Select neighbours (check boxes) for viewing as multiple structural alignment or 3D superimposition.
The list of neighbours is sorted by Z-score. Similarities with a Z-score lower than 2 are spurious.
Each neighbour has links to pairwise structural alignment with the query structure,
and to the PDB format coordinate file where the neighbour
is superimposed onto the query structure.
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Summary
No: Chain Z rmsd lali nres %id PDB Description
1
: 1bks-A 49.7 0.0 255 255 100 PDB MOLECULE: TRYPTOPHAN SYNTHASE;
2
DSSP LHHHHHHHHHHHHLLLLEEEEEEELLLLLHHHHHHHHHHHHHLLLLLEEEELLLLLLLLL Query MERYENLFAQLNDRREGAFVPFVTLGDPGIEQSLKIIDTLIDAGADALELGVPFSDPLAD 60 ident |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct MERYENLFAQLNDRREGAFVPFVTLGDPGIEQSLKIIDTLIDAGADALELGVPFSDPLAD 60 DSSP LHHHHHHHHHHHHLLLLEEEEEEELLLLLHHHHHHHHHHHHHLLLLLEEEELLLLLLLLL DSSP LHHHHHHHHHHHHHLLLHHHHHHHHHHHHHHLLLLLEEEEELHHHHHLLLHHHHHHHHHH Query GPTIQNANLRAFAAGVTPAQCFEMLALIREKHPTIPIGLLMYANLVFNNGIDAFYARCEQ 120 ident |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct GPTIQNANLRAFAAGVTPAQCFEMLALIREKHPTIPIGLLMYANLVFNNGIDAFYARCEQ 120 DSSP LHHHHHHHHHHHHHLLLHHHHHHHHHHHHHHLLLLLEEEEELHHHHHLLLHHHHHHHHHH DSSP HLLLEEEELLLLHHHLHHHHHHHHHLLLEEEEEELLLLLHHHHHHHHHHLLLLEEELLLL Query VGVDSVLVADVPVEESAPFRQAALRHNIAPIFICPPNADDDLLRQVASYGRGYTYLLALP 180 ident |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct VGVDSVLVADVPVEESAPFRQAALRHNIAPIFICPPNADDDLLRQVASYGRGYTYLLALP 180 DSSP HLLLEEEELLLLHHHLHHHHHHHHHLLLEEEEEELLLLLHHHHHHHHHHLLLLEEELLLL DSSP HHHHHHHHHHHLLLLEEELLLLLLHHHHHHHHHHLLLEEEELLHHHHHHHHLLLLHHHHH Query LHHLIEKLKEYHAAPALQGFGISSPEQVSAAVRAGAAGAISGSAIVKIIEKNLASPKQML 240 ident |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct LHHLIEKLKEYHAAPALQGFGISSPEQVSAAVRAGAAGAISGSAIVKIIEKNLASPKQML 240 DSSP HHHHHHHHHHHLLLLEEELLLLLLHHHHHHHHHHLLLEEEELLHHHHHHHHLLLLHHHHH DSSP HHHHHHHHHHHHLLL Query AELRSFVSAMKAASR 255 ident ||||||||||||||| Sbjct AELRSFVSAMKAASR 255 DSSP HHHHHHHHHHHHLLL
DSSP lhhhhhhhhhhhhlllleEEEEEelllllhhhhhHHHHHHHHLL------lLLEEEELL- Query meryenlfaqlndrregaFVPFVtlgdpgieqslKIIDTLIDAG------aDALELGVP- 53 ident | | Sbjct ---------------liiDGHTH---------viLPVEKHIKIMdeagvdkTILFSTSIh 36 DSSP ---------------lleEEEEE---------llLLHHHHHHHHhhhllleEEEELLLLl DSSP --llllllllHHHHHHH-----hhhhhhlLLHHHHHHHHHHHHHHLLL-LLEEEEELHHh Query --fsdpladgPTIQNAN-----lrafaagVTPAQCFEMLALIREKHPT-IPIGLLMYANl 105 ident | | Sbjct petavnlrdvKKEMKKLndvvngktnsmiDVRRNSIKELTNVIQAYPSrYVGFGNVPVG- 95 DSSP hhhlllhhhhHHHHHHHhhhhlllllllhHHHHHHHHHHHHHHHHLLLlEEEEELLLLL- DSSP hHLLLHHHHHHH-HHHHLLLEEE-ELLL--LHHHLHHHHHHHHHLL-LEEEEEELLLLLH Query vFNNGIDAFYAR-CEQVGVDSVL-VADV--PVEESAPFRQAALRHN-IAPIFICPPNADD 160 ident | | Sbjct lSENDTNSYIEEnIVNNKLVGIGeLTPAsgQIKSLKPIFKYSMDSGsLPIWIHAFNPLVL 155 DSSP lLHHHHHHHHHHhLLLLLLLEEEeELLLllLHHHHHHHHHHHHHLLlLLEEELLLLLLLH DSSP HHHHHHHHHL------LLLEEE-llLLHHHHHHHHHHHLLLLEEELLllllhhHHHHHHH Query DLLRQVASYG------RGYTYL-laLPLHHLIEKLKEYHAAPALQGFgisspeQVSAAVR 213 ident | | || Sbjct QDIKEIAELCkafpkvPVILGHmggSNWMTAVELAKEIQNLYLDTSA----yfSTFVLKI 211 DSSP HHHHHHHHHHhhllllLEEEHHhhhHHHHHHHHHHHHLLLEEEELLL----llLHHHHHH DSSP HL-----lLEEEELLHHhhhhhhllllhhhhhhhhhhHHHHHHHLLL------------- Query AG-----aAGAISGSAIvkiieknlaspkqmlaelrsFVSAMKAASR------------- 255 ident | Sbjct VInelplkCIFGTDMPF-------------------gDLQLSIEAIKkmsndsyvanavl 252 DSSP HHhhllllEELLLLLLL-------------------lLHHHHHHHHHhhlllhhhhhhhh DSSP ---------- Query ---------- 255 ident Sbjct gdnisrllni 262 DSSP lhhhhhhhll
