhhHHHHHHH--HHHHhhlLEEEELLLLLHHhhHHHH
Query LQQKllsegktgpewhepsrpeaveaEGTARFA--TFLEttgATGYVVHLSCKPalDAAM  249
ident                                      |    |    ||       |   
Sbjct NRMP---alyphtlaevigrepgpdlTPVRYLDelGVLA---ARPTLVHMVNVT-pDDIA  275
DSSP  HLLH---hhllllhhhhhllllllllLHHHHHHhhLLHH---HLLEEEELLLLL-hHHHH


DSSP  HHHHllLLEEEEEEHHHHHLlhhhhhllhhhhhllllllLLLLlhhhhhHHHHHHL-LLL
Query AAKArgVPIYIESVIPHFLLdktyaerggveamkyimspPLRDkrnqkvLWDALAQ-GFI  308
ident                                                   | | |  |  
Sbjct RVAR--AGCAVVTCPRSNHH-------------------LECG----tfDWPAFAAaGVE  310
DSSP  HHHH--HLLLEEELHHHHHH-------------------LLLL----llLHHHHHHlLLL


DSSP  LEEELLLLLllhhhhhhhlllhhhlllLLLLLlLHHHHHHHhHLLL-LLLLHHHHHHHHL
Query DTVGTDHCPfdteqkllgkeaftaipnGIPAIeDRVNLLYTyGVSR-GRLDIHRFVDAAS  367
ident    |||                                           ||    | || 
Sbjct VALGTDSVA------------------SGETL-NVREEVTF-ARQLyPGLDPRVLVRAAV  350
DSSP  EEELLLLHH------------------HHLLL-LLHHHHHH-HHHHlLLLLHHHHHHHHH


DSSP  HHHHHHLLlllllLLLLL-LLLL-lEEEEelllleellhhhllllllllllllleelleE
Query TKAAKLFGlfprkGTIAV-GSDA-dLVVYdpqyrgtisvktqhvnndyngfegfeidgrP  425
ident        |           |                                        
Sbjct KGGQRVVG-----TPFLRrGETWqeGFRW------------------------------E  375
DSSP  HHHHHHHL-----LLLLLlLLLLlhHHLH------------------------------H


DSSP  EEEeelleeeeelleelllllllllllllllll
Query SVVtvrgkvavrdgqfvgekgwgkllrrepmyf  458
ident                                  
Sbjct LSR----------------------------dl  380
DSSP  HLL----------------------------ll

No 36: Query=1gkpA Sbjct=4hk5D Z-score=16.9

DSSP  leeeelleeeelleeeeleeeelllllleeellllllllleeeelllleeEELEEEEEEL
Query pllikngeiitadsrykadiyaegetitrigqnleappgtevidatgkyvFPGFIDPHVH   60
ident                                                    |   | | |
Sbjct --------------------------------------------------TPVVVDIHTH   10
DSSP  --------------------------------------------------LLLLEEEEEE


DSSP  LLLE------------ELLE-----------------------------------ELLL-
Query IYLP------------FMAT-----------------------------------FAKD-   72
ident  | |                                                        
Sbjct MYPPsyiamlekrqtiPLVRtfpqadeprlillsselaaldaaladpaaklpgrpLSTHf   70
DSSP  ELLHhhhhhhhlllllLEEEeelleeeeeeellhhhhhhhhhhhhlllllllleeLLHHh


DSSP  -LHHHHHHHHHHLLEEEEEEEE--lLLLLL-------LHHHHHHHHHHHHLLLlllEEEE
Query -THETGSKAALMGGTTTYIEMC--cPSRND-------DALEGYQLWKSKAEGNsycDYTF  122
ident              |                        |                    |
Sbjct aSLAQKMHFMDTNGIRVSVISLanpWFDFLapdeapgIADAVNAEFSDMCAQH-vgRLFF  129
DSSP  lLHHHHHHHHHHLLLLEEEEEElllLLLLLllllhhhHHHHHHHHHHHHHHLL-llLEEE


DSSP  EEELLL--lLLLHHHHHHHHHHLL-LLEEEEEElllllLLLL----HHHHHHHHHHHHHH
Query HMAVSK--fDEKTEGQLREIVADG-ISSFXIFLsyknfFGVD----DGEMYQTLRLAKEL  175
ident   |                                    |      |             
Sbjct FAALPLsapVDAVKASIERVKNLKyCRGIILGT-----SGLGkgldDPHLLPVFEAVADA  184
DSSP  EEELLLlllHHHHHHHHHHHHLLLlEEEEEELL-----LLLLllllLHHHHHHHHHHHHL


DSSP  LLEEEEEELLhhhHHHHhHHHHhLLLLLHHhLLLL---LLHHHHHHHHHHHH--HHHHHH
Query GVIVTAHCENaelVGRLqQKLLsEGKTGPEwHEPS---RPEAVEAEGTARFA--TFLETT  230
ident    |  |                        |                ||          
Sbjct KLLVFLHPHY---GLPN-EVYG-PRSEEYG-HVLPlalGFPMETTIAVARMYmaGVFDHV  238
DSSP  LLEEEELLLL---LLLH-HHHL-LLHHHLL-LHHHhhlHHHHHHHHHHHHHHhlLHHHHL


DSSP  L-LEEEELLLLLhHHHH--------------------------hhHHHHHllLLEEEEEE
Query G-ATGYVVHLSCkPALD--------------------------aaMAAKArgVPIYIESV  263
ident         |                                             ||   |
Sbjct RnLQMLLAHSGG-TLPFlagriescivhdghlvktgkvpkdrrtiWTVLK--EQIYLDAV  295
DSSP  LlLLEEEHHHHL-LHHHhhhhhhhhhhllhhhhhllllllllllhHHHHH--HLEEEELL


DSSP  hhHHHLlhhhhhllhhhhhlllllllllllhhhHHHHHHH--hLLLLLEEELLLLlllhh
Query ipHFLLdktyaerggveamkyimspplrdkrnqKVLWDAL--aQGFIDTVGTDHCpfdte  321
ident                                    |  |           ||||      
Sbjct --IYSE---------------------------VGLQAAIassGADRLMFGTDHP-----  321
DSSP  --LLLH---------------------------HHHHHHHhhhLHHHEELLLLLL-----


DSSP  hhhhhlllhhhlllLLLL-------lLLHHHHHHHHHLllLLLL--HHHHHHHHLHHHHH
Query qkllgkeaftaipnGIPA-------iEDRVNLLYTYGVsrGRLD--IHRFVDAASTKAAK  372
ident                 |          |   |                         |  
Sbjct --------------FFPPieedvqgpWDSSRLNAQAVI--KAVGegSSDAAAVMGLNAVR  365
DSSP  --------------LLLLllllllllLHHHHHHHHHHH--HHHLllLHHHHHHHLHHHHH


DSSP  HLLLLLLLlllllLLLLleeeeelllleellhhhllllllllllllleelleeeeeeell
Query LFGLFPRKgtiavGSDAdlvvydpqyrgtisvktqhvnndyngfegfeidgrpsvvtvrg  432
ident    |                                                        
Sbjct VLSLKAEL-----EHHH-------------------------------------------  377
DSSP  HLLLHHHH-----HHHH-------------------------------------------


DSSP  eeeeelleelllllllllllllllll
Query kvavrdgqfvgekgwgkllrrepmyf  458
ident                           
Sbjct -----------------------hhh  380
DSSP  -----------------------hhl

No 37: Query=1gkpA Sbjct=2ffiA Z-score=16.8

DSSP  leeeelleeeelleeeeleeeelllllleeellllllllleeeelllleeeELEEEEEEL
Query pllikngeiitadsrykadiyaegetitrigqnleappgtevidatgkyvfPGFIDPHVH   60
ident                                                       || | |
Sbjct -------------------------------------------------lhLTAIDSHAH   11
DSSP  -------------------------------------------------llLLLEELLLL


DSSP  LL-------leELLEE-LLLLHHHHHHHHHHLLEEEEEEEELLLllllhhhHHHHHHHHH
Query IY-------lpFMATF-AKDTHETGSKAALMGGTTTYIEMCCPSrnddaleGYQLWKSKA  112
ident                                 |                        |  
Sbjct VFsrglnlasqRRYAPnYDAPLGDYLGQLRAHGFSHGVLVQPSF----lgtDNRYLLSAL   67
DSSP  LLlhhhhhhllLLLLLlLLLLHHHHHHHHHHLLLLEELLLLLHH----hllLLHHHHHHH


DSSP  LLLlllEEEEEEELlLLLLlHHHHHHHHHHLLLLEEEEEELLLLllLLLH--HHHHHHHH
Query EGNsycDYTFHMAVsKFDEkTEGQLREIVADGISSFXIFLSYKNffGVDD--GEMYQTLR  170
ident                  |      | |    |       |        |         | 
Sbjct QTV-pgQLRGVVXL-ERDV-EQATLAEXARLGVRGVRLNLXGQD--XPDLtgAQWRPLLE  122
DSSP  HHL-llLLLLLLLL-LLLL-LHHHHHHHHLLLLLEEELLLLLLL--LLLLllLLLHHHHH


DSSP  HHHHHLLEEEEEELlhhhhhhhhhhhhhlllllhhhllllllhhhHHHHhHHHHHHHHHH
Query LAKELGVIVTAHCEnaelvgrlqqkllsegktgpewhepsrpeavEAEGtARFATFLETT  230
ident    | |  |  |                                  |         |   
Sbjct RIGEQGWHVELHRQ-------------------------------VADI-PVLVRALQPY  150
DSSP  HHHHHLLEEEELLL-------------------------------LLLH-HHHHHHHLLL


DSSP  LLEEEELL-LLLH-------HHHHHH-HHHHhlLLLEEEEEEHHHhhllhhhhhllhhhh
Query GATGYVVH-LSCK-------PALDAA-MAAKarGVPIYIESVIPHflldktyaerggvea  281
ident |      |            |                                       
Sbjct GLDIVIDHfGRPDarrglgqPGFAELlTLSG--RGKVWVKVSGIY---------------  193
DSSP  LLLEEELHhHLLLlllllllLLHHHHlLLLL--LLLEEEEEELHH---------------


DSSP  hllllllLLLLL-----HHHHHHHHHHHLLL---lLEEELLLLLllhhhhhhhlllhhhl
Query mkyimspPLRDK-----RNQKVLWDALAQGF---iDTVGTDHCPfdteqkllgkeaftai  333
ident         |                ||           | |                   
Sbjct -------RLQGSpeenlAFARQALCALEAHYgaerLXWGSDWPH----------------  230
DSSP  -------HLLLLhhhhhHHHHHHHHHHHHHLlhhhEEEELLLLL----------------


DSSP  LLLL--LLLLLHHHHHHHHHlllllLLHHHHHHHHLHHHHHHLLLLLLllllllllllle
Query PNGI--PAIEDRVNLLYTYGvsrgrLDIHRFVDAASTKAAKLFGLFPRkgtiavgsdadl  391
ident             |      |                  |  |||                
Sbjct TQHEseVSFGSAVEQFEALG-----CSAQLRQALLLDTARALFGFELE------------  273
DSSP  LLLLllLLHHHHHHHHHHHL-----LLHHHHHHHHLHHHHHHLLLLLL------------


DSSP  eeeelllleellhhhllllllllllllleelleeeeeeelleeeeelleellllllllll
Query vvydpqyrgtisvktqhvnndyngfegfeidgrpsvvtvrgkvavrdgqfvgekgwgkll  451
ident                                                             
Sbjct ------------------------------------------------------------  273
DSSP  ------------------------------------------------------------


DSSP  lllllll
Query rrepmyf  458
ident        
Sbjct -------  273
DSSP  -------

No 38: Query=1gkpA Sbjct=4qrnA Z-score=16.7

DSSP  leeeelleeeelleeeeleeeelllllleeellllllllleeeellllEEEELEEEEEEL
Query pllikngeiitadsrykadiyaegetitrigqnleappgtevidatgkYVFPGFIDPHVH   60
ident                                                       |     
Sbjct --------------------------------------smtqdlktggEQGYLRIATEEA   22
DSSP  --------------------------------------llllllllllLLLLLLEEEEEE


DSSP  lLLEE----------------------LLEE--------------LLLLHHHHHHHHHHL
Query iYLPF----------------------MATF--------------AKDTHETGSKAALMG   84
ident                                                |  |         
Sbjct -FATReiidvylrmirdgtadkgmvslWGFYaqspseratqilerLLDLGERRIADMDAT   81
DSSP  -ELLHhhhhhhhhhhhhllllhhhhhhHHHHhhlllhhhhhhhhhHHLLLHHHHHHHHHL


DSSP  LEEEEEEEEL--LLLL--------LLHHHHHHHHHHHHLLLLlLEEEEEEELLLLL-LLH
Query GTTTYIEMCC--PSRN--------DDALEGYQLWKSKAEGNSyCDYTFHMAVSKFD-EKT  133
ident |    |                    |                        |   | |  
Sbjct GIDKAILALTspGVQPlhdldearTLATRANDTLADACQKYP-DRFIGMGTVAPQDpEWS  140
DSSP  LLLEEEEEELllLLLLlllhhhhhHHHHHHHHHHHHHHHHLL-LLEEELLLLLLLLhHHH


DSSP  HHHHHHHHHL-LLLEEEEEELLLLllllLHHHhHHHHHHHHHHLLEEEEEEllhhHHHHH
Query EGQLREIVAD-GISSFXIFLSYKNffgvDDGEmYQTLRLAKELGVIVTAHCenaeLVGRL  192
ident            |     |                   |   |       |          
Sbjct AREIHRGARElGFKGIQINSHTQGryldEEFF-DPIFRALVEVDQPLYIHP--atSPDSM  197
DSSP  HHHHHHHHHLlLLLLEEELLLLLLllllLHHH-HHHHHHHHHHLLLEEELL--llLLLLL


DSSP  HHHhhhlllllhHHLL--llLLHHHHHHHHHHHH--HHHHHHL-LEEEELLLLLhHHHH-
Query QQKllsegktgpEWHE--psRPEAVEAEGTARFA--TFLETTG-ATGYVVHLSCkPALD-  246
ident                                |                | |         
Sbjct IDP------mleAGLDgaifGFGVETGMHLLRLItiGIFDKYPsLQIMVGHMGE-ALPYw  250
DSSP  LHH------hhhHLLLllllHHHHHHHHHHHHHHhhLHHHHLLlLLEEELHHHH-LHHHh