DSSP ------------------------------------------------lhhhhhhhhhhh Query ------------------------------------------------meryenlfaqln 12 ident Sbjct lncervwlnvtpatlrsdladygllephalgvhegrihalvpxqdlkypahwqdxkgklv 60 DSSP lllleeeeeeeellllllllllllllleeeeeelleeeeeeehhhllllllleellllee DSSP HLLLLEEEEEEELL----------------------------------lLLHHHHHHHHH Query DRREGAFVPFVTLG----------------------------------dPGIEQSLKIID 38 ident | Sbjct TPGLIDCHTHLIFAgsraeefelrqkgvpyaeiarkgggiistvratraASEDQLFELAL 120 DSSP EELEEEEEELLLLLlllhhhhhhhhhlllhhhhhhllllhhhhhhhhhhLLHHHHHHHHH DSSP HHHHLL------lLLEEEELLLlllllllhhhhhhhhhhhhhllLHHHHHHHHHHHHHHL Query TLIDAG------aDALELGVPFsdpladgptiqnanlrafaagvTPAQCFEMLALIREKH 92 ident | | | | Sbjct PRVKSLiregvttVEIKSGYGL----------------------TLEDELKXLRVARRLG 158 DSSP HHHHHHhhhleeeEEEELLLLL----------------------LHHHHHHHHHHHHHHH DSSP L----LLLEEEE--ELHH-------hhHLLL-HHHHHHHHH-HHLLLEEEEL----LLLH Query P----TIPIGLL--MYAN-------lvFNNG-IDAFYARCE-QVGVDSVLVA----DVPV 133 ident || | | | Sbjct EalpiRVKTTLLaaHAVPpeyrddpdsWVETiCQEIIPAAAeAGLADAVDVFcehiGFSL 218 DSSP HhlllEEEEEEEeeLLLLhhhlllhhhHHHHhHHLHHHHHHhLLLLLEEEEEelllLLLH DSSP HHLHHHHHHHHHLLLEEEEEEL-LLLLhhHHHHHHHHLLLLEEELlllHHHHHHHHHHHL Query EESAPFRQAALRHNIAPIFICP-PNADddLLRQVASYGRGYTYLLalpLHHLIEKLKEYH 192 ident || | | | | | | Sbjct AQTEQVYLAADQYGLAVKGHXDqLSNL-gGSTLAANFGALSVDHLeylDPEGIQALAHRG 277 DSSP HHHHHHHHHHHHLLLEEEEEELlLLLL-lHHHHHHHLLLLEEEELlllLHHHHHHHHHHL DSSP LlLEEELLLLLL--------hhhhhhhhhhLLLEE-EELL-HHHHhhhhllllhhhhhhh Query AaPALQGFGISS--------peqvsaavraGAAGA-ISGS-AIVKiieknlaspkqmlae 242 ident | | Sbjct V-VATLLPTAFYflketklppvvalrkagvPXAVSsDINPgTAPI--------------- 321 DSSP L-EEEELHHHHHhllllllllhhhhhhlllLEEELlLLLLlLLLL--------------- DSSP hhhhhhhHHHLLL----------------------------------------------- Query lrsfvsaMKAASR----------------------------------------------- 255 ident Sbjct ------vSLRXAXnxactlfgltpveaxagvtrhaaralgeqeqlgqlrvgxladflvwn 375 DSSP ------lLHHHHHhhhhhhhlllhhhhhhhllhhhhhhllllllllllllllllleeeel DSSP ---------------------------- Query ---------------------------- 255 ident Sbjct cghpaelsyligvdqlvsrvvngeetlh 403 DSSP lllllhhhhlllllleeeeeelleelll
DSSP ----------------------------------------------lhhhhhhhhhhhHL Query ----------------------------------------------meryenlfaqlnDR 14 ident Sbjct pstlirnaaaimtggrgtaddpsrvpgpdirivgdtidaigalaprpgetivdatdcvIY 60 DSSP leeeeellleelllllllllllllllllleeeelleeeeellllllllleeeelllleEE DSSP LLLEE-EEEEE---------lllLLHHHHHHHHHHHHHLL------lLLEEEELLLLlll Query REGAF-VPFVT---------lgdPGIEQSLKIIDTLIDAG------aDALELGVPFSdpl 58 ident | | Sbjct PAWVNtHHHLFqsllkgepfralFDERRFRLAARIGLIELarsgcatVADHNYVYYP--- 117 DSSP ELEELlLLLHHhhhllllllhhhLLHHHHHHHHHHHHHHHhllleeeEEELLLLLLL--- DSSP lllhhhhhhhhhhhhhllLHHHhhHHHHHHHHHLL----LLLEEEEELH----------- Query adgptiqnanlrafaagvTPAQcfEMLALIREKHP----TIPIGLLMYA----------- 103 ident | | Sbjct ------------------GMPF--DSSAILFEEAEklglRFVLLRGGATqtrqleadlpt 157 DSSP ------------------LLLL--LHHHHHHHHHHhlllEEEEEELLLLllllllllllh DSSP ---HHHHLlLHHHHHHHHHHHLL---------LEEEEL----LLLHHHLHHHHHHHHHLL Query ---NLVFNnGIDAFYARCEQVGV---------DSVLVA----DVPVEESAPFRQAALRHN 147 ident | | | | | Sbjct alrPETLD-AYVADIERLAARYHdaspramrrVVMAPTtvlySISPREMRETAAVARRLG 216 DSSP hhlLLLHH-HHHHHHHHHHHHLLllllllleeEEELLLllllLLLHHHHHHHHHHHHHLL DSSP LEEEEEELllllHHHHHHHHH----hlLLLEEELlLLHHHHHHHHHHhLLLLEEELlLLL Query IAPIFICPpnadDDLLRQVAS----ygRGYTYLLaLPLHHLIEKLKEyHAAPALQGfGIS 203 ident | | | | Sbjct LRMHSHLS---gKSPVAFCGEhdwlgsDVWYAHLvKVDADEIALLAQ-TGTGVAHC-PQS 271 DSSP LEEEEELL---lLLHHHHHHHllllllLEEEELLlLLLHHHHHHHHH-HLLEEEEL-HHH DSSP LhhhhhhhHHHL-----lLEEEELlHHHHhhhhllllhhhhhhhhhHHHHhhHHLLL--- Query SpeqvsaaVRAG-----aAGAISGsAIVKiieknlaspkqmlaelrSFVSamKAASR--- 255 ident || Sbjct N---grlpVREMadagvpVSIGVD-GAAS----------------nEAAD--MISEVhmt 309 DSSP H---hlllLLLHhhhlllEEELLL-HHHH----------------lLLLL--HHHHHhhh DSSP ------------------------------------------------------------ Query ------------------------------------------------------------ 255 ident Sbjct wlaqrarlasiaevihwgtaggarvmgldevgkvavgyaadiavyrlddpryfglhdpai 369 DSSP hhhhhhllllhhhhhhhhlhhhhhhhllllllllllllllleeeeelllhhhlllllhhh DSSP ---------------------------------------------------- Query ---------------------------------------------------- 255 ident Sbjct gpvasggrpsvmalfsagkrvvvddliegvdikelggearrvvrellrevvv 421 DSSP hhhhllllleeeeeeelleeeeellllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhl
DSSP ----------------------lhhhhhhhhhhHHLL----------------------- Query ----------------------meryenlfaqlNDRR----------------------- 15 ident | Sbjct epadlnddtlraravaaargdqrfdvlitggtlVDVVtgelrpadigivgaliasvhepa 60 DSSP llhhhllhhhhhhhhhhhhlllleeeeeelleeELLLllleeeleeeeelleeeeeelll DSSP ------------------lLEEE-EEEElllllhhHHHHHHHHHHHLLL-LLEEEELLll Query ------------------eGAFV-PFVTlgdpgieQSLKIIDTLIDAGA-DALELGVPfs 55 ident | Sbjct srrdaaqvidaggayvspgLIDThXHIE---ssxiTPAAYAAAVVARGVtTIVWDPHE-- 115 DSSP lllleeeeeelllleeeelEEEEeELHH---hhllLHHHHHHHHHLLLEeEEEELLHH-- DSSP llllllhhhhhhhhhhhhhlLLHHHHHHHHHHHHHHL-lLLLEEEEELHHH-------hh Query dpladgptiqnanlrafaagVTPAQCFEMLALIREKH-pTIPIGLLMYANL-------vf 107 ident | | | Sbjct -----------------fgnVHGVDGVRWAAKAIENLplRAILLAPSCVPSapglergga 158 DSSP -----------------hhhHHLHHHHHHHHHHHLLLllEEEEEELLLLLLlllllllll DSSP LLLHHHHHHHHHHHLLLEE-EELL--LLHHH---LHHHHHHHHHLLLEEEEEELlLLLHH Query NNGIDAFYARCEQVGVDSV-LVAD--VPVEE---SAPFRQAALRHNIAPIFICPpNADDD 161 ident | || | Sbjct DFDAAILADLLSWPEIGGIaEIXNxrGVIERdprXSGIVQAGLAAEKLVCGHAR-GLKNA 217 DSSP LLLHHHHHHHHLLLLEEEEeEELLhhHHHLLlhhHHHHHHHHHHHLLEEEELLL-LLLHH DSSP HHHHHH-HHLLllEEEL---lLLHHHHHHHHhhhllLLEEELllLLLHHH--------hh Query LLRQVA-SYGRgyTYLL---aLPLHHLIEKLkeyhaAPALQGfgISSPEQ--------vs 209 ident | | | Sbjct DLNAFXaAGVS--SDHElvsgEDLXAKLRAG-----LTIELR--GSHDHLlpefvaalnt 268 DSSP HHHHHHhLLLL--EELLlllhHHHHHHHHLL-----LEEEEE--LLLHHHhhhhhhhhhh DSSP hhhHHLLLEEEELLhHHHHhhhllllhhhhhHHHHhhHHHHHHLLL-------------- Query aavRAGAAGAISGSaIVKIieknlaspkqmlAELRsfVSAMKAASR-------------- 255 ident Sbjct lghLPQTVTLCTDD-VFPD----------dlLQGG-gLDDVVRRLVryglkpewalraat 316 DSSP hllLLLLEEEELLL-LLHH----------hhHHLL-lHHHHHHHHHhllllhhhhhhhhl DSSP ------------------------------------------------------------ Query ------------------------------------------------------------ 255 ident Sbjct lnaaqrlgrsdlgliaagrradivvfedlngfsarhvlasgravaeggrxlvdiptcdtt 376 DSSP hhhhhhhllllllllllllllleeeellllllleeeeeelleeeeelleelllllllllh DSSP ------------------------------------------------------------ Query ------------------------------------------------------------ 255 ident Sbjct vlkgsxklplrxandflvksqgakvrlatidrprftqwgeteadvkdgfvvppegatxis 436 DSSP hhllllllllllhhhhllllllleeeeeeeellllleeeeeeeeeelleellllleeeee DSSP ------------------------------------------------------------ Query ------------------------------------------------------------ 255 ident