DSSP  -------------------------hhHHHHHllLLEEEEEEhHHHHllhhhhhllhhhh
Query -------------------------aaMAAKArgVPIYIESViPHFLldktyaerggvea  281
ident                                                             
Sbjct lyrldymhqagvrsqryermkplkktiEGYLK--SNVLVTNS-GVAW-------------  294
DSSP  hhhhhhhhhhhhhlllllllllllllhHHHHH--HLEEEELL-LLLL-------------


DSSP  hlllllllllllhhHHHHHHHHH--LLLLLEEELLLLlllhhhhhhhlllhhhlllLLLL
Query mkyimspplrdkrnQKVLWDALA--QGFIDTVGTDHCpfdteqkllgkeaftaipnGIPA  339
ident                                   |                         
Sbjct --------------EPAIKFCQQvmGEDRVMYAMDYP-------------------YQYV  321
DSSP  --------------HHHHHHHHHhhLHHHEELLLLLL-------------------LLLL


DSSP  lLLHHHHHHHHhllllLLLHHHHHHHHLHHHHHHLLLlllllllllllllleeeeellll
Query iEDRVNLLYTYgvsrgRLDIHRFVDAASTKAAKLFGLfprkgtiavgsdadlvvydpqyr  399
ident   | |                       | | | | |                       
Sbjct -ADEVRAMDAM-----DMSAQTKKKFFQTNAEKWFKL-----------------------  352
DSSP  -HHHHHHHHLL-----LLLHHHHHHHHLHHHHHHLLL-----------------------


DSSP  eellhhhllllllllllllleelleeeeeeelleeeeelleelllllllllllllllll
Query gtisvktqhvnndyngfegfeidgrpsvvtvrgkvavrdgqfvgekgwgkllrrepmyf  458
ident                                                            
Sbjct -----------------------------------------------------------  352
DSSP  -----------------------------------------------------------

No 39: Query=1gkpA Sbjct=2y1hB Z-score=16.7

DSSP  leeeelleeeelleeeeleeeelllllleeellllllllleeeelllleeEELEEEEEEL
Query pllikngeiitadsrykadiyaegetitrigqnleappgtevidatgkyvFPGFIDPHVH   60
ident                                                     |  | | |
Sbjct --------------------------------------------------GVGLVDCHCH   10
DSSP  --------------------------------------------------LLLEEEEEEL


DSSP  LLLeelleELLL-LHHHHHHHHHHLLEEEEEEEELLlllllhHHHHHHHHHHHLLLLllE
Query IYLpfmatFAKD-THETGSKAALMGGTTTYIEMCCPsrnddaLEGYQLWKSKAEGNSycD  119
ident            |         |                               |      
Sbjct LSA-----PDFDrDLDDVLEKAKKANVVALVAVAEH------SGEFEKIMQLSERYN-gF   58
DSSP  LLL-----HHHLlLHHHHHHHHHHLLEEEEEELLLL------HHHHHHHHHHHHHLL-lL


DSSP  EEEEEELL-------------LLLLlHHHHHHHHHhLLLLEE-EEEELLL-------lll
Query YTFHMAVS-------------KFDEkTEGQLREIVaDGISSF-XIFLSYK-------nff  158
ident       |                |            |         |             
Sbjct VLPCLGVHpvqgldqrsvtlkDLDV-ALPIIENYK-DRLLAIgEVGLDFSprfagtgeqk  116
DSSP  EEEEELLLleelllleellhhHHHH-HHHHHHHHL-LLLLEEeEEEEELLllllllhhhh


DSSP  llLHHHHHHHHHHHHHHLLEEEEEELLhhhhhhhhhhhhhlllllhhhllllllhhhhhh
Query gvDDGEMYQTLRLAKELGVIVTAHCENaelvgrlqqkllsegktgpewhepsrpeaveae  218
ident             ||| |   |  |                                    
Sbjct eeQRQVLIRQIQLAKRLNLPVNVHSRS---------------------------------  143
DSSP  hhHHHHHHHHHHHHHHHLLLEEEEEEL---------------------------------


DSSP  HHHHHHHHHHHHLLE-EEELLLLLHhhHHHHHHHHHllLLEEEEEEHHhHHLLhhhhhll
Query GTARFATFLETTGAT-GYVVHLSCKpaLDAAMAAKArgVPIYIESVIPhFLLDktyaerg  277
ident         |   ||                ||                            
Sbjct AGRPTINLLQEQGAEkVLLHAFDGR--PSVAMEGVR--AGYFFSIPPS-IIRS-------  191
DSSP  LHHHHHHHHHHLLLLlEEEELLLLL--HHHHHHHHH--LLLEEEELHH-HHLL-------


DSSP  hhhhhlllllllllllHHHHHHHHHHhLLLLLEEELLLLlllhhhhhhhlllhhhllLLL
Query gveamkyimspplrdkRNQKVLWDALaQGFIDTVGTDHCpfdteqkllgkeaftaipNGI  337
ident                      |   |         ||                       
Sbjct ----------------GQKQKLVKQL-PLTSICLETDSP------------algpekQVR  222
DSSP  ----------------HHHHHHHHHL-LHHHEEELLLLL------------llllllLLL


DSSP  LLLLLHHhHHHHHHLllLLLL---HHHHHHHhLHHHHHHLL-LLLLLlllllllllleee
Query PAIEDRVnLLYTYGVsrGRLD---IHRFVDAaSTKAAKLFG-LFPRKgtiavgsdadlvv  393
ident             |                      | |||  |                 
Sbjct NEPWNIS-ISAEYIA--QVKGisvEEVIEVT-TQNALKLFPkLRHLL-------------  265
DSSP  LLHHHHH-HHHHHHH--HHHLllhHHHHHHH-HHHHHHHLLlHHHHL-------------


DSSP  eelllleellhhhllllllllllllleelleeeeeeelleeeeelleellllllllllll
Query ydpqyrgtisvktqhvnndyngfegfeidgrpsvvtvrgkvavrdgqfvgekgwgkllrr  453
ident                                                             
Sbjct ------------------------------------------------------------  265
DSSP  ------------------------------------------------------------


DSSP  lllll
Query epmyf  458
ident      
Sbjct -----  265
DSSP  -----

No 40: Query=1gkpA Sbjct=4dziC Z-score=16.4

DSSP  leeeelleeeelleeeeleeeelllllleeellllllllleeeellllEEEELEEEEEEL
Query pllikngeiitadsrykadiyaegetitrigqnleappgtevidatgkYVFPGFIDPHVH   60
ident                                                       ||   |
Sbjct ------------------------------------------------ALNYRVIDVDNH   12
DSSP  ------------------------------------------------LLLLLEEEEEEE


DSSP  LLLE-------------------------------------ELLE---------------
Query IYLP-------------------------------------FMAT---------------   68
ident  | |                                                        
Sbjct YYEPldsftrhldkkfkrrgvqmlsdgkrtwavigdrvnhfIPNPtfdpiivpgcldllf   72
DSSP  LLLLlllllllllhhhlllleeeeelllleeeeelleelllLLLLlllleelllllhhhh


DSSP  ----------------------elLLLHHHHHHHHHHLLEEEEEEEE-------------
Query ----------------------faKDTHETGSKAALMGGTTTYIEMC-------------   93
ident                                          |                  
Sbjct rgeipdgvdpaslmkverladhpeYQNRDARIAVMDEQDIETAFMLPtfgcgveealkhd  132
DSSP  hllllllllhhhllleelhhhlhhHLLHHHHHHHHHHHLEEEEEEELlhhhhhhhhllll


DSSP  lllLLLLHHHHHHHHHHHHL-llllLEEEEEEELLLLL-LLHHHHHHHHHHLLLLEEEEE
Query cpsRNDDALEGYQLWKSKAE-gnsyCDYTFHMAVSKFD-EKTEGQLREIVADGISSFXIF  151
ident                                  ||  |            | |       
Sbjct ieaTMASVHAFNLWLDEDWGfdrpdHRIIAAPIVSLADpTRAVEEVDFVLARGAKLVLVR  192
DSSP  hhhHHHHHHHHHHHHHHHLLlllllLLEEELLLLLLLLhHHHHHHHHHHHHLLLLLEELL


DSSP  ELLLL----lllllHHHHHHHHHHHHHHLLEEEEEelLHHHhHHHHHHHHHlllLLHHHL
Query LSYKN----ffgvdDGEMYQTLRLAKELGVIVTAHceNAELvGRLQQKLLSegkTGPEWH  207
ident               |           | || |  |                         
Sbjct PAPVPglvkprslgDRSHDPVWARLAEAGVPVGFHlsDSGY-LHIAAAWGG---AKDPLD  248
DSSP  LLLLLlllllllllLHHHHHHHHHHHHHLLLEEEEllLLLL-HHHHHHLLL---LLLHHH


DSSP  LLLLLHHHHHHHHHHHH--HHHHHHL-LEEEELLLLLHhHHHHHHH--------------
Query EPSRPEAVEAEGTARFA--TFLETTG-ATGYVVHLSCKpALDAAMA--------------  250
ident              |                                              
Sbjct QVLLDDRAIHDTMASMIvhGVFTRHPkLKAVSIENGSY-FVHRLIKrlkkaantqpqyfp  307
DSSP  HHHHLLHHHHHHHHHHHhlLHHHHLLlLLEEEELLLLL-HHHHHHHhhhhhhhhlhhhll


DSSP  -hhHLLL--LEEEEEehhHHHLlhhhhhllhhhhhlllllllllllhhhhHHHHHH--hL
Query -akARGV--PIYIESvipHFLLdktyaerggveamkyimspplrdkrnqkVLWDAL--aQ  305
ident             |                                      |        
Sbjct edpVEQLrnNVWIAP---YYED----------------------------DLPELArviG  336
DSSP  llhHHHHhhHEEELL---LLLL----------------------------LHHHHHhhhL


DSSP  LLLLEEELLLLLllhhhhhhhlllhhhlllLLLLllLHHHHHhHHHLlllLLLHHHHHHH
Query GFIDTVGTDHCPfdteqkllgkeaftaipnGIPAieDRVNLLyTYGVsrgRLDIHRFVDA  365
ident       | |                     |       |                     
Sbjct VDKILFGSDWPH------------------GEGL-aSPVSFT-AELK---GFSESDIRKI  373
DSSP  HHHLLLLLLLLL------------------LLLL-lLHHHHH-HHHL---LLLHHHHHHH


DSSP  HLHHHHHHLLllllllllllllllleeeeelllleellhhhllllllllllllleellee
Query ASTKAAKLFGlfprkgtiavgsdadlvvydpqyrgtisvktqhvnndyngfegfeidgrp  425
ident     |  | |                                                  
Sbjct MRDNALDLLG--------------------------------------------------  383
DSSP  HLHHHHHHHL--------------------------------------------------


DSSP  eeeeelleeeeelleelllllllllllllllll
Query svvtvrgkvavrdgqfvgekgwgkllrrepmyf  458
ident                                  
Sbjct ----------------------------vqvgs  388
DSSP  ----------------------------lllll

No 41: Query=1gkpA Sbjct=4mupB Z-score=16.0

DSSP  leeeelleeeelleeeeleeeelllllleeellllllllleeeelllleeEELEEEEEEL
Query pllikngeiitadsrykadiyaegetitrigqnleappgtevidatgkyvFPGFIDPHVH   60
ident                                                     |  |   |
Sbjct ------------------------------------lvrklsgtapnpafPRGAVDTQMH   24
DSSP  ------------------------------------llllllllllllllLLLLEELLLL


DSSP  LL-------leeLLEE--lLLLHHHHHHHHHHLLEEEEEEEEL--LLLLllhhhhHHHHH
Query IY-------lpfMATF--aKDTHETGSKAALMGGTTTYIEMCC--PSRNddalegYQLWK  109
ident  |                     |         |    |        |            
Sbjct MYlpgypalpggPGLPpgaLPGPEDYRRLMQWLGIDRVIITQGnaHQRD------NGNTL   78
DSSP  LLllllllllllLLLLlllLLLHHHHHHHHHHHLLLEEEEELLhhHLLL------LHHHH


DSSP  HHHLLLLllEEEEEEELlLLLLlHHHHHHHHHHLLLLEEEEEELLLllLLLLHhHHHHHH
Query SKAEGNSycDYTFHMAVsKFDEkTEGQLREIVADGISSFXIFLSYKnfFGVDDgEMYQTL  169
ident                        ||       | |     |             |     
Sbjct ACVAEMG-eAAHAVVII-DATT-TEKDMEKLTAAGTVGARIMDLPG-gAVNLS-ELDAVD  133
DSSP  HHHHHHH-hHEEEEELL-LLLL-LHHHHHHHHHLLEEEEEEELLLL-lLLLHH-HHHHHH


DSSP  HHHHHHLLEEEEEELlhhhhhhhhhhhhhlllllhhhllllllhhHHHHhhHHHHHHHhh
Query RLAKELGVIVTAHCEnaelvgrlqqkllsegktgpewhepsrpeaVEAEgtARFATFLet  229
ident   |      |                                                  
Sbjct ERAHAADWMVAVQFD-----------------------------gNGLLdhLPRLQKI--  162
DSSP  HHHHHLLLEEEEELL-----------------------------hHHHHhhHHHHHLL--


DSSP  hLLEEEELLLL--------lhHHHHHHHHHHHlLLLEEEEEEHHHhhllhhhhhllhhhh
Query tGATGYVVHLS--------ckPALDAAMAAKArGVPIYIESVIPHflldktyaerggvea  281
ident         |            |   |                                  
Sbjct -RSRWVFDHHGkffkgirtdgPEMAALLKLID-RGNLWFKFAGVY---------------  205
DSSP  -LLEEEELHHHhlllllllllHHHHHHHHHHH-HLLEEEEELLHH---------------


DSSP  hllllllLLLL-----LHHHHHHHHHHHLLL-LLEEELLLLL--LLHHhhhhhlllhhhl
Query mkyimspPLRD-----KRNQKVLWDALAQGF-IDTVGTDHCP--FDTEqkllgkeaftai  333
ident                            |        ||                      
Sbjct -------ESSRkswpyADVAAFSRVIAAHAPeRIVWGTNWPHnsVRET------------  246
DSSP  -------HLLLlllllHHHHHHHHHHHHHLHhHEEELLLLLLllLLLH------------


DSSP  llLLLLlLLHHHHHHHHHlllllLLHHHHHHHHLHHHHHHLLLLLLllllllllllleee
Query pnGIPAiEDRVNLLYTYGvsrgrLDIHRFVDAASTKAAKLFGLFPRkgtiavgsdadlvv  393
ident             |           |      |       || | |               
Sbjct aaYPDD-ARLAELTLGWL-----PDEAARHRALVENPEALFKLSPV--------------  286
DSSP  hhLLLH-HHHHHHHHLLL-----LLHHHHHHHHLHHHHHHHLLLLL--------------


DSSP  eelllleellhhhllllllllllllleelleeeeeeelleeeeelleellllllllllll
Query ydpqyrgtisvktqhvnndyngfegfeidgrpsvvtvrgkvavrdgqfvgekgwgkllrr  453
ident                                                             
Sbjct ------------------------------------------------------------  286
DSSP  ------------------------------------------------------------


DSSP  lllll
Query epmyf  458
ident      
Sbjct -----  286
DSSP  -----

No 42: Query=1gkpA Sbjct=2qpxA Z-score=15.8

DSSP  leeeelleeeelleeeeleeeelllllleeellllllllleeeelllleeEELEEEEEEL
Query pllikngeiitadsrykadiyaegetitrigqnleappgtevidatgkyvFPGFIDPHVH   60
ident                                                        | | |
Sbjct ----------------------------------------gxddlsefvdQVPLLDHHCH   20
DSSP  ----------------------------------------lllllhhhhhHLLEEEEEEL


DSSP  LlleelleeLLLL-----------------------------------------------
Query IylpfmatfAKDT-----------------------------------------------   73
ident            |                                                
Sbjct F--------LIDGkvpnrddrlaqvsteadkdypladtknrlayhgflalakefaldann   72
DSSP  L--------LLLLllllhhhhhhhhlllllllllhhhhlllhhhhhhhhhhhhhllllll


DSSP  ----------hhhHHHHHHHLLEEEEEEEELllllllhhhhhhhhhHHHLLLL---LLEE
Query ----------hetGSKAALMGGTTTYIEMCCpsrnddalegyqlwkSKAEGNS---YCDY  120
ident                                                             
Sbjct plaaxndpgyatyNHRIFGHFHFKELLIDTG--------fvpddpiLDLDQTAelvGIPV  124
DSSP  llllllhhhhhhhHHHHHHHLLEEEEEEELL--------lllllllLLHHHHHhhhLLLE


DSSP  EEEEELLL--------------lLLLHHHHHHHHHHLLLLEEEEE-ELLL----------
Query TFHMAVSK--------------fDEKTEGQLREIVADGISSFXIF-LSYK----------  155
ident                                    | |   ||                 
Sbjct KAIYRLEThaedfxlehdnfaawWQAFSNDVKQAKAHGFVGFXSIaAYRVglhlepvnvi  184
DSSP  EEEEEHHHhhhhhhlllllhhhhHHHHHHHHHLLLLLLLLLEEELhHHHLllllllllhh


DSSP  -----------------lllllLHHHHHHHHHHHHHHLLEEEEEELlhhhhhhhhhhhhh
Query -----------------nffgvDDGEMYQTLRLAKELGVIVTAHCEnaelvgrlqqklls  198
ident                        |   |               |                
Sbjct eaaagfdtwkhsgekrltskplIDYXLYHVAPFIIAQDXPLQFHVG--------------  230
DSSP  hhhhhhhhhhhhlllllllhhhHHHHHHHHHHHHHHHLLLEEEEEL--------------


DSSP  lllllhhhlLLLLLHHHHHhhHHHHHHHHHHHL---LEEEELLLLLhhHHHHHHHHHHLL
Query egktgpewhEPSRPEAVEAegTARFATFLETTG---ATGYVVHLSCkpALDAAMAAKARG  255
ident                             |             |         |       
Sbjct -------ygDADTDXYLGN--PLLXRDYLKAFTkkgLKVVLLHCYP--YHREAGYLASVF  279
DSSP  -------llLLLLLHHHLL--HHHHHHHHHHHHhhlLLEEEEELLL--LHHHHHHHHHHL


DSSP  LLEEEEEE--HHHHHLLhhhhhllhhhhhlllllllllllhhHHHHHHHH--hLLLLLEE
Query VPIYIESV--IPHFLLDktyaerggveamkyimspplrdkrnQKVLWDAL--aQGFIDTV  311
ident    |                                        |   |           
Sbjct PNLYFDISllDNLGPSG------------------------aSRVFNEAVelaPYTRILF  315
DSSP  LLEEEELLlhHHHLHHH------------------------hHHHHHHHLlllLHHHEEL


DSSP  ELLLLLllhhhhhhhlllhhhlllllLLLLLHHHHHHHHHlLLLL---------lLHHHH
Query GTDHCPfdteqkllgkeaftaipngiPAIEDRVNLLYTYGvSRGR---------lDIHRF  362
ident   |                                                         
Sbjct ASDAST------------------ypEXYGLAARQFKQAL-VAHFnqlpfvdlaqKKAWI  356
DSSP  LLLLLL------------------lhHHHHHHHHHHHHHH-HHHHhllllllhhhHHHHH


DSSP  HHHHLHHHHHHLLLLlLLLLLllllllleeeeelllleellhhhllllllllllllleel
Query VDAASTKAAKLFGLFpRKGTIavgsdadlvvydpqyrgtisvktqhvnndyngfegfeid  422
ident         |||     |                                           
Sbjct NAICWQTSAKLYHQE-RELRV---------------------------------------  376
DSSP  HHHHLHHHHHHLLLH-HHHLL---------------------------------------


DSSP  leeeeeeelleeeeelleelllllllllllllllll
Query grpsvvtvrgkvavrdgqfvgekgwgkllrrepmyf  458
ident                                     
Sbjct ------------------------------------  376
DSSP  ------------------------------------

No 43: Query=1gkpA Sbjct=1a4mA Z-score=15.5

DSSP  leeeelleeeelleeeeleeeelllllleeellllllllleeeelllleeeELEEEEEEL
Query pllikngeiitadsrykadiyaegetitrigqnleappgtevidatgkyvfPGFIDPHVH   60
ident                                                          |||
Sbjct ----------------------------------------------tpafnKPKVELHVH   14
DSSP  ----------------------------------------------lllllLLEEEEEEE


DSSP  LLL-------------------------------------------eELLEE--------
Query IYL-------------------------------------------pFMATF--------   69
ident                                                |            
Sbjct LDGaikpetilyfgkkrgialpadtveelrniigmdkplslpgflakFDYYMpviagcre   74
DSSP  HHHlllhhhhhhhhhhhllllllllhhhhhhhhlllllllhhhhhllHHHHHhhhlllhh


DSSP  ----lllLHHHHHHHHHhllEEEEEEEELLLLLL----------------LHHHHHHHHH
Query ----akdTHETGSKAALmggTTTYIEMCCPSRND----------------DALEGYQLWK  109
ident                              |                           |  
Sbjct aikriayEFVEMKAKEG---VVYVEVRYSPHLLAnskvdpmpwnqtegdvTPDDVVDLVN  131
DSSP  hhhhhhhHHHHHHHHLL---EEEEEEEELLHHHLlllllllhhhllllllLHHHHHHHHH


DSSP  HHHLLLL---LLEEEEEEELL--LLLL--LHHHHHHHHHHLLLLEEEEE-ELLLlllLLL
Query SKAEGNS---YCDYTFHMAVS--KFDE--KTEGQLREIVADGISSFXIF-LSYKnffGVD  161
ident                                                             
Sbjct QGLQEGEqafGIKVRSILCCMrhQPSWslEVLELCKKYNQKTVVAMDLAgDETI-egSSL  190
DSSP  HHHHHHHhhhLLEEEEEEEEEllLHHHhhHHHHHHHHLLLLLEEEEEEElLLLL-llHHH


DSSP  HHHHHHHHHHHHHHLLEEEEEELlhhhhhhhhhhhhhlllllhhhllllllhhHHHHHHH
Query DGEMYQTLRLAKELGVIVTAHCEnaelvgrlqqkllsegktgpewhepsrpeaVEAEGTA  221
ident           |   |   | |                                   |   
Sbjct FPGHVEAYEGAVKNGIHRTVHAG----------------------------evGSPEVVR  222
DSSP  LHHHHHHHHHHHHHLLEEEEEEL----------------------------llLLHHHHH


DSSP  HHHHHHhhhlLEEEELLLLlhHHHH---HHHHHHHLlllEEEEEEHHhhhllhhhhhllh
Query RFATFLettgATGYVVHLSckPALD---AAMAAKARgvpIYIESVIPhflldktyaergg  278
ident      |     |  | |                         |                 
Sbjct EAVDIL----KTERVGHGY--HTIEdeaLYNRLLKE--nMHFEVCPW-------------  261
DSSP  HHHHLL----LLLEEEELH--HHHHlhhHHHHHHHL--lLEEEELHH-------------


DSSP  hhhhllLLLLlLLLLHHHhHHHHHHHLLLLLEEELLLLLLlhhhhhhhlllhhhlllLLL
Query veamkyIMSPpLRDKRNQkVLWDALAQGFIDTVGTDHCPFdteqkllgkeaftaipnGIP  338
ident               |                   ||                        
Sbjct ---ssyLTGA-WDPKTTH-AVVRFKNDKANYSLNTDDPLI-----------------FKS  299
DSSP  ---hhhHLLL-LLLLLLL-HHHHHHHLLLLEEELLLLLLL-----------------LLL


DSSP  LLLLHHHHHHHHHLllllLLHHHHHHHhLHHHHHHLLL----LLLLL--LLLLlllllee
Query AIEDRVNLLYTYGVsrgrLDIHRFVDAaSTKAAKLFGL----FPRKG--TIAVgsdadlv  392
ident                        |       |||   |                      
Sbjct TLDTDYQMTKKDMG----FTEEEFKRL-NINAAKSSFLpeeeKKELLerLYRE-------  347
DSSP  LHHHHHHHHHHLLL----LLHHHHHHH-HHHHHHLLLLlhhhHHHHHhhHHHH-------


DSSP  eeelllleellhhhllllllllllllleelleeeeeeelleeeeelleelllllllllll
Query vydpqyrgtisvktqhvnndyngfegfeidgrpsvvtvrgkvavrdgqfvgekgwgkllr  452
ident                                                             
Sbjct ------------------------------------------------------------  347
DSSP  ------------------------------------------------------------


DSSP  llllll
Query repmyf  458
ident       
Sbjct ----yq  349
DSSP  ----ll

No 44: Query=1gkpA Sbjct=1itqA Z-score=15.1

DSSP  leeeelleeeelleeeeleeeelllllleeellllllllleeeelllleeEELEEEEEEL
Query pllikngeiitadsrykadiyaegetitrigqnleappgtevidatgkyvFPGFIDPHVH   60
ident                                                       || |  
Sbjct --------------------------------------dffrdeaerimrDSPVIDGHND   22
DSSP  --------------------------------------lhhhhhhhhhhlLLLEEEEEEL


DSSP  LLL--EELLEE----------llllhhhHHHHHHHLLEEEEEEEELLL-------LLLLH
Query IYL--PFMATF----------akdthetGSKAALMGGTTTYIEMCCPS-------RNDDA  101
ident        |                           |                        
Sbjct LPWqlLDMFNNrlqderanlttlagthtNIPKLRAGFVGGQFWSVYTPcdtqnkdAVRRT   82
DSSP  HHHhhHHHHLLllllhhhllllllllllLHHHHHHLLEEEEEEEELLLhhhllllHHHHH


DSSP  HHHHHHHHHHHL-LLLL------------------LEEEEEEE-LLLLLllHHHHHHHHH
Query LEGYQLWKSKAE-GNSY------------------CDYTFHMA-VSKFDekTEGQLREIV  141
ident ||                                              |    | ||   
Sbjct LEQMDVVHRMCRmYPETflyvtssagirqafregkVASLIGVEgGHSID-sSLGVLRALY  141
DSSP  HHHHHHHHHHHHhLLLLeeelllhhhhhhhhhlllEEEEEEEElHHHLL-lLHHHHHHHH


DSSP  HLLLLEEEEEELLllllLLLH-------------------HHHHHHHHHHHHHLLEEEEE
Query ADGISSFXIFLSYknffGVDD-------------------GEMYQTLRLAKELGVIVTAH  182
ident   |        |                                        |||     
Sbjct QLGMRYLTLTHSC----NTPWadnwlvdtgdsepqsqglsPFGQRVVKELNRLGVLIDLA  197
DSSP  HLLEEEEELLLLL----LLLLlllhhhlllllllllllllHHHHHHHHHHHHHLLEEELL


DSSP  ELlhhhhhhhhhhhhhlllllhhhllllllhhhhhhHHHHHHHHHHHHLLEEEELLLLLH
Query CEnaelvgrlqqkllsegktgpewhepsrpeaveaeGTARFATFLETTGATGYVVHLSCK  242
ident                                       |     |    |     | |  
Sbjct HV----------------------------------SVATMKATLQLSRAPVIFSHSSAY  223
DSSP  LL----------------------------------LHHHHHHHHHHLLLLLEELLLLLL


DSSP  H-------HHHHHHHHHHlLLLEEEEEEHHhhhLLHHHHhllhhhhhlllllllllllhH
Query P-------ALDAAMAAKArGVPIYIESVIPhflLDKTYAerggveamkyimspplrdkrN  295
ident           |                         |                       
Sbjct SvcasrrnVPDDVLRLVK-QTDSLVMVNFYnnyISCTNK----------------anlsQ  266
DSSP  LlllllllLLHHHHHHHH-HHLLEEEELLLhhhHLLLLL----------------llhhH


DSSP  HHHHHHHHHL---LLLLEEELLLLlllhhhhhhhlllhhhllLLLL-----LLLLhHHHH
Query QKVLWDALAQ---GFIDTVGTDHCpfdteqkllgkeaftaipNGIP-----AIEDrVNLL  347
ident      |             | |                                     |
Sbjct VADHLDHIKEvagARAVGFGGDFD-----------------gVPRVpegleDVSK-YPDL  308
DSSP  HHHHHHHHHHhllHHHEEELLLLL-----------------lLLLLlllllLLLL-HHHH


DSSP  HHHHLlLLLLLHHHHHHHHLHHHHHHLLllllllllllllllleeeeelllleellhhhl
Query YTYGVsRGRLDIHRFVDAASTKAAKLFGlfprkgtiavgsdadlvvydpqyrgtisvktq  407
ident       |          |        |                                 
Sbjct IAELL-RRNWTEAEVKGALADNLLRVFE--------------------------------  335
DSSP  HHHHH-HLLLLHHHHHHHHLHHHHHHHH--------------------------------