Sbjct vthrhgxaepttktgfltgwgrwngafattvshdshnltvfggnagdxalaanavigtgg 496 DSSP eellllllllleeeeeeellllllleeeelllllllleeeeellhhhhhhhhhhhhhlll DSSP ------------------------------------------------------------ Query ------------------------------------------------------------ 255 ident Sbjct gxavasegkvtailplplsglvsdapleevarafedlreavgkvvewqppylvfkacfga 556 DSSP eeeeeelleeeeeeelllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllllllhhhhhll DSSP ------------------------------- Query ------------------------------- 255 ident Sbjct tlacnigphqtdxgiadvltgkvxespviev 587 DSSP lllllllleelllleeelllleeellleeel
DSSP lhhhhhhhhhhhhlllLEEE-EEEE----------------------------------- Query meryenlfaqlndrreGAFV-PFVT----------------------------------- 24 ident Sbjct ---------tpafnkpKVELhVHLDgaikpetilyfgkkrgialpadtveelrniigmdk 51 DSSP ---------lllllllEEEEeEEHHhlllhhhhhhhhhhhllllllllhhhhhhhhllll DSSP ----------------llllLHHHHHHHHHHHHHLL------lLLEEEELLL-------L Query ----------------lgdpGIEQSLKIIDTLIDAG------aDALELGVPF-------S 55 ident | | Sbjct plslpgflakfdyympviagCREAIKRIAYEFVEMKakegvvyVEVRYSPHLlanskvdP 111 DSSP lllhhhhhllhhhhhhhhllLHHHHHHHHHHHHHHHhhlleeeEEEEELLHHhllllllL DSSP LLLlllhhhhhhhhhhhHHLLLHHHHHHHHHHHHHHLL-----LLLEEEEEL---HHHHH Query DPLadgptiqnanlrafAAGVTPAQCFEMLALIREKHP-----TIPIGLLMY---ANLVF 107 ident | ||| | Sbjct MPW-----------nqtEGDVTPDDVVDLVNQGLQEGEqafgiKVRSILCCMrhqPSWSL 160 DSSP LHH-----------hllLLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHhhhllEEEEEEEEElllHHHHH DSSP lllhhhHHHHHHHHL---LLEEEELL-----lLHHH--LHHHHHHHHHLLLEEEEEELLL Query nngidaFYARCEQVG---VDSVLVAD-----vPVEE--SAPFRQAALRHNIAPIFICPPN 157 ident | | | | | Sbjct -----eVLELCKKYNqktVVAMDLAGdetiegSSLFpgHVEAYEGAVKNGIHRTVHAGEV 215 DSSP -----hHHHHHHHLLlllEEEEEEELllllllHHHLhhHHHHHHHHHHHLLEEEEEELLL DSSP LLHHHHHHHHH--HLLLlEEEL--lLLHHHHHHHHHHHLLlLEEELLLL-----llhhhh Query ADDDLLRQVAS--YGRGyTYLL--aLPLHHLIEKLKEYHAaPALQGFGI-----sspeqv 208 ident | | | Sbjct GSPEVVREAVDilKTER-VGHGyhtIEDEALYNRLLKENM-HFEVCPWSsyltgawdpkt 273 DSSP LLHHHHHHHHHllLLLE-EEELhhhHHLHHHHHHHHHLLL-EEEELHHHhhhllllllll DSSP hHHHHHL-----lLEEEELLHHHHHhhhllllhhhhhhhhhhhhhhHHHL---------- Query sAAVRAG-----aAGAISGSAIVKIieknlaspkqmlaelrsfvsaMKAA---------- 253 ident || Sbjct tHAVVRFkndkanYSLNTDDPLIFK--------------------sTLDTdyqmtkkdmg 313 DSSP lLHHHHHhhllllEEELLLLLLLLL--------------------lLHHHhhhhhhhlll DSSP ----------------------------------ll Query ----------------------------------sr 255 ident Sbjct fteeefkrlninaakssflpeeekkellerlyreyq 349 DSSP llhhhhhhhhhhhhhlllllhhhhhhhhhhhhhhll
DSSP --------------------------------------lhhhhhhhhhhhhllllEEEEE Query --------------------------------------meryenlfaqlndrregAFVPF 22 ident Sbjct skdfdliirnaylsekdsvydigivgdriikieakiegtvkdeidakgnlvspgfVDAHT 60 DSSP llleeeeeeeeeelllleeeeeeeelleeeeeelllllleeeeeellllleeeleEEEEE DSSP EELLLLL-----------------------------------HHHHHHHHHHHHHLLL-L Query VTLGDPG-----------------------------------IEQSLKIIDTLIDAGA-D 46 ident | Sbjct HMDKSFTstgerlpkfwsrpytrdaaiedglkyyknatheeiKRHVIEHAHMQVLHGTlY 120 DSSP LHHHLLLlllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhllhhhhHHHHHHHHHHHHHLLEeE DSSP LEEEELlllllllllhhhhhhhhhhhhhllLHHHHHHHHHHHHHHLL---LLLEEEE-EL Query ALELGVpfsdpladgptiqnanlrafaagvTPAQCFEMLALIREKHP---TIPIGLL-MY 102 ident | | | Sbjct TRTHVD--------------------vdsvAKTKAVEAVLEAKEELKdliDIQVVAFaQS 160 DSSP EEEEEE--------------------llllLLLHHHHHHHHHHHHLLlllEEEEEEElLL DSSP