DSSP  lllllllllllleelleeeeeeelleeeeelleelllllllllllllLLLL---------
Query hvnndyngfegfeidgrpsvvtvrgkvavrdgqfvgekgwgkllrrePMYF---------  458
ident                                                             
Sbjct ---------------------------------------------avEQASnltqapeee  350
DSSP  ---------------------------------------------hhHHLLlllllllll


DSSP  -------------------
Query -------------------  458
ident                    
Sbjct pipldqlggscrthygyss  369
DSSP  lllhhhlllllllllllll

No 45: Query=1gkpA Sbjct=3gg7A Z-score=15.1

DSSP  leeeelleeeelleeeeleeeelllllleeellllllllleeeelllleeeeLEEEEEEL
Query pllikngeiitadsrykadiyaegetitrigqnleappgtevidatgkyvfpGFIDPHVH   60
ident                                                       || |||
Sbjct ----------------------------------------------------SLIDFHVH    8
DSSP  ----------------------------------------------------LLEEEEEL


DSSP  LLLeelleeLLLLHhHHHHHHHHLLEeEEEEEELLlllllhHHHHHHHHHHHLLllLLEE
Query IYLpfmatfAKDTHeTGSKAALMGGTtTYIEMCCPsrnddaLEGYQLWKSKAEGnsYCDY  120
ident   |        |       |       |                       | |      
Sbjct LDL------YPDPV-AVARACEERQL-TVLSVTTT------PAAWRGTLALAAG--RPHV   52
DSSP  HHH------LLLHH-HHHHHHHHLLL-EEEELLLL------HHHHHHHHHHHLL--LLLE


DSSP  EEEEELL-----llLLLHhHHHHHHHHlLLLEEE-EEEL----LLLLlllLHHHHHHHHH
Query TFHMAVS-----kfDEKTeGQLREIVAdGISSFX-IFLS----YKNFfgvDDGEMYQTLR  170
ident                                      |                    ||
Sbjct WTALGFHpevvserAADL-PWFDRYLP-ETRFVGeVGLDgspsLRGTwtqQFAVFQHILR  110
DSSP  EELLLLLhhhllllHHHL-HHHHHHHH-HLLEEEeEELLllhhHHHHhhhHHHHHHHHHH


DSSP  HHHHH-LLEEEEEELLhhhhhhhhhhhhhlllllhhhllllllhhhhhhHHHHHHHHHHH
Query LAKEL-GVIVTAHCENaelvgrlqqkllsegktgpewhepsrpeaveaeGTARFATFLET  229
ident       | |   |                                            || 
Sbjct RCEDHgGRILSIHSRR---------------------------------AESEVLNCLEA  137
DSSP  HHHHLlLEEEEEELLL---------------------------------LHHHHHHHHHH


DSSP  -HLLE-EEELLLLLHHhhHHHHHHHHllLLEEEEEEHHHHHLlhhhhhllhhhhhlllll
Query -TGAT-GYVVHLSCKPalDAAMAAKArgVPIYIESVIPHFLLdktyaerggveamkyims  287
ident             |          |                                    
Sbjct nPRSGtPILHWYSGSV--TELRRAIS--LGCWFSVGPTMVRT------------------  175
DSSP  lHHHEeEEEELLLLLH--HHHHHHHH--LLLEEEELHHHHLL------------------


DSSP  llllllHHHHHHHHHHhLLLLLEEELLLLLllhhhhhhhlllhhhllllLLLLLLHHHHH
Query pplrdkRNQKVLWDALaQGFIDTVGTDHCPfdteqkllgkeaftaipngIPAIEDRVNLL  347
ident            |             ||                           |     
Sbjct ------QKGAALIRSM-PRDRVLTETDGPF-------------leldgqAALPWDVKSVV  215
DSSP  ------HHHHHHHHHL-LHHHEEELLLLLL-------------leelleELLHHHHHHHH


DSSP  HhHHLLlLLLL-HHHHHHHhLHHHHHHLLllllllllllllllleeeeelllleellhhh
Query YtYGVSrGRLD-IHRFVDAaSTKAAKLFGlfprkgtiavgsdadlvvydpqyrgtisvkt  406
ident                           | |                               
Sbjct E-GLSKiWQIPaSEVERIV-KENVSRLLG-------------------------------  242
DSSP  H-HHHHhHLLLhHHHHHHH-HHHHHHHHH-------------------------------


DSSP  llllllllllllleelleeeeeeelleeeeelleelllllllllllllllll
Query qhvnndyngfegfeidgrpsvvtvrgkvavrdgqfvgekgwgkllrrepmyf  458
ident                                                     
Sbjct ---------------------------------------------------t  243
DSSP  ---------------------------------------------------l

No 46: Query=1gkpA Sbjct=2gwgA Z-score=14.6

DSSP  leeeelleeeelleeeeleeeelllllleeellllllllleeeelllleeeeLEEEEEEL
Query pllikngeiitadsrykadiyaegetitrigqnleappgtevidatgkyvfpGFIDPHVH   60
ident                                                       || | |
Sbjct ----------------------------------------------------XIIDIHGH    8
DSSP  ----------------------------------------------------LLEEEEEE


DSSP  LLLE---ELLE-------------------------elllLHHH-HHHHHHHLLEEEEEE
Query IYLP---FMAT-------------------------fakdTHET-GSKAALMGGTTTYIE   91
ident                                                |     |      
Sbjct YTTApkaLEDWrnrqiagikdpsvxpkvselkisddelqaSIIEnQLKKXQERGSDLTVF   68
DSSP  LLLLlhhHHHHhhhhhhhhhlhhhlllhhhllllhhhhhhHHHLlHHHHHHHHLLLEEEE


DSSP  EEL----llLLLLHHHHHHHHHHHHLLLllLEEEEEEELLL----lLLLHHHHHHHHHHL
Query MCC----psRNDDALEGYQLWKSKAEGNsyCDYTFHMAVSK----fDEKTEGQLREIVAD  143
ident              |     |                                 |   |  
Sbjct SPRagdfnvSSTWAAICNELCYRVSQLF-pDNFIGAAXLPQspgvdPKTCIPELEKCVKE  127
DSSP  ELLlllhhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHL-lLLEEEEEELLLlllllHHHHHHHHHHHHHL


DSSP  -LLLEEEEEELLLL----lllllHHHHHHHHHHHHHHLLEEEEEellhhhhhhhhhhhhh
Query -GISSFXIFLSYKN----ffgvdDGEMYQTLRLAKELGVIVTAHcenaelvgrlqqklls  198
ident  |                     |   |       ||      |                
Sbjct yGFVAINLNPDPSGghwtsppltDRIWYPIYEKXVELEIPAXIH----------------  171
DSSP  lLLLEEEELLLLLLlllllllllLHHHHHHHHHHHHHLLLEEEL----------------


DSSP  lllllhhhlLLLLlHHHHHHHHHHH--hHHHHHHL-LEEEELLLLLhHHHH---------
Query egktgpewhEPSRpEAVEAEGTARF--aTFLETTG-ATGYVVHLSCkPALD---------  246
ident                                           |                 
Sbjct -------vsTGAHyLNADTTAFXQCvagDLFKDFPeLKFVIPHGGG-AVPYhwgrfrgla  223
DSSP  -------llLLLHhHHHHHHHHHHHhhlLHHHHLLlLLEEELHHHL-LLHHhhhhhhhhh


DSSP  --hhhhhHHLLL--LEEEEEEhHHHHllhhhhhllhhhhhlllllllllllhHHHHHHHH
Query --aamaaKARGV--PIYIESViPHFLldktyaerggveamkyimspplrdkrNQKVLWDA  302
ident            |   |                                        |   
Sbjct qexkkplLEDHVlnNIFFDTC-VYHQ-------------------------pGIDLLNTV  257
DSSP  hhlllllHHHHLllLEEEELL-LLLH-------------------------hHHHHHHHH


DSSP  HhLLLLLEEELLLLlllhhhhhhhlllhhhllLLLL--------lllLHHHHHHHHhlll
Query LaQGFIDTVGTDHCpfdteqkllgkeaftaipNGIP--------aieDRVNLLYTYgvsr  354
ident                                                |            
Sbjct I-PVDNVLFASEXI------------------GAVRgidprtgfyydDTKRYIEAS----  294
DSSP  L-LHHHEELLLLLL------------------LLLLleelllleellLLHHHHHHL----


DSSP  LLLLHHHHHHHHLHHHHHHLL-LLLLLlllLLLLllleeeeelllleellhhhlllllll
Query GRLDIHRFVDAASTKAAKLFG-LFPRKgtiAVGSdadlvvydpqyrgtisvktqhvnndy  413
ident   |            |      |                                     
Sbjct TILTPEEKQQIYEGNARRVYPrLDAALkakGKLE--------------------------  328
DSSP  LLLLHHHHHHHHLHHHHHHLHhHHHHHhhhHHHL--------------------------


DSSP  lllllleelleeeeeeelleeeeelleelllllllllllllllll
Query ngfegfeidgrpsvvtvrgkvavrdgqfvgekgwgkllrrepmyf  458
ident                                              
Sbjct --------------------------------------------h  329
DSSP  --------------------------------------------l

No 47: Query=1gkpA Sbjct=3qy6A Z-score=13.8

DSSP  leeeelleeeelleeeeleeeelllllleeellllllllleeeelllleeeelEEEEEEL
Query pllikngeiitadsrykadiyaegetitrigqnleappgtevidatgkyvfpgFIDPHVH   60
ident                                                       || | |
Sbjct -----------------------------------------------------MIDIHCH    7
DSSP  -----------------------------------------------------LEELLLL


DSSP  LLLEE-lleELLLLHHHHHHHHHHLLEEEEEEEELLLLLL--lHHHHHHHH-HHHHLLL-
Query IYLPF-matFAKDTHETGSKAALMGGTTTYIEMCCPSRND--dALEGYQLW-KSKAEGN-  115
ident |                   ||   |  | |                             
Sbjct ILPAMddgaGDSADSIEMARAAVRQGIRTIIATPHHNNGVyknEPAAVREAaDQLNKRLi   67
DSSP  LLLLLllllLLHHHHHHHHHHHHHLLLLEEELLLEELLLLlllLHHHHHHHhHHHHHHHh


DSSP  ---LLLEEEEEEelllllllhhhhhhhhhhlllleeEEEElllllllllHHHHHHHHHH-
Query ---SYCDYTFHMavskfdektegqlreivadgissfXIFLsyknffgvdDGEMYQTLRL-  171
ident                                      |            ||  | |   
Sbjct kedIPLHVLPGQ------------------------EIRI---------YGEVEQDLAKr   94
DSSP  hllLLLEEELLL------------------------EEEL---------LLLHHHHHHLl


DSSP  ---hhhhlLEEEEEELlhhhhhhhhhhhhhlllllhhhllllllhhHHHHhhhHHHHHHH
Query ---akelgVIVTAHCEnaelvgrlqqkllsegktgpewhepsrpeaVEAEgtaRFATFLE  228
ident                                                             
Sbjct qllslndtKYILIEFP-----------------------------fDHVP--rYAEQLFY  123
DSSP  llllhhhlLEEEEELL-----------------------------lLLLL--lLHHHHHH


DSSP  HHL---LEEEELLLL-LHHH---HHHHHHHHHllLLEEEEEEHHHH-HLLHhhhhllhhh
Query TTG---ATGYVVHLS-CKPA---LDAAMAAKArgVPIYIESVIPHF-LLDKtyaerggve  280
ident             |                                               
Sbjct DLQlkgYIPVIAHPErNREIrenPSLLYHLVE--KGAASQITSGSLaGIFG---------  172
DSSP  HHHhllLEEEEELHHhLHHHhhlLHHHHHHHH--LLLEEEEEHHHHlLLLL---------


DSSP  hhllllllllllLHHHHHHHHHHHLLLLLEEELLLLLllhhhhhhhlllhhhlllLLLLl
Query amkyimspplrdKRNQKVLWDALAQGFIDTVGTDHCPfdteqkllgkeaftaipnGIPAi  340
ident             |              |  |  |                          
Sbjct ------------KQLKAFSLRLVEANLIHFVASDAHN----------------vkTRNF-  203
DSSP  ------------HHHHHHHHHHHHLLLLLEEELLLLL----------------llLLLL-


DSSP  lLHHHHHHhHHLLllLLLHHHHHHHhLHHHHHHLLLLllllllllllllleeeeelllle
Query eDRVNLLYtYGVSrgRLDIHRFVDAaSTKAAKLFGLFprkgtiavgsdadlvvydpqyrg  400
ident       ||                     |  |                           
Sbjct -HTQEALY-VLEK--EFGSELPYML-TENAELLLRNQ-----------------------  235
DSSP  -LHHHHHH-HHHH--HHLLHHHHHH-HHHHHHHHLLL-----------------------


DSSP  ellhhhllllllllllllleelleeeeeeelleeeeelleelllllllllllllllll
Query tisvktqhvnndyngfegfeidgrpsvvtvrgkvavrdgqfvgekgwgkllrrepmyf  458
ident                                                           
Sbjct ----------------------------------------------tifrqppqpvkr  247
DSSP  ----------------------------------------------llllllllllll

No 48: Query=1gkpA Sbjct=1j5sA Z-score=13.7

DSSP  -----------leeeelleEEELleeeeleeeelllllleeellllllllleeeelllle
Query -----------pllikngeIITAdsrykadiyaegetitrigqnleappgtevidatgky   49
ident                                                             
Sbjct hmflgedylltnraavrlfNEVK-------------------------------------   23
DSSP  llllllllllllhhhhhhhHHHL-------------------------------------


DSSP  eEELEEEEEELLLleelleelllLHHH---------------------------------
Query vFPGFIDPHVHIYlpfmatfakdTHET---------------------------------   76
ident       ||| |                                                 
Sbjct -DLPIVDPHNHLD--------akDIVEnkpwndiwevegatdhyvwelmrrcgvseeyit   74
DSSP  -LLLEEELLLLLL--------hhHHHHllllllhhhhhllllhhhhhhhhhllllhhhll


DSSP  ------------------------------------------------------------
Query ------------------------------------------------------------   76
ident                                                             
Sbjct gsrsnkekwlalakvfprfvgnptyewihldlwrrfnikkviseetaeeiweetkkklpe  134
DSSP  llllhhhhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhhhhhhhhllllllllhhhhhhhhhhhhhhlll


DSSP  --HHHHHHHLLEEEEEEEELllllllHHHHhHHHHHHHL-LLLLLEEEEEEELLLL----
Query --GSKAALMGGTTTYIEMCCpsrnddALEGyQLWKSKAE-GNSYCDYTFHMAVSKF----  129
ident     |                               ||                      
Sbjct mtPQKLLRDMKVEILCTTDD------PVST-LEHHRKAKeAVEGVTILPTWRPDRAmnvd  187
DSSP  llHHHHHHHLLEEEEELLLL------LLLL-LHHHHHHHhHLLLLEEELLLLLHHHhlll


DSSP  -------------------------LLLHHHHHHHHHHLLLLEEEEEEL-----------
Query -------------------------DEKTEGQLREIVADGISSFXIFLS-----------  153
ident                                        |       |            
Sbjct kegwreyvekmgerygedtstldgfLNALWKSHEHFKEHGCVASDHALLepsvyyvdenr  247
DSSP  lllhhhhhhhhhhhhllllllhhhhHHHHHHHHHHHHLLLLLEEEEEELllllllllhhh


DSSP  ---------------lllllllLHHHHHHHHHHHHHHLLEEEEEELlhhhHHHHHHHHHH
Query ---------------yknffgvDDGEMYQTLRLAKELGVIVTAHCEnaelVGRLQQKLLS  198
ident                           | |      |       |             |  
Sbjct aravhekafsgekltqdeindyKAFMMVQFGKMNQETNWVTQLHIG---aLRDYRDSLFK  304
DSSP  hhhhhhhhlllllllhhhhhhhHHHHHHHHHHHHHHHLLEEEEEEL---eELLLLHHHHH


DSSP  LLlllhHHLLllLLHHHhhHHHHHHHHHHHHH--LLEEEELlLLLHHHHHHHHHHHHLLL
Query EGktgpEWHEpsRPEAVeaEGTARFATFLETT--GATGYVVhLSCKPALDAAMAAKARGV  256
ident                            ||                   |           
Sbjct TLgpdsGGDI--STNFL--RIAEGLRYFLNEFdgKLKIVLY-VLDPTHLPTISTIARAFP  359
DSSP  HLllllLLLE--ELLLL--LHHHHHHHHHHHLllLLLEEEE-ELLHHHHHHHHHHHHHLL


DSSP  LEEEEEE--hhHHHLlhhhhhllhhhhhlllllllllllhHHHHHHHH----hhLLLLLE
Query PIYIESV--ipHFLLdktyaerggveamkyimspplrdkrNQKVLWDA----laQGFIDT  310
ident   |                                                         
Sbjct NVYVGAPwwfnDSPF-------------------------GMEMHLKYlasvdlLYNLAG  394
DSSP  LEEELLLllllLLHH-------------------------HHHHHHHHhhllllHHHLLL


DSSP  EELLLLLllhhhhhhhlllhhhlllllLLLLLHHHHHHHHHLllLLLL------------
Query VGTDHCPfdteqkllgkeaftaipngiPAIEDRVNLLYTYGVsrGRLD------------  358
ident   ||                            |                           
Sbjct MVTDSRK-------------------lLSFGSRTEMFRRVLS--NVVGemvekgqipike  433
DSSP  LLLLLLL-------------------lLHHHHHHHHHHHHHH--HHHHhhhhlllllhhh


DSSP  -HHHHHHHHLHHHHHHLLllllllllllllllleeeeelllleellhhhlllllllllll
Query -IHRFVDAASTKAAKLFGlfprkgtiavgsdadlvvydpqyrgtisvktqhvnndyngfe  417
ident                ||                                           
Sbjct aRELVKHVSYDGPKALFF------------------------------------------  451
DSSP  hHHHHHHHHLHHHHHHHL------------------------------------------


DSSP  lleelleeeeeeelleeeeelleelllllllllllllllll
Query gfeidgrpsvvtvrgkvavrdgqfvgekgwgkllrrepmyf  458
ident                                          
Sbjct -----------------------------------------  451
DSSP  -----------------------------------------

No 49: Query=1gkpA Sbjct=3iacA Z-score=12.6

DSSP  ------------leeeellEEEElleeeeleeeelllllleeellllllllleeeellll
Query ------------pllikngEIITadsrykadiyaegetitrigqnleappgtevidatgk   48
ident                                                             
Sbjct atfxtedfllkndiartlyHKYA-------------------------------------   23
DSSP  llllllllllllhhhhhhhHHLL-------------------------------------


DSSP  eeEELEEEEEELLLleelleellLLHHH--------------------------------
Query yvFPGFIDPHVHIYlpfmatfakDTHET--------------------------------   76
ident        | | |                                                
Sbjct -aPXPIYDFHCHLS-------pqEIADDrrfdnlgqiwlegdhykwralrsagvdeslit   75
DSSP  -lLLLEEELLLLLL-------hhHHHHLlllllhhhhhhllllhhhhhhhhllllhhhll


DSSP  ------------------------------------------------------------
Query ------------------------------------------------------------   76
ident                                                             
Sbjct gketsdyekyxawantvpktlgnplyhwthlelrrpfgitgtlfgpdtaesiwtqcnekl  135
DSSP  lllllhhhhhhhhhhhhhhllllhhhhhhhhhhhlllllllllllhhhhhhhhhhhhhhh


DSSP  ------HHHHHHHLLEEEEEEEELllllllHHHHhHHHHHHHLLL--LLLEEEEEEELLL
Query ------GSKAALMGGTTTYIEMCCpsrnddALEGyQLWKSKAEGN--SYCDYTFHMAVSK  128
ident                                                            |
Sbjct atpafsARGIXQQXNVRXVGTTDD------PIDS-LEYHRQIAADdsIDIEVAPSWRPDK  188
DSSP  llhhhlHHHHHHHLLEEEEELLLL------LLLL-LHHHHHHHHLllLLLEEELLLLLHH


DSSP  L-----------------------------LLLHHHHHHHHHHLLLLEEEEEELL-----
Query F-----------------------------DEKTEGQLREIVADGISSFXIFLSY-----  154
ident                                      |    | |               
Sbjct VfkieldgfvdylrkleaaadvsitrfddlRQALTRRLDHFAACGCRASDHGIETlrfap  248
DSSP  HhllllllhhhhhhhhhhhhllllllhhhhHHHHHHHHHHHHHLLLLEEEEEELLlllll


DSSP  ----------------------llllllLHHHHHHHHHHHHHHLLEEEEEELLhhhHHHH
Query ----------------------knffgvDDGEMYQTLRLAKELGVIVTAHCENaelVGRL  192
ident                                      |     |     |          
Sbjct vpddaqldailgkrlagetlseleiaqfTTAVLVWLGRQYAARGWVXQLHIGA---IRNN  305
DSSP  lllhhhhhhhhhhhhllllllhhhhhhhHHHHHHHHHHHHHHHLLEEEEEELE---ELLL


DSSP  hhHHHHllLLLHhhLLLLLLHHHhhHHHHHHHHHHHHH-----LLEEEELlLLLHHHHHH
Query qqKLLSegKTGPewHEPSRPEAVeaEGTARFATFLETT-----GATGYVVhLSCKPALDA  247
ident                                   |                         
Sbjct --NTRX-fRLLGpdTGFDSIGDN--NISWALSRLLDSXdvtneLPKTILY-CLNPRDNEV  359
DSSP  --LHHH-hHHHLllLLLLEELLL--LLHHHHHHHHHHHhllllLLEEEEE-ELLHHHHHH


DSSP  HHHHHHLLL------LEEEEE--ehhHHHLlhhhhhllhhhhhlllllllllllhHHHHH
Query AMAAKARGV------PIYIES--vipHFLLdktyaerggveamkyimspplrdkrNQKVL  299
ident                     |                                       
Sbjct LATXIGNFQgpgiagKVQFGSgwwfnDQKD-------------------------GXLRQ  394
DSSP  HHHHHHHLLllllllLEEELLllhhhLLHH-------------------------HHHHH


DSSP  HHH----hhLLLLLEEELLLLLllhhhhhhhlllhhhllllLLLLlLHHHHHHHHHlLLL
Query WDA----laQGFIDTVGTDHCPfdteqkllgkeaftaipngIPAIeDRVNLLYTYGvSRG  355
ident                  ||                            |            
Sbjct LEQlsqxglLSQFVGXLTDSRS-------------------FLSY-TRHEYFRRIL-CNL  433
DSSP  HHHhhhhllHHHLLLLLLLLLL-------------------LLLL-HHHHHHHHHH-HHH


DSSP  L--------------lLHHHHHHHHLHHHHHHLLllllllllllllllleeeeellllee
Query R--------------lDIHRFVDAASTKAAKLFGlfprkgtiavgsdadlvvydpqyrgt  401
ident                       |     |   |                           
Sbjct LgqwaqdgeipddeaxLSRXVQDICFNNAQRYFT--------------------------  467
DSSP  HhhhhhlllllllhhhHHHHHHHHHLHHHHHHLL--------------------------


DSSP  llhhhllllllllllllleelleeeeeeelleeeeelleelllllllllllllllll
Query isvktqhvnndyngfegfeidgrpsvvtvrgkvavrdgqfvgekgwgkllrrepmyf  458
ident                                                          
Sbjct -------------------------------------------------------ik  469
DSSP  -------------------------------------------------------ll

No 50: Query=1gkpA Sbjct=1v77A Z-score=11.6

DSSP  leeeelleeeelleeeeleeeelllllleeellllllllleeeelllleeeELEEEEEEL
Query pllikngeiitadsrykadiyaegetitrigqnleappgtevidatgkyvfPGFIDPHVH   60
ident                                                      ||     
Sbjct ---------------------------------------------------VKFIEMDIR    9
DSSP  ---------------------------------------------------LLLEEEEEL


DSSP  LLleelleellllhhHHHHHHHHLlEEEEEEEelllllllhhhhhhhhhhhhllllllee
Query IYlpfmatfakdtheTGSKAALMGgTTTYIEMccpsrnddalegyqlwkskaegnsycdy  120
ident                     |                                       
Sbjct DK-------------EAYELAKEW-FDEVVVS----------------------------   27
DSSP  LH-------------HHHHHHHHH-LLEEEEE----------------------------


DSSP  eeeEELLLLlllhhhhHHHHHHLLL-----lEEEEEElllllllLLHHHHHHHHHHHHhh
Query tfhMAVSKFdektegqLREIVADGI-----sSFXIFLsyknffgVDDGEMYQTLRLAKel  175
ident                   |                                 |    |  
Sbjct ---IKFNEE------vDKEKLREARkeygkvAILLSN-------PKPSLVRDTVQKFK--   69
DSSP  ---EEELLL------lLHHHHHHHHhhhlleEEEEEL-------LLHHHHHHHHHHLL--


DSSP  LLEEEEEELLhhhhhhhhhhhhhlllllhhhllllllhhhhHHHHHHHHHHHhhhllEEE
Query GVIVTAHCENaelvgrlqqkllsegktgpewhepsrpeaveAEGTARFATFLettgaTGY  235
ident                                                             
Sbjct SYLIYVESND-------------------------------LRVIRYSIEKG-----VDA   93
DSSP  LLEEEEELLL-------------------------------HHHHHHHHHLL-----LLE


DSSP  ELLLLL---HHHHH-hHHHHHHlLLLEEEEEEHHHHHLLHHHhhllhhhhhllllllllL
Query VVHLSC---KPALD-aAMAAKArGVPIYIESVIPHFLLDKTYaerggveamkyimspplR  291
ident           |  |                      |    |                  
Sbjct IISPWVnrkDPGIDhvLAKLMV-KKNVALGFSLRPLLYSNPY-----------------E  135
DSSP  EELLLLlllLLLLLhhHHHHHH-HHLLEEEEELHHHHHLLHH-----------------H


DSSP  LLHHHHHHHHHHHLLL----lLEEELLLLLllhhhhhhhlllhhhllllLLLLllHHHHH
Query DKRNQKVLWDALAQGF----iDTVGTDHCPfdteqkllgkeaftaipngIPAIedRVNLL  347
ident           |                                                |
Sbjct RANLLRFMMKAWKLVEkykvrRFLTSSAQE------------------kWDVR--YPRDL  175
DSSP  HHHHHHHHHHHHHHHHhhlllEEEELLLLL------------------hHHLL--LHHHH


DSSP  HHHHLlllLLLHHHHHHHHLHHHHHHLLllllllllllllllleeeeelllleellhhhl
Query YTYGVsrgRLDIHRFVDAASTKAAKLFGlfprkgtiavgsdadlvvydpqyrgtisvktq  407
ident    ||      |       |                                        
Sbjct ISLGV-viGMEIPQAKASISMYPEIILK--------------------------------  202
DSSP  HHHHH-hlLLLHHHHHHLLLHHHHHHHL--------------------------------


DSSP  lllllllllllleelleeeeeeelleeeeelleelllllllllllllllll
Query hvnndyngfegfeidgrpsvvtvrgkvavrdgqfvgekgwgkllrrepmyf  458
ident                                                    
Sbjct ---------------------------------------------------  202
DSSP  ---------------------------------------------------

No 51: Query=1gkpA Sbjct=2a3lA Z-score=10.5

DSSP  ------------------------------------------------------------
Query ------------------------------------------------------------    0
ident                                                             
Sbjct qpdpiaadilrkepeqetfvrlnvplevptsdeveaykclqeclelrkryvfqetvapwe   60
DSSP  llllllllllllllllllllllllllllllllllllhhhhhhhhhhhhllllllllllll


DSSP  ------------------------------------------------------------
Query ------------------------------------------------------------    0
ident                                                             
Sbjct keepfahypqgksdhcfemqdgvvhvfankdakedlfpvadatafftdlhhvlkviaagn  120
DSSP  lllllllllllllllllllllllllllllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhlllhh


DSSP  ----------------------------leeeELLEEEElleeeeleeeelllllleeel
Query ----------------------------plliKNGEIITadsrykadiyaegetitrigq   32
ident                                                             
Sbjct irtlchrrlvlleqkfnlhlmlnadkeflaqkSAPHRDF---------------------  159
DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhHLLLLLL---------------------


DSSP  lllllllleeeelllleeEELEEEEEELLL------------------------------
Query nleappgtevidatgkyvFPGFIDPHVHIY------------------------------   62
ident                        | |||                                
Sbjct -----------------yNVRKVDTHVHHSacmnqkhllrfiksklrkepdevvifrdgt  202
DSSP  -----------------lLLLEEEEEEELLllllhhhhhhhhhhhhhllllllleeelle