HHhhHLLLHhHHHHHHHHHLLLEEEELLL-----LHHH-LHHHHHHHHHLLLEEEE-EEL Query ANlvFNNGIdAFYARCEQVGVDSVLVADV-----PVEE-SAPFRQAALRHNIAPIF-ICP 155 ident | | | | || | | Sbjct GFfvDLESE-SLIRKSLDMGCDLVGGVDPatrenNVEGsLDLCFKLAKEYDVDIDYhIHD 219 DSSP LLllLLLHH-HHHHHHHHHLLLEEELLLLlllllLHHHhHHHHHHHHHHLLLEEEEeELL DSSP LLLL-hHHHHHHHHH-------lLLLEEEL-------LLLHHHHhHHHHHHLLLLEEELl Query PNAD-dDLLRQVASY-------gRGYTYLL-------ALPLHHLiEKLKEYHAAPALQGf 200 ident | | | | | Sbjct IGTVgvYSINRLAQKtiengykgRVTTSHAwcfadapSEWLDEA-IPLYKDSGMKFVTC- 277 DSSP LHHHhhHHHHHHHHHhhhlllllLEEEEELlhhhhllHHHHHHH-HHHHHHHLLEEEEE- DSSP lLLLHhhhhHHHHHL-----LLEEEELLH---hHHHHhhllllhhhhhhhhhhHHHHHHH Query gISSPeqvsAAVRAG-----AAGAISGSA---iVKIIeknlaspkqmlaelrsFVSAMKA 252 ident || | | | | Sbjct -FSST-pptMPVIKLleagiNLGCASDNIrdfwVPFG--------------ngDMVQGAL 321 DSSP -LLLL-lllLLHHHHhhlllEEEEELLLLllllLLLL--------------llLHHHHHH DSSP LLL--------------------------------------------------------- Query ASR--------------------------------------------------------- 255 ident Sbjct IETqrlelktnrdlgliwkmitsegarvlgieknygievgkkadlvvlnslspqwaiidq 381 DSSP HHHhhhllllhhhhhhhhhhhlhhhhhhhllhhhlllllllllleeeellllhhhhhhhl DSSP --------------------- Query --------------------- 255 ident Sbjct akrlcvikngriivkdeviva 402 DSSP lleeeeeelleeeeelleell
DSSP -lhhhhhhhhhhHHLL-------------------------------------------- Query -meryenlfaqlNDRR-------------------------------------------- 15 ident Sbjct sktiiknigkivSGDIkspvlqadtivvedgliaaiggeelmkdagdatiidaagstvtp 60 DSSP leeeeellleeeLLLLllleellleeeeelleeeeeelhhhhlllllleeeelllleeee DSSP llEEEEEEELllllhhhHHHH-----hhHHHHLL-----lLLEE-EELLllllllllhhh Query egAFVPFVTLgdpgieqSLKI-----idTLIDAG-----aDALE-LGVPfsdpladgpti 64 ident | Sbjct glLDTHVHVS-------GGDYaprqktmDFISSAlhggvtTMISaGSPH----------- 102 DSSP leEEEEELLL-------LLLEehhhleeLHHHHHhllleeEEEElLLLL----------- DSSP hhhhhhhhhHLLL------hhhhHHHHHHHHHHL---lLLLEeEEELHHHHhlllHHHHH Query qnanlrafaAGVT------paqcFEMLALIREKH---pTIPIgLLMYANLVfnngIDAFY 115 ident | Sbjct --------fPGRPkdaagtkalaITLSKSYYNARpagvKVHGgAVILEKGL----TEEDF 150 DSSP --------lLLLLllhhhhhhhhHHHHHHHHHLLhhhlEEELlEELLLLLL----LHHHH DSSP HHHHHHLLLEEE---eLLLL-HHHLHHHHHHHHHLLLEEEEEELL------LLLHhhHHH Query ARCEQVGVDSVL---vADVP-VEESAPFRQAALRHNIAPIFICPP------NADDdlLRQ 165 ident || | | || | | Sbjct IEMKKEGVWIVGevglGTIKnPEDAAPMVEWAHKHGFKVQMHTGGtsipgsSTVT--ADD 208 DSSP HHHHHLLLLEEEeellLLLLlHHHHHHHHHHHHHLLLEEEEELLLllllllLLLL--HHH DSSP HHHHLLLLEEEL----lllHHHHHHHHHHHLLLLEEELLLLllhhhhhhHHHHL------ Query VASYGRGYTYLL----alpLHHLIEKLKEYHAAPALQGFGIsspeqvsaAVRAG------ 215 ident | Sbjct VIKTKPDVVSHInggptaiSVQEVDRIMDETDFAMEIVQCG-----npkIADYVarraae 263 DSSP HHHHLLLEEELLlllllllLHHHHHHHHHHLLLEEEEELLL-----lhhHHHHHhhhhhh DSSP -----lLEEEELLhHHHHhhhllllhhhhhhhhhhhHHHHHHLLL--------------- Query -----aAGAISGSaIVKIieknlaspkqmlaelrsfVSAMKAASR--------------- 255 ident Sbjct kgqlgrVIFGNDA-PSGT----------------glIPLGILRNMcqiasmsdidpevav 306 DSSP hllhhhEEEELLL-LLLL----------------llLLLHHHHHHhhhhhhllllhhhhh DSSP ------------------------------------------------------------ Query ------------------------------------------------------------ 255 ident Sbjct cmatgnstavyglntgviapgkeadliimdtplgsvaedamgaiaagdipgisvvlidge 366 DSSP hhhlhhhhhhhlllllllllllllleeeeelllllllllhhhhhhhlllleeeeeeelle DSSP ------------------- Query ------------------- 255 ident Sbjct avvtksrntppakraakil 385 DSSP eeellllllllllllleel