DSSP  ------------------------------------------------leELLEE-----
Query ------------------------------------------------lpFMATF-----   69
ident                                                             
Sbjct yltlrevfesldltgydlnvdlldvhadkstfhrfdkfnlkynpcgqsrlREIFLkqdnl  262
DSSP  eelhhhhhhhhlllllllllllllllllllllllllllhhhhllllllhhHHHHLlllll


DSSP  -----lllLHHHHHHHHH-HLLEeEEEEEELLLLLL--LHHHHHHHHHHHHLllLLLEEE
Query -----akdTHETGSKAAL-MGGTtTYIEMCCPSRND--DALEGYQLWKSKAEgnSYCDYT  121
ident                                                             
Sbjct iqgrflgeITKQVFSDLEaSKYQ-MAEYRISIYGRKmsEWDQLASWIVNNDL--YSENVV  319
DSSP  lllllhhhHHHHHHHHHLlLLLE-EEEEEEELLLLLllHHHHHHHHHHLLLL--LLLLEE


DSSP  EEEELLL----------------LLLLHHHHHHH------------hhHLLLLEEEEEEL
Query FHMAVSK----------------FDEKTEGQLRE------------ivADGISSFXIFLS  153
ident                                | |                    |     
Sbjct WLIQLPRlyniykdmgivtsfqnILDNIFIPLFEatvdpdshpqlhvfLKQVVGFDLVDD  379
DSSP  EEEEEELlhhhhlllllllllhhHHHHHLLHHHHhhhlhhhllllhhhHLLEEEEEEELL


DSSP  ------------------lllllllLHHHHHHHHHHHHHHL----------LEEEEEEll
Query ------------------yknffgvDDGEMYQTLRLAKELG----------VIVTAHCen  185
ident                               |        |                |   
Sbjct eskperrptkhmptpaqwtnafnpaFSYYVYYCYANLYVLNklreskgmttITLRPHS--  437
DSSP  lllllllllllllllllllllllllHHHHHHHHHHHHHHHHhhhlllllllLEELLLL--


DSSP  hhhhhhhhhhhhhlllllhhhllllllHHHHhHHHHHHHHHHhhhlleEEELLLLlhhHH
Query aelvgrlqqkllsegktgpewhepsrpEAVEaEGTARFATFLettgatGYVVHLSckpAL  245
ident                                    |                |      |
Sbjct -------------------------geAGDI-DHLAATFLTC------HSIAHGI---NL  462
DSSP  -------------------------llLLLL-HHHHHHHHHL------LLLLLLH---HH


DSSP  HH---HHHHHHLlLLEEEEEEHHHHHLlhhhhhllhhhhhllllllLLLLLHHHhHHHHH
Query DA---AMAAKARgVPIYIESVIPHFLLdktyaerggveamkyimspPLRDKRNQkVLWDA  302
ident                |                                 |          
Sbjct RKspvLQYLYYL-AQIGLAMSPLSNNS-------------------LFLDYHRN-PFPVF  501
DSSP  HHlhhHHHHHHH-HLLLEEELHHHHLL-------------------LLLLLLLL-LHHHH


DSSP  HHLLLLLEEELLLLLLlhhhhhhhlllhhhllllllllLLHHHHHHHHHlLLLLLLHHHH
Query LAQGFIDTVGTDHCPFdteqkllgkeaftaipngipaiEDRVNLLYTYGvSRGRLDIHRF  362
ident    |      ||                          |  |        |   |     
Sbjct FLRGLNVSLSTDDPLQ-----------------ihltkEPLVEEYSIAA-SVWKLSACDL  543
DSSP  HHLLLLEEELLLLHHH-----------------hllllLHHHHHHHHHH-HHHLLLHHHH


DSSP  HHHhLHHHHHHLLL-LLLL-lLLLLLLllleeeeelllleellhhhllllllllllllle
Query VDAaSTKAAKLFGL-FPRK-gTIAVGSdadlvvydpqyrgtisvktqhvnndyngfegfe  420
ident             |     |   |                                     
Sbjct CEI-ARNSVYQSGFsHALKshWIGKDY------------------------ykrgpdgnd  578
DSSP  HHH-HHHHHHHLLLlHHHHhhHLLLLL------------------------llllhhhll


DSSP  elleeeeeeelleeeeelleelllllllllllllllll
Query idgrpsvvtvrgkvavrdgqfvgekgwgkllrrepmyf  458
ident                                       
Sbjct ihktnvphirvefrdtiwkeemqqvylgkavisdevvp  616
DSSP  hhhhlllhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllllllllll

No 52: Query=1gkpA Sbjct=3au2A Z-score=9.1

DSSP  ------------------------------------------------------------
Query ------------------------------------------------------------    0
ident                                                             
Sbjct mrnqelarifeeiglmseflgdnpfrvrayhqaartlydldtpieeiaekgkealmelpg   60
DSSP  llhhhhhhhhhhhhhhhhhllllhhhhhhhhhhhhhhhhllllhhhhhlllhhhhlllll


DSSP  ------------------------------------------------------------
Query ------------------------------------------------------------    0
ident                                                             
Sbjct vgpdlaekileflrtgkvrkheelsrkvprgvlevmevpgvgpktarllyeglgidslek  120
DSSP  llhhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhhhhllhhhhhhhllllllhhhhhhhhhhhllllhhh


DSSP  ------------------------------------------------------------
Query ------------------------------------------------------------    0
ident                                                             
Sbjct lkaaldrgdltrlkgfgpkraerireglalaqaagkrrplgavlslarslleairalpgv  180
DSSP  hhhhhhhlhhhhlllllhhhhhhhhhhhhhhhhlllleehhhhhhhhhhhhhhhhlllll


DSSP  ------------------------------------------------------------
Query ------------------------------------------------------------    0
ident                                                             
Sbjct eraelcgsarrykdtvgdldflvasregeravegfvrlpqvkevyakgkeratvflkngl  240
DSSP  leeeelhhhhlllleelleeeeeelllhhhhhhhhhlllleeeeeeellleeeeeellll


DSSP  -----------------------leeeelleeeelleeeeleeeelllllleeeLLLL--
Query -----------------------pllikngeiitadsrykadiyaegetitrigQNLE--   35
ident                                                          |  
Sbjct qvdlrvvppesygaglqyltgskahsirlralaqekglklseygvfrgekriagETEEev  300
DSSP  eeeeeeelhhhhhhhhhhhhllhhhhhhhhhhhhhllleeelleeeelleeeelLLHHhh


DSSP  -------------------llllleeeelllleeEELEEEEEELLLLEelleELLLLHHH
Query -------------------appgtevidatgkyvFPGFIDPHVHIYLPfmatFAKDTHET   76
ident                                        |  ||            | | 
Sbjct yaalglpwippplredqgeveaalegrlpkllelPQVKGDLQVHSTYS----DGQNTLEE  356
DSSP  hhhlllllllhhhlllllhhhhhhlllllllllhHHLLEEEEELLLLL----LLLLLHHH


DSSP  HHHHHHHLLEEEEEEEELLLL----LLLHHHHHHHHHHHHLLLL----lLEEEEEEELLL
Query GSKAALMGGTTTYIEMCCPSR----NDDALEGYQLWKSKAEGNS----yCDYTFHMAVSK  128
ident    ||   |                     |                          |  
Sbjct LWEAAKTMGYRYLAVTDHSPAvrvaGGPSPEEALKRVGEIRRFNethgpPYLLAGAEVDI  416
DSSP  HHHHHHHHLLLEEEEEEELHHhhllLLLLHHHHHHHHHHHHHHHhhhllLEEEEEEEEEL


DSSP  LlllhhhHHHHHHHlLLLEEEEEeLLLL---llllLHHHHHHHHHHHhhhlLEEEE-EEL
Query FdektegQLREIVAdGISSFXIFlSYKN---ffgvDDGEMYQTLRLAkelgVIVTA-HCE  184
ident                                            |             |  
Sbjct HpdgtldYPDWVLR-ELDLVLVS-VHSRfnlpkadQTKRLLKALENP----FVHVLaHPT  470
DSSP  LllllllLLHHHHL-LLLEEEEE-LLLLllllhhhHHHHHHHHHLLL----LLLEElLLL


DSSP  LhhhhhhhhhhhhhlllllhhhlLLLLLHhhhhhhHHHHHHHHHhhLLEEEELL------
Query NaelvgrlqqkllsegktgpewhEPSRPEaveaegTARFATFLEttGATGYVVH------  238
ident                           |                        |        
Sbjct A--------------------rlLGRRAP--ieadWEAVFQKAK--EKGVAVEIdgyydr  506
DSSP  L--------------------llLLLLLL--llllHHHHHHHHH--HHLLEEEEelllll


DSSP  --LLLHhHHHHHHHHHhllllEEEEeehhhhhllhhhhhllhhhhhlllllllllllhhh
Query --LSCKpALDAAMAAKargvpIYIEsviphflldktyaerggveamkyimspplrdkrnq  296
ident   |        |           |                                    
Sbjct mdLPDD-LARMAYGMG-----LWIS-----------------------------------  525
DSSP  llLLHH-HHHHHHHLL-----LLEE-----------------------------------


DSSP  hhhhhhhhllllleEELLLLLllhhhhhhhlllhhhlllllLLLLLHhhhhhhhhlllll
Query kvlwdalaqgfidtVGTDHCPfdteqkllgkeaftaipngiPAIEDRvnllytygvsrgr  356
ident                 ||                                          
Sbjct --------------LSTDAHQ-------------------tDHLRFM-----elavgtaq  547
DSSP  --------------EELLLLL-------------------hHHHHHH-----hhhhhhhh


DSSP  llhhhhhhhhLHHHH-HHLLllllllllllllllleeeeelllleellhhhlllllllll
Query ldihrfvdaaSTKAA-KLFGlfprkgtiavgsdadlvvydpqyrgtisvktqhvnndyng  415
ident            |     |                                          
Sbjct rawigpervlNTLDYeDLLS----------------------------------------  567
DSSP  hllllllllhHHLLHhHHHH----------------------------------------


DSSP  lllleelleeeeeeelleeeeelleelllllllllllllLLLL--
Query fegfeidgrpsvvtvrgkvavrdgqfvgekgwgkllrrePMYF--  458
ident                                              
Sbjct -------------------------------------wlKARRgv  575
DSSP  -------------------------------------hhHLLLll

No 53: Query=1gkpA Sbjct=3f2bA Z-score=9.0

DSSP  -------------------------------------------------------leeee
Query -------------------------------------------------------pllik    5
ident                                                             
Sbjct vrrletiveeerrvvvqgyvfdaevselksgrtlltmkitdytnsilvkmfsrdkedael   60
DSSP  lllhhhlllleeeeeeeeeeeeeeeeellllleeeeeeeelllleeeeeeelllhhhhhh


DSSP  lleeeelleeeeleeeelllllleeellllllLLLE-eeellllEEEELEEEEEELL-LL
Query ngeiitadsrykadiyaegetitrigqnleapPGTE-vidatgkYVFPGFIDPHVHI-YL   63
ident                                                      | |    
Sbjct msgvkkgmwvkvrgsvqndtfvrdlviiandlNEIAanerqdtaPEGEKRVELHLHTpMS  120
DSSP  hhlllllleeeeeeeeeeelllleeeeeeeeeEEELllllllllLLLLLLLLLLLLLlLL


DSSP  EElleELLLLHHHHHHHHHHLLEEEEEEEELLlllllhhhhhhHHHHHHLLL---lLLEE
Query PFmatFAKDTHETGSKAALMGGTTTYIEMCCPsrnddalegyqLWKSKAEGN---sYCDY  120
ident       |          |   |                          |           
Sbjct QM---DAVTSVTKLIEQAKKWGHPAIAVTDHA---------vvQSFPEAYSAakkhGMKV  168
DSSP  LL---LLLLLHHHHHHHHHHLLLLLEEELLLL---------llLLHHHHHHHhhhhLLLE


DSSP  EEEEE-------------------------LLLLlllhhhhhhhhhhlllleeeeeelLL
Query TFHMA-------------------------VSKFdektegqlreivadgissfxiflsYK  155
ident                                                             
Sbjct IYGLEanivddpfhvtllaqnetglknlfkLVSL-------------------shiqyFH  209
DSSP  EEEEEeeeellleeeeeeellhhhhhhhhhHHHH-------------------hhlllLL


DSSP  LLLLLLhhhHHHHHHHHhhHLLEeeeeellhhhhhhhhhhhhhlllllhhhllllllhhh
Query NFFGVDdgeMYQTLRLAkeLGVIvtahcenaelvgrlqqkllsegktgpewhepsrpeav  215
ident                     |                                       
Sbjct RVPRIP---RSVLVKHR--DGLL-------------------------------------  227
DSSP  LLLLEE---HHHHHHLL--LLEE-------------------------------------


DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhlleEEELLLllhhHHHHhHHHHhllLLEE-EEEEhhHHHLlhhhh
Query eaegtarfatflettgatGYVVHLsckpALDAaMAAKargVPIY-IESVipHFLLdktya  274
ident                               |               |             
Sbjct ------------------VGSGCD-kgeLFDN-VEDI--aRFYDfLEVH--PPDV-----  258
DSSP  ------------------EELLLL-lllLLLL-LLLL--hHHLLlEEEL--LHHH-----


DSSP  hllhhhhhllllllLLLL-----LHHHHHHHHHHHLLL----lLEEELLLLL-------L
Query erggveamkyimspPLRD-----KRNQKVLWDALAQGF----iDTVGTDHCP-------F  318
ident                                   | |                       
Sbjct --------------YKPLyvkdeEMIKNIIRSIVALGEkldipVVATGNVHYlnpedkiY  304
DSSP  --------------HLLLllllhHHHHHHHHHHHHHHHhllllEEELLLLLLllhhhhhH


DSSP  LHHHHHHHLlLHHHL---lllLLLLlLHHHHHHHHHLlllLLLHHHHHHHHLHHHHHHLL
Query DTEQKLLGKeAFTAI---pngIPAIeDRVNLLYTYGVsrgRLDIHRFVDAASTKAAKLFG  375
ident                              |           |              |   
Sbjct RKILIHSQG-GANPLnrhelpDVYF-RTTNEMLDCFS---FLGPEKAKEIVVDNTQKIAS  359
DSSP  HHHHHHLLH-HHLLLllllllLLLL-LLHHHHHHHHH---HHHHHHHHHHHLHHHHHHHH