DSSP -------------------------------------lhhhhhhhhhhhHLLLlEEEEEE Query -------------------------------------meryenlfaqlnDRREgAFVPFV 23 ident Sbjct pllikngeiitadsrykadiyaegetitrigqnleappgtevidatgkyVFPGfIDPHVH 60 DSSP leeeelleeeelleeeeleeeelllllleeellllllllleeeelllleEEELeEEEEEL DSSP eLLLLlhhhhhHHHH-HHHHLL------lLLEEEELLLLllllllhhhhhhhhhhhhhll Query tLGDPgieqslKIID-TLIDAG------aDALELGVPFSdpladgptiqnanlrafaagv 76 ident | | | Sbjct iYLPF-matfaKDTHeTGSKAAlmggtttYIEMCCPSRN--------------------d 99 DSSP lLLEE-lleelLLLHhHHHHHHhhlleeeEEEEELLLLL--------------------l DSSP LHHHHHHHHHHHHHHL--lLLLEEEEELHhhHHLLlHHHHHHHHHHHLLLEEEEL----- Query TPAQCFEMLALIREKH--pTIPIGLLMYAnlVFNNgIDAFYARCEQVGVDSVLVA----- 129 ident | | | Sbjct DALEGYQLWKSKAEGNsycDYTFHMAVSK--FDEK-TEGQLREIVADGISSFXIFlsykn 156 DSSP LHHHHHHHHHHHHLLLlllEEEEEEELLL--LLLL-HHHHHHHHHHLLLLEEEEEellll DSSP --LLLHHHLHHHHHHHHHLLLEEEEEEL-----------------------------lLL Query --DVPVEESAPFRQAALRHNIAPIFICP-----------------------------pNA 158 ident | | | | Sbjct ffGVDDGEMYQTLRLAKELGVIVTAHCEnaelvgrlqqkllsegktgpewhepsrpeaVE 216 DSSP llLLLHHHHHHHHHHHHHHLLEEEEEELlhhhhhhhhhhhhhlllllhhhllllllhhHH DSSP LHhHHHHHHHHL-----LLLEEELlllHHHHHHHHHHHL----lLLEEELllLLLHH--- Query DDdLLRQVASYG-----RGYTYLLalpLHHLIEKLKEYH----aAPALQGfgISSPE--- 206 ident | || | | Sbjct AE-GTARFATFLettgaTGYVVHL--sCKPALDAAMAAKargvpIYIESV--IPHFLldk 271 DSSP HH-HHHHHHHHHhhhllEEEELLL--lLHHHHHHHHHHHhllllEEEEEE--HHHHHllh DSSP --------------------------hhHHHHH-HLLLEEEELlhHHHHhhhLLLLH--- Query --------------------------qvSAAVR-AGAAGAISGsaIVKIiekNLASP--- 236 ident | Sbjct tyaerggveamkyimspplrdkrnqkvlWDALAqGFIDTVGTD--HCPF---DTEQKllg 326 DSSP hhhhllhhhhhlllllllllllhhhhhhHHHHHlLLLLEEELL--LLLL---LHHHHhhh DSSP ---hhhhhhhhhHHHHHHHLLL-------------------------------------- Query ---kqmlaelrsFVSAMKAASR-------------------------------------- 255 ident Sbjct keaftaipngipAIEDRVNLLYtygvsrgrldihrfvdaastkaaklfglfprkgtiavg 386 DSSP lllhhhllllllLLLLHHHHHHhhhlllllllhhhhhhhhlhhhhhhlllllllllllll DSSP ------------------------------------------------------------ Query ------------------------------------------------------------ 255 ident Sbjct sdadlvvydpqyrgtisvktqhvnndyngfegfeidgrpsvvtvrgkvavrdgqfvgekg 446 DSSP lllleeeeelllleellhhhllllllllllllleelleeeeeeelleeeeelleelllll DSSP ------------ Query ------------ 255 ident Sbjct wgkllrrepmyf 458 DSSP llllllllllll
DSSP lhhhhhhhhhhHHLL----------------------------------------lleEE Query meryenlfaqlNDRR----------------------------------------egaFV 20 ident Sbjct htprlltcdvlYTGAqspggvvvvgetvaaaghpdelrrqyphaaeeragaviapppvNA 60 DSSP lleeeeeeleeELLEelleeeeeelleeeeeelhhhhhhhlllleeeellleelllllEE DSSP EEEEL-----------------------lLLLHHHHHHHHHHHHHLL-LLLEEEELllll Query PFVTL-----------------------gDPGIEQSLKIIDTLIDAG-ADALELGVpfsd 56 ident | ||| | Sbjct HTHLDmsayefqalpyfqwipevvirgrhLRGVAAAQAGADTLTRLGaGGVGDIVW---- 116 DSSP EEELLllhhhhhhlhhhhllhhhhhhhllLLHHHHHHHHHHHHHHLLlLLEEEEEL---- DSSP lllllhhhhhhhhhhhhhlllHHHHHHHHHHhHHHLllLLEEEEELHH------hhHLLL Query pladgptiqnanlrafaagvtPAQCFEMLALiREKHptIPIGLLMYAN------lvFNNG 110 ident | || | Sbjct ---------------------APEVMDALLA-REDL--SGTLYFEVLNpfpdkadeVFAA 152 DSSP ---------------------LHHHHHHHHL-LLLL--LEEEEEEELLllhhhhhhHHHH DSSP HHHHHHHHHHHL----LLEEEEL---LLLHHHLHHHHHHHHHLLLEEEEEEL-------- Query IDAFYARCEQVG----VDSVLVA---DVPVEESAPFRQAALRHNIAPIFICP-------- 155 ident | | | Sbjct ARTHLERWRRLErpglRLGLSPHtpfTVSHRLMRLLSDYAAGEGLPLQIHVAehptelem 212 DSSP HHHHHHHHHLLLllleEEEEEELlllLLLHHHHHHHHHHHHHHLLLLEEEELllhhhhhh DSSP --------------------------------llLLHHHHH-HHHHHLLlLEEELllLHH