DSSP  Llllllllllllllleeeeelllleellhhhllllllllllllleelleeeeeeelleee
Query Lfprkgtiavgsdadlvvydpqyrgtisvktqhvnndyngfegfeidgrpsvvtvrgkva  435
ident |                                                           
Sbjct L-----------------------------------------------------------  360
DSSP  L-----------------------------------------------------------


DSSP  eelleelllllllllLLLL-----------------------------------------
Query vrdgqfvgekgwgklLRRE-----------------------------------------  454
ident                                                             
Sbjct ---------------IGDVkpikdelytpriegadeeiremsyrrakeiygdplpklvee  405
DSSP  ---------------LLLLllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllhhhhh


DSSP  ------------------------------------------------------------
Query ------------------------------------------------------------  454
ident                                                             
Sbjct rlekelksiighgfaviylishklvkkslddgylvgsrgsvgssfvatmteitevnplpp  465
DSSP  hhhhhhhhhhhlllhhhhhhhhhhhhhhhhllllleelhhhhhlhhhhhlllllllllll


DSSP  ------------------------------------------------------------
Query ------------------------------------------------------------  454
ident                                                             
Sbjct hyvcpnckhseffndgsvgsgfdlpdkncprcgtkykkdghdipfetflgfkgdkvpdid  525
DSSP  eeelllllleeellllllllhhhllllllllllllleeellllllhhhhlllllllllee


DSSP  ------------------------------------------------------------
Query ------------------------------------------------------------  454
ident                                                             
Sbjct lnfsgeyqprahnytkvlfgednvyragtigtvadktaygfvkayasdhnlelrgaeidr  585
DSSP  eeeelllhhhhhhhhhhhhlllleeeeeeeeellhhhhhhhhhhhhhhllllllhhhhhh


DSSP  ------------------------------------------------------------
Query ------------------------------------------------------------  454
ident                                                             
Sbjct laagctgvkrttgqhpggiivvpdymeiydftpiqypaddtssewrtthfdfhsihdnll  645
DSSP  hhhhhllleeeeeeeeeeeeellllllhhhllleelhhhllllllleeeeehhhhlllll


DSSP  ------------------------------------------------------------
Query ------------------------------------------------------------  454
ident                                                             
Sbjct kldilghddptvirmlqdlsgidpktiptddpdvmgifssteplgvtpeqimcnvgtigi  705
DSSP  eeeeeeehhhhhhhhhhhhhlllhhhlllllhhhhhlllllhhhlllhhhhlllllllll


DSSP  ------------------------------------------------------------
Query ------------------------------------------------------------  454
ident                                                             
Sbjct pefgtrfvrqmleetrpktfselvqisglshgtdvwlgnaqeliqngtctlsevigcrdd  765
DSSP  lllllhhhhhhhhhhllllhhhhhhhhhhllllllllllhhhhhhlllllhhhllllhhh


DSSP  ------------------------------------------------------------
Query ------------------------------------------------------------  454
ident                                                             
Sbjct imvyliyrglepslafkimesvrkgkgltpefeaemrkhdvpewyidsckkikymfpkah  825
DSSP  hhhhhhhllllhhhhhhhhhhhlllllllhhhhhhhhhllllhhhhhhhhhllllllhhh


DSSP  ------------------------------------------------------------
Query ------------------------------------------------------------  454
ident                                                             
Sbjct aaayvlmavriayfkvhhpllyyasyftvraedfdldamikgsaairkrieeinakgiqa  885
DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhllllllhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhlhhhl


DSSP  ------------------------------------------------------------
Query ------------------------------------------------------------  454
ident                                                             
Sbjct takekslltvlevalemcergfsfknidlyrsqatefvidgnslippfnaipglgtnvaq  945
DSSP  lhhhhhhhhhhhhhhhhhhllleellllllllllllleeelleeellhhhlllllhhhhh


DSSP  ---------------------------------------------llll
Query ---------------------------------------------pmyf  458
ident                                                  
Sbjct aivrareegeflskedlqqrgklsktlleylesrgcldslpdhnqlslf  994
DSSP  hhhhhhhllllllhhhhhhhhlllhhhhhhhhhllllllllllllllll

No 54: Query=1gkpA Sbjct=3dcpA Z-score=9.0

DSSP  leeeelleeeelleeeeleeeelllllleeellllllllleeeelllleeeeLEEEEEEL
Query pllikngeiitadsrykadiyaegetitrigqnleappgtevidatgkyvfpGFIDPHVH   60
ident                                                        | | |
Sbjct ----------------------------------------------------XKRDGHTH    8
DSSP  ----------------------------------------------------LLEEEEEL


DSSP  L-LLEElleELLLLHHHHHHHHHHLLEEEEEEEELLLL---------------------L
Query I-YLPFmatFAKDTHETGSKAALMGGTTTYIEMCCPSR---------------------N   98
ident     |       |  |     |       |                              
Sbjct TeFCPH---GTHDDVEEXVLKAIELDFDEYSIVEHAPLssefxkntagdkeavttasxaX   65
DSSP  LlLLLL---LLLLLHHHHHHHHHHLLLLEEEEEEELLLlhhhhhllllllhhhhlllllH


DSSP  LLHHHHHHHHHHHHLLLL-LLEEEEEEelllllllhhhhhhhhhhlllleeEEEELllll
Query DDALEGYQLWKSKAEGNS-YCDYTFHMavskfdektegqlreivadgissfXIFLSyknf  157
ident  |                                                          
Sbjct SDLPYYFKKXNHIKKKYAsDLLIHIGF------------------------EVDYL----   97
DSSP  HHHHHHHHHHHHHHHHLLlLLEEEEEE------------------------EEELL----


DSSP  lllLHHHHHHHHHHhhhhlleEEEEELLhhhHHHH----------------HHHHhhlll
Query fgvDDGEMYQTLRLakelgviVTAHCENaelVGRL----------------QQKLlsegk  201
ident            |                                                
Sbjct -igYEDFTRDFLNEygpqtddGVLSLHF---LEGQggfrsidfsaedynegIVQF-----  148
DSSP  -llLHHHHHHHHHHhhhhlleEEEELLE---EEELleeeellllhhhhhhhLHHH-----


DSSP  llhHHLLLL-LLHHHHHHHHHhhHHHHhhhLLEE-EELLLL-------------------
Query tgpEWHEPS-RPEAVEAEGTArfATFLettGATG-YVVHLS-------------------  240
ident                        |              | |                   
Sbjct -ygGFEQAQlAYLEGVKQSIE--ADLG---LFKPrRXGHISlcqkfqqffgedtsdfsee  202
DSSP  -hlLHHHHHhHHHHHHHHHHH--LLLL---LLLLlEELLLLhhhllhhhhlllhhhllhh


DSSP  ----LHHHHHHHHHHHhllllEEEEEEH----------HHHHllhhhhhllhhhhhllll
Query ----CKPALDAAMAAKargvpIYIESVI----------PHFLldktyaerggveamkyim  286
ident         |                                                   
Sbjct vxekFRVILALVKKRD-----YELDFNTaglfkplcgeTYPP------------------  239
DSSP  hhhhHHHHHHHHHHHL-----LEEEEELhhhhllllllLLLL------------------


DSSP  lllllllhhHHHHHHHHHLLLLLEEELLLLLllhhhhhhhlllhhhlllllLLLLLHHHH
Query spplrdkrnQKVLWDALAQGFIDTVGTDHCPfdteqkllgkeaftaipngiPAIEDRVNL  346
ident           |    |         | |                         |      
Sbjct ---------KKIVTLASELQIPFVYGSDSHG-------------------vQDIGRGYST  271
DSSP  ---------HHHHHHHHHLLLLEEEELLLLL-------------------hHHLLLLHHH


DSSP  HHHHHLllllllhhhhhhhhlhhhhhhllllllllllllllllleeeeelllleellhhh
Query LYTYGVsrgrldihrfvdaastkaaklfglfprkgtiavgsdadlvvydpqyrgtisvkt  406
ident                                                             
Sbjct YCQKLE------------------------------------------------------  277
DSSP  HHHHLL------------------------------------------------------


DSSP  llllllllllllleelleeeeeeelleeeeelleelllllllllllllllll
Query qhvnndyngfegfeidgrpsvvtvrgkvavrdgqfvgekgwgkllrrepmyf  458
ident                                                     
Sbjct ----------------------------------------------------  277
DSSP  ----------------------------------------------------

No 55: Query=1gkpA Sbjct=1m65A Z-score=8.8

DSSP  leeeelleeeelleeeeleeeelllllleeellllllllleeeelllleeeelEEEEEEL
Query pllikngeiitadsrykadiyaegetitrigqnleappgtevidatgkyvfpgFIDPHVH   60
ident                                                        | | |
Sbjct ----------------------------------------------------yPVDLHMH    8
DSSP  ----------------------------------------------------lLEELLLL


DSSP  LLLEElleELLLLHHHHHHHHHHLLEEEEEEEELLLLLL--lhHHHHHHhHHHHL-lllL
Query IYLPFmatFAKDTHETGSKAALMGGTTTYIEMCCPSRND--daLEGYQLwKSKAE-gnsY  117
ident          |  |       |   |                                   
Sbjct TVAST---HAYSTLSDYIAQAKQKGIKLFAITDHGPDMEdaphHWHFIN-MRIWPrvvdG   64
DSSP  LLLLL---LLLLLHHHHHHHHHHHLLLEEEEEEELLLLLllllLHHHHH-HHHLLleelL


DSSP  LEEEEEEELLLLL-llhhhHHHHHHhLLLLEEEEEeLLLLL-----lllLHHHHHHHHHH
Query CDYTFHMAVSKFD-ektegQLREIVaDGISSFXIFlSYKNF-----fgvDDGEMYQTLRL  171
ident                           |                          |  |   
Sbjct VGILRGIEANIKNvdgeidCSGKMF-DSLDLIIAG-FHEPVfaphdkatNTQAMIATIAS  122
DSSP  EEEEEEEEEELLLllllllLLHHHH-HHLLEEEEE-LLLLLlllllhhhHHHHHHHHHHL


DSSP  HhhhlLEEEE-EELLHHHhhhhhhhhhhlllllhhhllllllhhhhhHHHHHHHHHHHhh
Query AkelgVIVTA-HCENAELvgrlqqkllsegktgpewhepsrpeaveaEGTARFATFLEtt  230
ident            |  |                                      |      
Sbjct G----NVHIIsHPGNPKY----------------------------eIDVKAVAEAAA--  148
DSSP  L----LLLEElLLLLLLL----------------------------lLLHHHHHHHHH--


DSSP  LLEEEELL---llLHHHHHHHHHHHhllllEEEEEE-----------HHHHhllhhhhhl
Query GATGYVVH---lsCKPALDAAMAAKargvpIYIESV-----------IPHFlldktyaer  276
ident              |     |   |                                    
Sbjct KHQVALEInnssnCREVAAAVRDAG-----GWVALGsdshtaftmgeFEEC---------  194
DSSP  HHLLEEEEellllHHHHHHHHHHHL-----LLEEEElllllhhhlllLHHH---------


DSSP  lhhhhhlllllllllllhhHHHHHHHhhLLLLLEEelllllllhhhhhhhlllhhhllll
Query ggveamkyimspplrdkrnQKVLWDAlaQGFIDTVgtdhcpfdteqkllgkeaftaipng  336
ident                     | |                                     
Sbjct -------------------LKILDAVdfPPERILN-------------------------  210
DSSP  -------------------HHHHHHLllLHHHLHH-------------------------


DSSP  llllllhhhhhhhhhlllllllhhhhhhHHLHHHHHHLL--------lLLLLllllllll
Query ipaiedrvnllytygvsrgrldihrfvdAASTKAAKLFG--------lFPRKgtiavgsd  388
ident                                                 |           
Sbjct ----------------------------VSPRRLLNFLEsrgmapiaeFADL--------  234
DSSP  ----------------------------HLHHHHHHHHHhllllllhhHLLL--------


DSSP  lleeeeelllleellhhhllllllllllllleelleeeeeeelleeeeelleelllllll
Query adlvvydpqyrgtisvktqhvnndyngfegfeidgrpsvvtvrgkvavrdgqfvgekgwg  448
ident                                                             
Sbjct ------------------------------------------------------------  234
DSSP  ------------------------------------------------------------


DSSP  llllllllll
Query kllrrepmyf  458
ident           
Sbjct ----------  234
DSSP  ----------

No 56: Query=1gkpA Sbjct=1bksA Z-score=7.9

DSSP  leeeelleeeelleeeeleeeelllllleeellllllllleeeelllleEEELeEEEEEL
Query pllikngeiitadsrykadiyaegetitrigqnleappgtevidatgkyVFPGfIDPHVH   60
ident                                                             
Sbjct -------------------------------------meryenlfaqlnDRREgAFVPFV   23
DSSP  -------------------------------------lhhhhhhhhhhhHLLLlEEEEEE


DSSP  lLLEE-lleelLLLHhHHHHHHhhlleeeEEEEELLLLL--------------------l
Query iYLPF-matfaKDTHeTGSKAAlmggtttYIEMCCPSRN--------------------d   99
ident            |    |   |                                       
Sbjct tLGDPgieqslKIID-TLIDAG------aDALELGVPFSdpladgptiqnanlrafaagv   76
DSSP  eLLLLlhhhhhHHHH-HHHHLL------lLLEEEELLLLllllllhhhhhhhhhhhhhll


DSSP  LHHHHHHHHHHHHLLLlllEEEEEEELLL--LLLL-HHHHHHHHHHLLLLEEEEEellll
Query DALEGYQLWKSKAEGNsycDYTFHMAVSK--FDEK-TEGQLREIVADGISSFXIFlsykn  156
ident              |                                 |  |         
Sbjct TPAQCFEMLALIREKH--pTIPIGLLMYAnlVFNNgIDAFYARCEQVGVDSVLVA-----  129
DSSP  LHHHHHHHHHHHHHHL--lLLLEEEEELHhhHHLLlHHHHHHHHHHHLLLEEEEL-----


DSSP  llLLLHHHHHHHHHHHHHHLLEEEEEELlhhhhhhhhhhhhhlllllhhhllllllhhHH
Query ffGVDDGEMYQTLRLAKELGVIVTAHCEnaelvgrlqqkllsegktgpewhepsrpeaVE  216
ident    |   |       |          |                                 
Sbjct --DVPVEESAPFRQAALRHNIAPIFICP-----------------------------pNA  158
DSSP  --LLLHHHLHHHHHHHHHLLLEEEEEEL-----------------------------lLL


DSSP  HH-HHHHHHHHHhhhllEEEELLL--lLHHHHHHHHHHHhllllEEEEEE--HHHHHllh
Query AE-GTARFATFLettgaTGYVVHL--sCKPALDAAMAAKargvpIYIESV--IPHFLldk  271
ident         |         ||   |                            |       
Sbjct DDdLLRQVASYG-----RGYTYLLalpLHHLIEKLKEYH----aAPALQGfgISSPE---  206
DSSP  LHhHHHHHHHHL-----LLLEEELlllHHHHHHHHHHHL----lLLEEELllLLLHH---


DSSP  hhhhllhhhhhlllllllllllhhhhhhHHHHHlLLLLEEELL--LLLL---LHHHHhhh
Query tyaerggveamkyimspplrdkrnqkvlWDALAqGFIDTVGTD--HCPF---DTEQKllg  326
ident                               |                             
Sbjct --------------------------qvSAAVR-AGAAGAISGsaIVKIiekNLASP---  236
DSSP  --------------------------hhHHHHH-HLLLEEEELlhHHHHhhhLLLLH---


DSSP  lllhhhllllllLLLLHHHHHHhhhlllllllhhhhhhhhlhhhhhhlllllllllllll
Query keaftaipngipAIEDRVNLLYtygvsrgrldihrfvdaastkaaklfglfprkgtiavg  386
ident                                                             
Sbjct ---kqmlaelrsFVSAMKAASR--------------------------------------  255
DSSP  ---hhhhhhhhhHHHHHHHLLL--------------------------------------


DSSP  lllleeeeelllleellhhhllllllllllllleelleeeeeeelleeeeelleelllll
Query sdadlvvydpqyrgtisvktqhvnndyngfegfeidgrpsvvtvrgkvavrdgqfvgekg  446
ident                                                             
Sbjct ------------------------------------------------------------  255
DSSP  ------------------------------------------------------------


DSSP  llllllllllll
Query wgkllrrepmyf  458
ident             
Sbjct ------------  255
DSSP  ------------

No 57: Query=1gkpA Sbjct=2yb1A Z-score=5.7

DSSP  leeeelleeeelleeeeleeeelllllleeellllllllleeeelllleeeelEEEEEEL
Query pllikngeiitadsrykadiyaegetitrigqnleappgtevidatgkyvfpgFIDPHVH   60
ident                                                       || | |
Sbjct ----------------------------------------------------aNIDLHFH    8
DSSP  ----------------------------------------------------lLEELLLL


DSSP  LLLEelleeLLLLHHHHHHHHHHLLEEEEEEEELLlllllhhhhHHHHHHHHLLLL---L
Query IYLPfmatfAKDTHETGSKAALMGGTTTYIEMCCPsrnddalegYQLWKSKAEGNS---Y  117
ident             |       |                              |        
Sbjct SRTS----dGALTPTEVIDRAAARAPALLALTDHD---------CTGGLAEAAAAAarrG   55
DSSP  LLLL----lLLLLHHHHHHHHHLLLLLEEEELLLL---------LLLLHHHHHHHHhhlL


DSSP  LEEEEEEELLL------------llllhhHHHHH--------------------------
Query CDYTFHMAVSK------------fdekteGQLRE--------------------------  139
ident         ||                     |                            
Sbjct IPFLNGVEVSVswgrhtvhivglgidpaePALAAglksiregrlerarqmgasleaagia  115
DSSP  LLEEEEEEEEEeelleeeeeeeellllllHHHHHhhhhhhllhhhhhhhhhhhhhhllll


DSSP  -----------------------------------hhhlllleeeeeellLLLLlllhhH
Query -----------------------------------ivadgissfxiflsyKNFFgvddgE  164
ident                                                             
Sbjct gcfdgamrwcdnpemisrthfarhlvdsgavkdmrtvfrkyltpgkpgyvSHQW----aS  171
DSSP  lhhhhhhlllllhhhllhhhhhhhhhhllllllhhhhhhhllllllllllLLLL----lL


DSSP  HHHHHHHHHHHLLEEEEE-ELLHhhhhhhhhhhhhlllllhhhllllllhhHHHH-hHHH
Query MYQTLRLAKELGVIVTAH-CENAelvgrlqqkllsegktgpewhepsrpeaVEAE-gTAR  222
ident            |                                               |
Sbjct LEDAVGWIVGAGGMAVIAhPGRY----------------------------DMGRtlIER  203
DSSP  HHHHHHHHHHLLLEEEELlHHHL----------------------------LLLHhhHHH


DSSP  HHHHHHHHlLEEEEL----LLLLHHHHHHHHHHHHllLLEEEEeehhhhhllhhhhhllh
Query FATFLETTgATGYVV----HLSCKPALDAAMAAKArgVPIYIEsviphflldktyaergg  278
ident                      |       |  |       |                   
Sbjct LILDFQAA-GGQGIEvasgSHSLDDMHKFALHADR--HGLYAS-----------------  243
DSSP  HHHHHHHL-LLLEEEeeelLLLHHHHHHHHHHHHH--HLLEEE-----------------


DSSP  hhhhlllllllllllhhhhhhhhhhhllllleEELLLLLLLhhhhhhhlllhhhllllLL
Query veamkyimspplrdkrnqkvlwdalaqgfidtVGTDHCPFDteqkllgkeaftaipngIP  338
ident                                  | |                        
Sbjct --------------------------------SGSDFHAPG-----------------ED  254
DSSP  --------------------------------EELLLLLLL-----------------LL


DSSP  LLllhhhhhhhhhlllllllhhhhhhhhlhHHHHHLLLlllllllllllllleeeeelll
Query AIedrvnllytygvsrgrldihrfvdaastKAAKLFGLfprkgtiavgsdadlvvydpqy  398
ident                                                             
Sbjct VG------------------htedlppicrPIWRELEA----------------------  274
DSSP  LL------------------llllllllllLHHHHLHH----------------------


DSSP  leellhhhllllllllllllleelleeeeeeELLEeeeelleelllllllllllllllll
Query rgtisvktqhvnndyngfegfeidgrpsvvtVRGKvavrdgqfvgekgwgkllrrepmyf  458
ident                                                             
Sbjct ---------------------------rilrPADA-----------------------en  284
DSSP  ---------------------------hlllLLHH-----------------------hl

No 58: Query=1gkpA Sbjct=2anuA Z-score=5.6

DSSP  leeeelleeeelleeeeleeeelllllleeellllllllleeeelllleeEELEEEEEEL
Query pllikngeiitadsrykadiyaegetitrigqnleappgtevidatgkyvFPGFIDPHVH   60
ident                                                        | |||
Sbjct -------------------------------------------------tEWLLCDFHVH   11
DSSP  -------------------------------------------------lEEEEEEEEEL


DSSP  LLLEelleELLLLHHHHHHHHHHLLEEEEEEEELLLLL--------------llHHHHHH
Query IYLPfmatFAKDTHETGSKAALMGGTTTYIEMCCPSRN--------------ddALEGYQ  106
ident                         |                                  |
Sbjct TNXS----DGHLPLGEVVDLFGKHGVDVVSITDHIVDRrtleqrkrngeplgaiTEDKFQ   67
DSSP  LLLL----LLLLLHHHHHHHHHHLLLLEEEEEEEEELHhhhhhhhhllllllllLLLLHH


DSSP  HHHHHHLLLL-------lLEEE-EEEE------------------LLLLlllhhhhhhhh
Query LWKSKAEGNS-------yCDYT-FHMA------------------VSKFdektegqlrei  140
ident                                                             
Sbjct DYLKRLWREQkraweeygXILIpGVEItnntdlyhivavdvkeyvDPSL-----------  116
DSSP  HHHHHHHHHHhhhhhhhlLEEEeEEEEeelllleeeeeellllllLLLL-----------


DSSP  hhlllleeeeeelllllllllhhHHHHHHHHHHHHLLEEEEEEllhhhhhhhhhhhhhll
Query vadgissfxiflsyknffgvddgEMYQTLRLAKELGVIVTAHCenaelvgrlqqkllseg  200
ident                                 ||    | |                   
Sbjct -----------------------PVEEIVEKLKEQNALVIAAH-----------------  136
DSSP  -----------------------LHHHHHHHHHHLLLEEEELL-----------------


DSSP  lllhhhllllllHHHHhHHHHHhHHHHHhhLLEEEELllllhhhhhhhhhhhhlllleee
Query ktgpewhepsrpEAVEaEGTARfATFLEttGATGYVVhlsckpaldaamaakargvpiyi  260
ident                     |                                       
Sbjct --------pdrkKLSW-YLWAN-XERFK--DTFDAWE-----------------------  161
DSSP  --------llllLLLL-HHHHL-LLLLL--LLLLEEE-----------------------


DSSP  EEEHHHHhllhhhhhllhhhhhlllllllllllhhhhhhhhhhhllllLEEELLLLLllh
Query ESVIPHFlldktyaerggveamkyimspplrdkrnqkvlwdalaqgfiDTVGTDHCPfdt  320
ident                                                      |      
Sbjct IANRDDL-------------------------------fnsvgvkkyrYVANSDFHE---  187
DSSP  EEELLEE-------------------------------lhhhhhllllEEEELLLLL---


DSSP  hhhhhhlllhhhllllLLLLllhhhhhhhhhlllllllhhhhhhhHLHH----hhHHLLL
Query eqkllgkeaftaipngIPAIedrvnllytygvsrgrldihrfvdaASTK----aaKLFGL  376
ident                                                 |           
Sbjct ---------------lWHVY----------------------swkTLVKseknieAIKEA  210
DSSP  ---------------hHHHL----------------------leeEEEEelllhhHHHHH


DSSP  lllllllllllllleeeeelllleellhhhllllllllllllleelleeeeeeelleeee
Query fprkgtiavgsdadlvvydpqyrgtisvktqhvnndyngfegfeidgrpsvvtvrgkvav  436
ident                                                             
Sbjct ------------------------------------------------------------  210
DSSP  ------------------------------------------------------------


DSSP  elleelllllllllllllllll
Query rdgqfvgekgwgkllrrepmyf  458
ident                       
Sbjct --------irkntdvaiylxrk  224
DSSP  --------hhhllleeeeelll

No 59: Query=1gkpA Sbjct=3e38A Z-score=5.6

DSSP  leeeelleeEELLEeeeleeeelllllleeellllllllleeeelllleeeELEEEEEEL
Query pllikngeiITADSrykadiyaegetitrigqnleappgtevidatgkyvfPGFIDPHVH   60
ident             |                                          | | |
Sbjct aqrrneiqvPDLDG-----------------------------------ytTLKCDFHXH   25
DSSP  lllllllllLLLLL-----------------------------------leEEEEELLLL


DSSP  LLLeelleELLLLHHHHHHHHHHLLEEEEEEEELLL---llllhhHHHHHHHHHHLLLL-
Query IYLpfmatFAKDTHETGSKAALMGGTTTYIEMCCPS---rnddalEGYQLWKSKAEGNS-  116
ident                     |   |                                   
Sbjct SVF----sDGLVWPTVRVDEAYRDGLDAISLTEHIEyrphkqdvvSDHNRSFDLCREQAe   81
DSSP  LLL----lLLLLLHHHHHHHHHHLLLLEELLEEELLlllllllllLLLLHHHHHHHHHHh


DSSP  --LLEEEEEEELLlllllhhhhhhhhhhlllleeeeeelllllLLLL-------------
Query --YCDYTFHMAVSkfdektegqlreivadgissfxiflsyknfFGVD-------------  161
ident                                                             
Sbjct klGILLIKGSEIT------------------------------RAXApghfnaiflsdsn  111
DSSP  hhLLEELLEEEEE------------------------------LLLLlleeeeelllllh


DSSP  ---hhHHHHHHHHHHHHLLEEE-EEEL--lHHHHhhhhhhhhhlllllhhhllllllhhH
Query ---dgEMYQTLRLAKELGVIVT-AHCE--nAELVgrlqqkllsegktgpewhepsrpeaV  215
ident            | ||  |      |                                   
Sbjct pleqkDYKDAFREAKKQGAFXFwNHPGwdsQQPD-------------------------T  146
DSSP  hhlllLHHHHHHHHHHLLLEEEeLLLLlllLLLL-------------------------L


DSSP  HHHhhHHHHHHHHHHLLEEEELLL----LLHHHHHHHHHHHhllllEEEEeehhhhhllh
Query EAEgtARFATFLETTGATGYVVHL----SCKPALDAAMAAKargvpIYIEsviphflldk  271
ident          | |   |                |                           
Sbjct TKW--WPEHTALYQEGCXHGIEVAnghlYXPEAIQWCLDKN-----LTXI----------  189
DSSP  LLL--LHHHHHHHHLLLLLEEEEEelleELLHHHHHHHHHL-----LEEE----------


DSSP  hhhhllhhhhhlllllllllllhhhhhhhhhhhllllleEELLLLLLlhhhhhhhlllhh
Query tyaerggveamkyimspplrdkrnqkvlwdalaqgfidtVGTDHCPFdteqkllgkeaft  331
ident                                           |                 
Sbjct ---------------------------------------GTSDIHQP-------------  197
DSSP  ---------------------------------------EELLLLLL-------------


DSSP  hllllllllllhhhHHHHHHlllllllhhhhhhhHLHHhhhhlllLLLL-----------
Query aipngipaiedrvnLLYTYGvsrgrldihrfvdaASTKaaklfglFPRK-----------  380
ident                                                             
Sbjct ---------iqtdyDFEKGE----------hrtxTFVF-------AKERslqgirealdn  231
DSSP  ---------hhhhlLHHHLL----------llleEEEE-------ELLLlhhhhhhhhhl


DSSP  ---------------------------------lllllllllleeeEELLlleellhhhl
Query ---------------------------------gtiavgsdadlvvYDPQyrgtisvktq  407
ident                                                             
Sbjct rrtaayfhelligredllrpffekcvkieevsrneqgvtlsitnvtDLVLklkktahdtl  291
DSSP  lleeeeelleeellhhhhhhhhhhheeeeeeeeelleeeeeeeellLLLEeeeellllll


DSSP  lllllllllllleelleeeeeeelleeeeelleelllllllllllllllll
Query hvnndyngfegfeidgrpsvvtvrgkvavrdgqfvgekgwgkllrrepmyf  458
ident                                                    
Sbjct lvyfrdxtlkphtrytvrigfkqgikggdvnfevtnfivapdkglkytisl  342
DSSP  eellleeeellleeeeeeeeellllllleeeeeeeeeeeelleeeeeeeel