Query --------------------------------pnADDDLLR-QVASYGRgYTYLLalPLH 182 ident | | Sbjct frtgggplwdnrmpalyphtlaevigrepgpdltPVRYLDElGVLAARP-TLVHMvnVTP 271 DSSP hhhlllllhhhllhhhllllhhhhhlllllllllHHHHHHHhLLHHHLL-EEEELllLLH DSSP HHHHHHHHHLlLLEEELlLLLL-hhhhhHHHHHL-----lLEEEELLhHHHHhhhllllh Query HLIEKLKEYHaAPALQGfGISS-peqvsAAVRAG-----aAGAISGSaIVKIieknlasp 236 ident | | | Sbjct DDIARVARAG-CAVVTCpRSNHhlecgtFDWPAFaaagveVALGTDS-VASG-------- 321 DSSP HHHHHHHHHL-LLEEELhHHHHhlllllLLHHHHhhllllEEELLLL-HHHH-------- DSSP hhhhhhhhhHHHHHHHLLL----------------------------------------- Query kqmlaelrsFVSAMKAASR----------------------------------------- 255 ident | | Sbjct ------etlNVREEVTFARqlypgldprvlvraavkggqrvvgtpflrrgetwqegfrwe 375 DSSP ------lllLLHHHHHHHHhhlllllhhhhhhhhhhhhhhhhllllllllllllhhhlhh DSSP ----- Query ----- 255 ident Sbjct lsrdl 380 DSSP hllll
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DSSP lhhhhhhhhhhHHLLllEEEEEEEL---LLLLHHH---------hhhhhhHHHHLL---- Query meryenlfaqlNDRRegAFVPFVTL---GDPGIEQ---------slkiidTLIDAG---- 44 ident | | | Sbjct -dffrdeaeriMRDSpvIDGHNDLPwqlLDMFNNRlqderanlttlagthTNIPKLragf 59 DSSP -lhhhhhhhhhHLLLleEEEEELHHhhhHHHHLLLlllhhhlllllllllLLHHHHhhll DSSP -lLLEEE-ELLLLLLllllhhhhhhhhhhhhhllLHHHHHHHHHHHHH-----HLLL--- Query -aDALEL-GVPFSDPladgptiqnanlrafaagvTPAQCFEMLALIRE-----KHPT--- 94 ident | Sbjct vgGQFWSvYTPCDTQ-------------nkdavrRTLEQMDVVHRMCRmypetFLYVtss 106 DSSP eeEEEEEeLLLHHHL-------------lllhhhHHHHHHHHHHHHHHhllllEEELllh DSSP -------------LLEEEEElHHHHHllLHHHHHHHHHHHLLLEEEEL------------ Query -------------IPIGLLMyANLVFnnGIDAFYARCEQVGVDSVLVA------------ 129 ident || | | Sbjct agirqafregkvaSLIGVEG-GHSID--SSLGVLRALYQLGMRYLTLThscntpwadnwl 163 DSSP hhhhhhhhllleeEEEEEEL-HHHLL--LLHHHHHHHHHLLEEEEELLllllllllllhh DSSP ---------llLHHH-LHHHHHHHHHLLLEEEEEelllllhhHHHHHHHHL--LLLEEEL Query ---------dvPVEE-SAPFRQAALRHNIAPIFIcppnadddLLRQVASYG--RGYTYLL 177 ident | Sbjct vdtgdsepqsqGLSPfGQRVVKELNRLGVLIDLA---hvsvaTMKATLQLSraPVIFSHS 220 DSSP hllllllllllLLLHhHHHHHHHHHHHLLEEELL---lllhhHHHHHHHHLllLLEELLL DSSP ---------lllHHHHHHHHHHhLLLLEEELLL--------llLHHHHHHHHHHL----- Query ---------alpLHHLIEKLKEyHAAPALQGFG--------isSPEQVSAAVRAG----- 215 ident | | || Sbjct saysvcasrrnvPDDVLRLVKQ-TDSLVMVNFYnnyisctnkaNLSQVADHLDHIkevag 279 DSSP llllllllllllLHHHHHHHHH-HLLEEEELLLhhhhllllllLHHHHHHHHHHHhhhll DSSP --lLEEEELLhHHHHhhhllllhhhhhhhhhHHHHHhHHLLL------------------ Query --aAGAISGSaIVKIieknlaspkqmlaelrSFVSAmKAASR------------------ 255 ident | || Sbjct araVGFGGDF-DGVP----------rvpeglEDVSK-YPDLIaellrrnwteaevkgala 327 DSSP hhhEEELLLL-LLLL----------llllllLLLLL-HHHHHhhhhhllllhhhhhhhhl DSSP ------------------------------------------ Query ------------------------------------------ 255 ident Sbjct dnllrvfeaveqasnltqapeeepipldqlggscrthygyss 369 DSSP hhhhhhhhhhhhllllllllllllllhhhlllllllllllll
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DSSP ----------------------------------------------lhhhhhhhhhhhhl Query ----------------------------------------------meryenlfaqlndr 14 ident Sbjct midytaagftllqgahlyapedrgicdvlvangkiiavasnipsdivpnctvvdlsgqil 60 DSSP llllhhhlleeeeeeeeellleeeeeeeeeelleeeeeellllllllllleeeellllee DSSP llleeEEEEELLL-------llhhHHHHhHHHHHHLLLLLEEEEL--LLLLlllllhhhh Query regafVPFVTLGD-------pgieQSLKiIDTLIDAGADALELGV--PFSDpladgptiq 65 ident | | | || Sbjct cpgfiDQHVHLIGgggeagpttrtPEVA-LSRLTEAGVTSVVGLLgtDSIS--------- 110 DSSP eeleeEEEELLLLllllllhhhllLLLL-HHHHHHLLEEEEEELLllLLLL--------- DSSP hhhhhhhhhlLLHHHHHHHHHHHHHHLllLLEEEEE---lHHHHhLLLHHHHHHHHhhHL Query nanlrafaagVTPAQCFEMLALIREKHptIPIGLLM---yANLVfNNGIDAFYARCeqVG 122 ident | | | | Sbjct ----------RHPESLLAKTRALNEEG-iSAWMLTGayhvPSRTiTGSVEKDVAII--DR 157 DSSP ----------LLHHHHHHHHHHHHHHL-lEEEEEEEllllLLLLlLLLHHHHHHHL--LL DSSP LLEEEEL------llLHHH-LHHHHHHHHHLL------LEEEEEELLLLLhhhHHHH--- Query VDSVLVA------dvPVEE-SAPFRQAALRHN------IAPIFICPPNADddlLRQV--- 166 ident | | | | | | | Sbjct VIGVXCAisdhrsaaPDVYhLANMAAESRVGGllggkpGVTVFHMGDSKK--aLQPIydl 215 DSSP EEEEEEEelllllllLLHHhHHHHHHHHHHHHhhhlllLEEEEEELLLLL--lLHHHhhh DSSP ------hHHLLlLEEEL--lLLHHHHHHHHHHHLLlLEEELlLLLL-hhHHHHHHHHL-- Query ------aSYGRgYTYLL--aLPLHHLIEKLKEYHAaPALQGfGISS-peQVSAAVRAG-- 215 ident || Sbjct lencdvpISKL-LPTHVnrnVPLFEQALEFARKGG-TIDIT-SSIDepvAPAEGIARAvq 272 DSSP hhlllllHHHE-EEELHhhlHHHHHHHHHHHHLLL-LEEEE-LLLLlllLHHHHHHHHhh DSSP ------lLEEEELLhHHHHhhhllllhhhhhhhhhhhHHHHHHLLL-------------- Query ------aAGAISGSaIVKIieknlaspkqmlaelrsfVSAMKAASR-------------- 255 ident | Sbjct agiplarVTLSSDG-NGSQ--pffddegnlthigvagFETLLETVQvlvkdydfsisdal 329 DSSP llllhhhEEEELLL-LLEE--eeellllleeeeeellLHHHHHHHHhhhhhhlllhhhhh DSSP ------------------------------------------------------------ Query ------------------------------------------------------------ 255 ident Sbjct rpltssvagflnltgkgeilpgndadllvmtpelrieqvyargklmvkdgkacvkgtfet 389 DSSP hhhlhhhhhhlllllllllllllllleeeellllleeeeeelleeeeelleellllllll DSSP - Query - 255 ident Sbjct d 390 DSSP l
DSSP lhhhhhhhhhhhhllllEEEEEEELLL--------------------------------- Query meryenlfaqlndrregAFVPFVTLGD--------------------------------- 27 ident Sbjct -smtqdlktggeqgylrIATEEAFATReiidvylrmirdgtadkgmvslwgfyaqspser 59 DSSP -llllllllllllllllEEEEEEELLHhhhhhhhhhhhhllllhhhhhhhhhhhhlllhh DSSP ----llhhHHHH-HHHHHHH--LLLLLEEEE---LLLLLlllllhhhhhhhhhhhhhllL Query ----pgieQSLK-IIDTLID--AGADALELG---VPFSDpladgptiqnanlrafaagvT 77 ident | | | Sbjct atqilerlLDLGeRRIADMDatGIDKAILALtspGVQPL------------hdldeartL 107 DSSP hhhhhhhhHLLLhHHHHHHHhlLLLEEEEEElllLLLLL------------llhhhhhhH DSSP HHHHHHHHHHHHHHLLL-LLEEEEELHHHHHllLHHHHHHHHH-HHLLLEEEELLL---- Query PAQCFEMLALIREKHPT-IPIGLLMYANLVFnnGIDAFYARCE-QVGVDSVLVADV---- 131 ident || | | | | Sbjct ATRANDTLADACQKYPDrFIGMGTVAPQDPE--WSAREIHRGArELGFKGIQINSHtqgr 165 DSSP HHHHHHHHHHHHHHLLLlEEELLLLLLLLHH--HHHHHHHHHHhLLLLLLEEELLLllll DSSP LHHH--LHHHHHHHHHLLLEEEEE----------------------eLLLL-lhhHHHHH Query PVEE--SAPFRQAALRHNIAPIFI----------------------cPPNA-dddLLRQV 166 ident | | | ||| Sbjct YLDEefFDPIFRALVEVDQPLYIHpatspdsmidpmleagldgaifgFGVEtgmhLLRLI 225 DSSP LLLLhhHHHHHHHHHHHLLLEEELlllllllllhhhhhhlllllllhHHHHhhhhHHHHH DSSP -------hhhlLLLEEEllllhhHHHHH-------------------------hhHHLL- Query -------asygRGYTYLlalplhHLIEK-------------------------lkEYHA- 193 ident | | Sbjct tigifdkypslQIMVGH---mgeALPYWlyrldymhqagvrsqryermkplkktiEGYLk 282 DSSP hhlhhhhllllLEEELH---hhhLHHHHhhhhhhhhhhhhhlllllllllllllhHHHHh DSSP --LLEEELLllllhhHHHH-HHHHL-------lLEEEELLHHhhhhhhllllhhhhhhhh Query --APALQGFgisspeQVSA-AVRAG-------aAGAISGSAIvkiieknlaspkqmlael 243 ident | Sbjct snVLVTNSG------VAWEpAIKFCqqvmgedrVMYAMDYPY------------------ 318 DSSP hlEEEELLL------LLLHhHHHHHhhhhlhhhEELLLLLLL------------------ DSSP hhHHHHHHHLLL----------------------- Query rsFVSAMKAASR----------------------- 255 ident | | Sbjct -qYVADEVRAMDamdmsaqtkkkffqtnaekwfkl 352 DSSP -lLLHHHHHHHHlllllhhhhhhhhlhhhhhhlll
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